مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,241
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

679
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

شناسایی واریانت های ژنی اسب کاسپین با استفاده از نسل جدید توالی یابی ژنوم با کارایی بالا

صفحات

 صفحه شروع 101 | صفحه پایان 119

چکیده

 تکنیک های نوین توالی یابی با کارایی بالا به عنوان رهیافت نوینی در شناسایی واریانت های ژنتیکی و اطلاعات عملکردی در گونه های بسیاری از چمانگان قرار گرفته اند. اسب کاسپین با توجه به ویژگی های منحصر به فرد ژنتیکی و فنوتیپی خود, یکی از نژاد های مهم اسب در ایران و جهان است. از این رو, پژوهش حاضر به شناسایی واریانت های ژنتیکی چندشکلی های تک نوکلیوتیدی, حذف و اضافه های کوتاه و واریانت های تعداد در نسخه (CNV) در اسب کاسپین و بررسی نقش آن ها در فرآیند ها و مسیرهای بیولوژیک ویژه پرداخته است. با استفاده از توالی یابی با کارایی بالا, Gb108 از DNA ژنومی سه مادیان کاسپین با میانگین عمق 45.8 توالی یابی شدند. این توالی یابی با میانگین همپوشانی 14.41 کم و بیش 76.4 درصد از ژنوم رفرانس اسب را پوشش داد. با استفاده از فیلترینگ سختگیرانه 1666717 چندشکلی تک نوکلیوتیدی, 358020 حذف و اضافه های کوتاه و CNV 3109 شناسایی شدند. کلاسترینگ عملکردی واریانت های ژنی اسب کاسپین نشان داد که بیشتر این واریانت ها در ژن های مرتبط با فرآیندهای سیستم عصبی, تنظیم ورارسانی فرسته های بیوشیمیایی مرتبط با گوانیدین تری فسفات, موفوژنز سلولی, سازمان بندی اسکلت سلولی, توسعه رگی, جنبایی سلولی و انتقال غشایی روی داده است. فزون بر این, واریانت های ساختاری ژنوم اسب کاسپین مانند اینورژن ها و جا به جا شدگی ها و نیز حذف و اضافه های بزرگ ژنومی که در این پژوهش شناسایی شدند, می توانند در طراحی نشانگرهای ژنتیکی برای کارهای اصلاح نژادی و نیز بررسی های جمعیتی سودمند واقع شوند.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    عارف نژاد، بابک، کهرام، حمید، مرادی شهربابک، محمد، شاکری، ملک، دونگ، یانگ، ژانگ، خیائولی، وانگ، ون، و حسینی سالکده، قاسم. (1393). شناسایی واریانت های ژنی اسب کاسپین با استفاده از نسل جدید توالی یابی ژنوم با کارایی بالا. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، 6(4)، 101-119. SID. https://sid.ir/paper/224371/fa

    Vancouver: کپی

    عارف نژاد بابک، کهرام حمید، مرادی شهربابک محمد، شاکری ملک، دونگ یانگ، ژانگ خیائولی، وانگ ون، حسینی سالکده قاسم. شناسایی واریانت های ژنی اسب کاسپین با استفاده از نسل جدید توالی یابی ژنوم با کارایی بالا. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی[Internet]. 1393؛6(4):101-119. Available from: https://sid.ir/paper/224371/fa

    IEEE: کپی

    بابک عارف نژاد، حمید کهرام، محمد مرادی شهربابک، ملک شاکری، یانگ دونگ، خیائولی ژانگ، ون وانگ، و قاسم حسینی سالکده، “شناسایی واریانت های ژنی اسب کاسپین با استفاده از نسل جدید توالی یابی ژنوم با کارایی بالا،” مجله بیوتکنولوژی کشاورزی، vol. 6، no. 4، pp. 101–119، 1393، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/224371/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button