مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

275
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

480
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

اثر تراکم نشانگرها و اندازه جمعیت مرجع بر صحت مستندسازی در داده شبیه سازی شده

صفحات

 صفحه شروع 15 | صفحه پایان 22

چکیده

 در پژوهش حاضر, اثر اندازه جمعیت مرجع و تعداد نشانگرهای چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) گم شده بر صحت مستندسازی (ایمپیوتیشن) مورد بررسی قرار گرفت. از نرم افزار QMSim برای ایجاد بانک اطلاعاتی مرجع به تعداد 1000 حیوان شبیه سازی شده استفاده شد. از داده های مرجع دو دسته ایجاد شد: دسته اول (A) شامل ژنوتیپ های اصلی حاوی داده های گم شده (تعداد 52 هزار نشانگر SNP) و دسته دوم (B) با خروج داده های گم شده از مجموع داده ها (تعداد 37 هزار نشانگر SNP) ایجاد شد. در هر دو دسته, تعداد جمعیت مرجع با 100, 250, 500 و 750 حیوان شبیه سازی شد. تعداد نشانگرهای SNP حذف شده به طور تصادفی و با نسبت های 15, 30, 55, 70 و 95 درصد در هر دو دسته شبیه سازی شد. بر اساس همبستگی بین ارزش نشانگرهای SNP اصلی قبل از حذف و ارزش آن ها بعد از مستندسازی, صحت برآورد شد. نتایج مطالعه حاضر نشان داد که صحت مستندسازی تحت تأثیر اندازه جمعیت مرجع و تراکم نشانگرهای SNP گم شده قرار داشت. با افزایش اندازه جمعیت مرجع از 100 به 750 حیوان, متوسط صحت مستندسازی در هر دو دسته افزایش یافت. بیشترین میزان صحت برای جمعیت مرجع با 750 حیوان در دامنه 89/0 تا 98/0 برای دسته A و 90/0 تا 99/0 برای دسته B مشاهده شد. به طور کلی, نتایج نشان داد که اگر اندازه جمعیت مرجع به اندازه کافی باشد, علی رغم تعداد زیاد نشانگر SNP گم-شده, صحت مستندسازی تغییر زیادی نخواهد کرد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    محمدی، یحیی. (1399). اثر تراکم نشانگرها و اندازه جمعیت مرجع بر صحت مستندسازی در داده شبیه سازی شده. تحقیقات تولیدات دامی، 9(2 )، 15-22. SID. https://sid.ir/paper/367156/fa

    Vancouver: کپی

    محمدی یحیی. اثر تراکم نشانگرها و اندازه جمعیت مرجع بر صحت مستندسازی در داده شبیه سازی شده. تحقیقات تولیدات دامی[Internet]. 1399؛9(2 ):15-22. Available from: https://sid.ir/paper/367156/fa

    IEEE: کپی

    یحیی محمدی، “اثر تراکم نشانگرها و اندازه جمعیت مرجع بر صحت مستندسازی در داده شبیه سازی شده،” تحقیقات تولیدات دامی، vol. 9، no. 2 ، pp. 15–22، 1399، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/367156/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button