مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

281
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

493
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

تأثیر کاهش تراکم نشانگرها بر صحت پیش بینی ژنومی روش های پارامتری

صفحات

 صفحه شروع 3 | صفحه پایان 16

چکیده

 افزایش تعداد نشانگرها (p) به تعداد مشاهدات (n), نخستین چالش انتخاب ژنومی است (مزاحمت ابعاد؛ p >> n). لذا پژوهش حاضر با هدف امکان کاهش مزاحمت ابعاد, به بررسی تأثیر کاهش تعداد نشانگرها بر صحت پیش بینی ارزش های اصلاحی ژنومیک روش های پارامتری پرداخته است. بدین منظور, برای هر فرد ژنومی متشکل از 10000 نشانگر تک نوکلئوتیدی دو آللی (SNP) با فواصل یکسان روی 10 کروموزوم (هریک به طول 100 سانتی مورگان) شبیه سازی شد. در این پژوهش توزیع های متفاوت تأثیرات ژنی (یکنواخت, نرمال یا گاما), سطوح مختلف وراثت پذیری صفت (05/0, 25/0, 45/0 یا 65/0) و تعداد متفاوت جایگاه های ژنی (QTL؛ 100 یا 500) به عنوان فرضیات شبیه سازی در نظر گرفته شد. سپس در یک سناریوی انتخاب 10 یا 20 درصد نشانگرها به طور تصادفی انتخاب شدند؛ به طوریکه برای هر یک از جمعیت های موجود سه ماتریس نشانگری با ابعاد مختلف (همة نشانگرها, 10 یا 20 درصد نشانگرها) تعریف گردید. مطابق یافته های پژوهش حاضر, به طورکلی صحت ارزش های اصلاحی ژنومیک به ترتیب تحت اثر میزان وراثت پذیری صفت, فاصلة نسل از جمعیت مرجع, تراکم نشانگرها, توزیع و تعداد QTLها و مدل آماری قرار داشت (p < 0. 001). به طوریکه در هر سه توزیع آثار ژنی و با هر فُرم ساختار نشانگری (کاهش یا عدم کاهش تراکم نشانگرها) مشاهده شد که در نتیجة کاهش وراثت پذیری صفت و یا افزایش فاصله از جمعیت مرجع میزان صحت پیش بینی ها به طور چشم گیری تقلیل یافت (p < 0. 05). بررسی اثر کاهش تراکم نشانگرها بر صحت پیش بینی ژنومی صفات با معماری ژنتیکی متفاوت نشان داد که جز در مورد صفات با وراثت پذیری پائین (05/0) و تعداد زیاد QTL (500) با توزیع ژنی گاما, به طورکلی کاهش تراکم نشانگری به طور معنی داری منجر به اُفت صحت پیش بینی های ژنومیک روش های پارامتری خواهد شد (p < 0. 05).

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    خیرآبادی، خبات، فیاضی، جمال، روشنفکر، هدایت اله، و عبداللهی آرپناهی، رستم. (1398). تأثیر کاهش تراکم نشانگرها بر صحت پیش بینی ژنومی روش های پارامتری. علوم دامی (پژوهش و سازندگی)، 32(122 )، 3-16. SID. https://sid.ir/paper/404596/fa

    Vancouver: کپی

    خیرآبادی خبات، فیاضی جمال، روشنفکر هدایت اله، عبداللهی آرپناهی رستم. تأثیر کاهش تراکم نشانگرها بر صحت پیش بینی ژنومی روش های پارامتری. علوم دامی (پژوهش و سازندگی)[Internet]. 1398؛32(122 ):3-16. Available from: https://sid.ir/paper/404596/fa

    IEEE: کپی

    خبات خیرآبادی، جمال فیاضی، هدایت اله روشنفکر، و رستم عبداللهی آرپناهی، “تأثیر کاهش تراکم نشانگرها بر صحت پیش بینی ژنومی روش های پارامتری،” علوم دامی (پژوهش و سازندگی)، vol. 32، no. 122 ، pp. 3–16، 1398، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/404596/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button