در این پژوهش ساختار ژنتیکی جمعیت های ماهی قباد با استفاده از پنج جفت نشانگر ریزماهواره بررسی گردید. ماهی قباد از چهار ایستگاه بندر لنگه، بندر دیر، بندر بوشهر و بندر آبادان در سواحل شمالی خلیج فارس جمع آوری شد. در این مطالعه از 160 نمونه ماهی قباد جهت تعیین اختلاف ژنتیکی با استفاده از پنج جایگاه (D61sc, H96c, C83c, J43Sc, L42Sc,) استفاده گردید. واکنش PCR با تمام آغازگرها انجام شد و همه پنج جایگاه در هر چهار جمعیت چندشکل بودند. تمامی جایگاه های ژنی مورد بررسی در هر چهار جمعیت در این مطالعه خارج از تعادل هاردی-واینبرگ بودند ( .(P<0.001اختلاف ژنتیکی توسط شاخص Fst برای تخمین ساختار ذخایر اندازه گیری گردید. بر اساس آزمونAMOVA ، اختلاف درون جمعیت ها 97%، اختلاف بین جمعیت ها 2% و اختلاف بین مناطق 1% محاسبه گردید که اختلاف کمی را میان جمعیت ها نشان داد. نتایج نشان می دهند که احتمالا یک جمعیت از ماهی قباد در ایستگاه های نمونه برداری شده وجود دارد.