Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله طرح

مشخصات مقاله

شرکت دانش‌بنیان متقاضی: شتاب دهنده زیست بوم کارآفرینی امید ایرانیان
تاریخ پایان: شهریور 1400

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

14
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

1
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات طرح

عنوان

طراحی پنل اختصاصی به منظور غربالگری ژنومیک افراد پرخطر در ابتلا به ویروس 19-COVID در ایران با استفاده از توالی یابی و تحلیل ژنومیک میزبان انسانی

نهاد حامی

 صندوق نوآوری و شکوفایی ریاست جمهوری

صفحات

 صفحه شروع | صفحه پایان

چکیده

 "بیماری کرونا, ناشی از SARS-CoV-2, عمدتاً از طریق قطره های تنفسی گسترش می یابد و دستگاه تنفسی انسان را هدف قرار می دهد. باتوجه به ضرورت مطالعه زمینه ژنتیکی افراد, برای شناسایی پنل های غربالگری ژنومیک مرتبط با تعیین میزان مقاومت, حساسیت و نیز شدت ابتلا به بیماری و نیز توسعه هوشمند راهکارهای پیشگیری و مدیریت درمان, استفاده از روش های اختصاصی توالی یابی با کارایی بالا (WGS) بر روی پلتفرم DNBSeq و الگوریتم های اختصاصی توسعه یافته بر پایه یادگیری ماشین گزینه مطلوبی جهت رسیدن به این اهداف است. در این پروژه ابتدا داده های مربوط به 100 نمونه مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. پس از بهینه سازی مراحل آنالیز داده ها, توزیع کروموزومی واریانت ها بعد از توسعه پنل ژنومیک به دست آمدکه تعداد 14, 489 واریانت برای پنل نهایی غربالگری شناسایی شدند. با توجه به تنوع فنوتیپی نمونه های مربوط به گروه های کم خطر, تعداد واریانت ها و نیز تعداد موارد چندشکلی این گروه در مقایسه با گروه افراد پر خطر بیشتر بود. در این طرح, علاوه بر شناسایی پنل غربالگری ژنومیک, با استفاده از روش های محاسباتی و آماری, ترکیب پنل مرجع توسعه یافته و آنالیزGene Set Enrichment نیز برای درک بهتر کارایی پنل انجام شد. بررسی ژن های پنل نشان دادند, 20 ژنی که بیشترین تعداد SNP در آن ها وجود دارد از خانواده ncRNA هایی هستند که اغلب در فرآیند های تنظیمی سیستم ایمنی نقش دارند. با توجه به نتایج به دست آمده, توسعه پنل ژنومیک مرتبط, درک ماهیت این پنل و نقش اساس ژنتیکی میزان حساسیت به COVID-19 در سطح سلولی, می تواند در آینده به توسعه واکسن ها و تدوین اقدامات کنترلی برای سایر بیماری های ویروسی و پاندمی های احتمالی کمک کند. همچنین, این نتایج نشان داد که آگاهی از تنوع موجود در توالی کل ژنوم, می تواند عوامل ژنتیکی موثر در دامنه گسترده واکنش به بیماری های ویروسی را شناسایی کرده و در مدیریت و درمان نقش موثری ایفا کند. "

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    عارف نژادفرد، بابک، خیردیده، منیره، و سعدی پور، غزال. (شهریور 1400). طراحی پنل اختصاصی به منظور غربالگری ژنومیک افراد پرخطر در ابتلا به ویروس 19-COVID در ایران با استفاده از توالی یابی و تحلیل ژنومیک میزبان انسانی. تهران، ایران: صندوق نوآوری و شکوفایی ریاست جمهوری. https://sid.ir/paper/1134774/fa

    Vancouver: کپی

    عارف نژادفرد بابک، خیردیده منیره، سعدی پور غزال. [Internet]. طراحی پنل اختصاصی به منظور غربالگری ژنومیک افراد پرخطر در ابتلا به ویروس 19-COVID در ایران با استفاده از توالی یابی و تحلیل ژنومیک میزبان انسانی. تهران، ایران: صندوق نوآوری و شکوفایی ریاست جمهوری؛ شهریور 1400. Available from: https://sid.ir/paper/1134774/fa

    IEEE: کپی

    بابک عارف نژادفرد، منیره خیردیده، و غزال سعدی پور، “طراحی پنل اختصاصی به منظور غربالگری ژنومیک افراد پرخطر در ابتلا به ویروس 19-COVID در ایران با استفاده از توالی یابی و تحلیل ژنومیک میزبان انسانی،” ایران، صندوق نوآوری و شکوفایی ریاست جمهوری، شهریور 1400. [Online]. Available: https://sid.ir/paper/1134774/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.

    • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا