Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

429
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

466
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی پروفایل ترنسکریپتوم بافت تخمدان در میش های نژاد شال با استفاده از داده های RNA-Seq

صفحات

 صفحه شروع 199 | صفحه پایان 209

چکیده

 هدف از این مطالعه بررسی پروفایل بیان ژن در بافت تخمدان گوسفندان شال با استفاده از داده های توالی یابی RNA بود. برای این منظور, تخمدان های پنج رأس گوسفند شال بعد از هم زمان سازی فحلی جدا سازی و RNA آن ها با استفاده از فناوری Illumina Hiseq 4000 توالی یابی شد. به طور میانگین, داده های به دست آمده از توالی یابی شامل 26638311 جفت خوانش با نرخ نقشه یابی منحصر به فرد 81/08 بود. نتایج حاصل از آنالیز های بیوانفورماتیکی, بیان 21085 ژن را در بافت تخمدان گوسفندان شال نشان داد که از این تعداد 15087 ژن دارای میانگین بیان بالاتر از 10 بودند. تجزیه و تحلیل عملکردی ژن ها, معنی داری (p<0/05) بود 162 عبارت GO شامل 41 فرایند بیولوژیکی, 46 عملکرد مولکولی و 75 جز سلولی را نشان داد. همچنین آنالیز مسیرهای KEGG, 149 مسیر معنی دار ( p <0/05) را شناسایی کرد که مهم ترین آن ها مسیر پیام رسانی استروژن, مسیر پیام رسانی TGF-beta و تقسیم میوز اووسیت بود. بررسی بیان ژن های عمده برای دوقلوزایی و تولیدمثل, بیان بالایی برای ژن های INHA, INHBA, BMPR1B را نشان داد و ژن INHA یک فاکتور پاراکرین مهم در فولیکول های تخمدان جز 10 ژن با بالاترین میانگین بود. همچنین ژن های FSHR, ESR1 و ESR2 بیان متوسط و ژن های GDF9, BMP15 و PRLR بیان پایینی در نمونه ها نشان دادند. در این مطالعه برای اولین بار ترنسکریپتوم بافت تخمدان میش های شال با استفاده از فناوری RNA-seq بطور جامع بررسی شد و این مطالعه می تواند پایه ژنتیکی مفیدی برای شناخت بهتر ژن ها و فرایندهای درگیر در تولیدمثل گوسفندان شال فراهم کند.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    شریعتی گزگزاره، پروین، مسعودی، علی اکبر، واعظ ترشیزی، رسول، احسانی، علیرضا، و موسویان، زینب. (1399). بررسی پروفایل ترنسکریپتوم بافت تخمدان در میش های نژاد شال با استفاده از داده های RNA-Seq. تولیدات دامی (مجله کشاورزی پردیس ابوریحان)، 22(2 )، 199-209. SID. https://sid.ir/paper/392934/fa

    Vancouver: کپی

    شریعتی گزگزاره پروین، مسعودی علی اکبر، واعظ ترشیزی رسول، احسانی علیرضا، موسویان زینب. بررسی پروفایل ترنسکریپتوم بافت تخمدان در میش های نژاد شال با استفاده از داده های RNA-Seq. تولیدات دامی (مجله کشاورزی پردیس ابوریحان)[Internet]. 1399؛22(2 ):199-209. Available from: https://sid.ir/paper/392934/fa

    IEEE: کپی

    پروین شریعتی گزگزاره، علی اکبر مسعودی، رسول واعظ ترشیزی، علیرضا احسانی، و زینب موسویان، “بررسی پروفایل ترنسکریپتوم بافت تخمدان در میش های نژاد شال با استفاده از داده های RNA-Seq،” تولیدات دامی (مجله کشاورزی پردیس ابوریحان)، vol. 22، no. 2 ، pp. 199–209، 1399، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/392934/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا