رودخانه چالوس از ارتفاعات البرز سرچشمه گرفته و در شهر چالوس به دریای خزر می ریزد. در سال 1371 تا 1372، 5 ایستگاه در مناطق مختلف رودخانه انتخاب و 21 فاکتور فیزیکی و شیمیایی اندازه گیری گردید. دامنه تغییرات سختی کل، از ایستگاه 1 به سمت مصب رودخانه روند کاهشی داشته ولی میزان فسفات، یون آمونیم و نیترات روند افزایشی را نشان دادند. طی بررسی های انجام شده، 45 جنس فیتوپلانکتون متعلق به 4 شاخه شامل Euglenophyta، Chlorophyta،Chrysophyta و Cyanophyta شناسایی شدند. نمونه های زئوپلانکتون در 8 رده جانوری قرار می گیرند که رده های Sarcodina و Monogononta (روتیفرا) فراوانی بیشتری داشتند. موجودات کفزی رودخانه را بیشتر لارو حشرات از راسته هایDiptera ، Coleoptera، Plecoptera،Odonata و Ephemeroptera تشکیل می دادند. ماهیان رودخانه به 4 خانواده، 10 جنس و 12 گونه تعلق داشته و خانواده کپور ماهیان (CYPRINIDAE) 66.7 درصد از ترکیب گونه ای را به خود اختصاص داده و بیشترین میزان پراکنش را در ایستگاههای مختلف داشته اند.