مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,314
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

627
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

مطالعه روابط ژنتیکی برخی از گونه های مرکبات با استفاده از ریزماهواره های (EST-SSR) شناسایی شده از توالی یابی ترنسکریپتوم کلمانتین

صفحات

 صفحه شروع 289 | صفحه پایان 298

چکیده

 نشانگرهای ریزماهواره در بررسی تکامل نژادی و تهیه نقشه های ژنی و لینکاژی نقش موثری دارند. در سال های اخیر مطالعات بسیاری برای شناسایی نشانگرهای ریزماهواره (با مبدا ژنوم یا ترنسکریپتوم) در گونه های مختلف مرکبات با استفاده از روش های متداول انجام شده است. در این مطالعه برای اولین بار از داده های بدست آمده از توالی یابی عمیق ترنسکریپتوم نارنگی کلمانتین (Citrus clementina) برای شناسایی مکان های ریزماهواره در مرکبات استفاده شد. به منظور ارزیابی کارآیی ریزماهواره های بدست آمده از این روش در مطالعات روابط فیلوژنی, برای تعدادی از این مکان ها آغازگر طراحی و الگوی باندی آن ها در 34 ژنوتیپ مرکبات بررسی شد. در مجموع 9082 مکان ریزماهواره از 75659 یونی ژن بدست آمده از توالی یابی عمیق ترنسکریپتوم نارنگی کلمانتین, شناسایی شد که بیشترین فراوانی به ترتیب مربوط به ریزماهواره های دو و سه نوکلئوتیدی بود. تعداد بالای EST-SSRهای بدست آمده نشان دهنده بازده بالای روش نسل جدید توالی یابی در شناسایی نشانگرهای مولکولی بود. 25 مکان ریزماهواره دو و سه نوکلئوتیدی برای طراحی آغازگر انتخاب شدند. در مجموع 65 آلل با میانگین 4.25 آلل در هر مکان و میانگین آلل موثر 2.53 از 16 جفت آغازگر چندشکل و با کیفیت تفکیک بالا بدست آمد. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی 0.48 بود که بیشترین مقدار آن در مکان های ABRII7 و ABRII9 مشاهده شد. مطالعه روابط ژنتیکی 34 ژنوتیپ مرکبات به روش تجزیه خوشه ای بر اساس الگوریتم NJ و فاصله Uncorrected P انجام شد. بر این اساس همه ژنوتیپ ها در چهار گروه پوملو, سیترون, ماندرین و نارنج سه برگ قرار گرفتند. شباهت بالای طبقه بندی بدست آمده با سایر مطالعات تنوع ژنتیکی مرکبات نشان دهنده کیفیت بالای نشانگرهای بدست آمده از روش توالی یابی عمیق ترنسکریپتوم است.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    شفیعی، مائده، مردی، محسن، فتاحی مقدم، محمدرضا، و زمانی، ذبیح اله. (1393). مطالعه روابط ژنتیکی برخی از گونه های مرکبات با استفاده از ریزماهواره های (EST-SSR) شناسایی شده از توالی یابی ترنسکریپتوم کلمانتین. ژنتیک نوین، 9(3 (پیاپی 38))، 289-298. SID. https://sid.ir/paper/116420/fa

    Vancouver: کپی

    شفیعی مائده، مردی محسن، فتاحی مقدم محمدرضا، زمانی ذبیح اله. مطالعه روابط ژنتیکی برخی از گونه های مرکبات با استفاده از ریزماهواره های (EST-SSR) شناسایی شده از توالی یابی ترنسکریپتوم کلمانتین. ژنتیک نوین[Internet]. 1393؛9(3 (پیاپی 38)):289-298. Available from: https://sid.ir/paper/116420/fa

    IEEE: کپی

    مائده شفیعی، محسن مردی، محمدرضا فتاحی مقدم، و ذبیح اله زمانی، “مطالعه روابط ژنتیکی برخی از گونه های مرکبات با استفاده از ریزماهواره های (EST-SSR) شناسایی شده از توالی یابی ترنسکریپتوم کلمانتین،” ژنتیک نوین، vol. 9، no. 3 (پیاپی 38)، pp. 289–298، 1393، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/116420/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button