در تابستان سال های 1395 و 1396 تعداد 73 نمونه با علائم مشابه با ویروئید فرورفتگی میوه سیب از ارقام گالا و رد دلیشیز منطقه ی مراغه جمع آوری شد. RNA کل از پوست ساقه و برگ نمونه های جمع آوری شده حاوی علایم لکه های فرورفته و خال های زرد با حاشیه نامنظم روی پوست میوه، استخراج گردید و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژنوم کامل ویروئید به طول 307-306 جفت باز با آزمون RT-PCR تکثیر و ترادف 10 نمونه تعیین گردید. جستجوی ترادف ها با BLASTn و هم ردیف سازی آنها با ترادف های مربوطه در بانک ژن نشان داد که جدایه های مورد مطالعه دارای بیشترین و کمترین یکسانی ترادف به میزان 100 و 4/74 درصد بترتیب با رس شمارهای EF088662 (ایتالیا) و KF788291 (ایتالیا) می باشند. بیشترین تفاوت نوکلئوتیدی در بین نواحی CCRو TR قرار داشتند. آنالیز فیلوژنتیک با روش حداکثر احتمال نشان داد که جدایه های ایرانی به همراه جدایه ها و واریانت های گزارش شده از ایتالیا در یک گروه قرار می گیرند.

این پژوهش با هدف تولید نهال عاری از سه ویروس ACLSV، ASPV، ASGV سیب "گوشت سرخ" (Malus pumila Mill. )، در پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (ABRII) در سال 1394 انجام شد. آزمایش ها با ارزیابی اثربخشی تیمار گرمادرمانی (0، 7، 14 و 21 روز در دمای 38 درجه سانتی گراد) و کشت مریستم انتهایی (در سه اندازه کوچک تر از 2/0 میلی متر، بین 2/0 تا 7/0 میلی متر و بزرگ تر از 7/0 میلی متر) بر نرخ حذف ویروس از ریزشاخه ها انجام شد. در ابتدا حضور ویروس هایACLSV، ASGV و ASPV در نمونه های مادری با روش های آزمون الایزای ساندویچ دو طرفه آنتی بادی و RT-PCR مورد ارزیابی قرار گرفت. سپس تیمارهای گرمادرمانی و کشت مریستم در شرایط درون شیشه ای انجام شد. ریزشاخه های رشد یافته از مریستم توسط الایزا و RT-PCR برای هر سه ویروس بررسی شدند. به طورکلی نرخ حذف سه ویروس ACLSV (9/25 درصد)، ASGV (4/7 درصد) و ASPV (4/44 درصد) با یکدیگر متفاوت بود. نتایج نشان داد افزایش طول مدت گرمادرمانی و کاهش اندازه مریستم با اثر گذاری متفاوت بر ویروس های مورد مطالعه باعث افزایش نرخ عاری شدن ریزنمونه ها از ویروس شده است. افزایش دوره زمانی گرمادرمانی در 21 روز باعث کاهش رشد و تکثیر و حتی از بین رفتن ریزنمونه ها شد. بنابراین 14 روز گرمادرمانی مؤثرترین تیمار جهت حذف آلودگی ویروس-هایASGV (11/11درصد)، ASPV (89/88 درصد) و ACLSV (44/44 درصد) از ریزنمونه های مورد مطالعه بود. در پایان آزمایش نمونه هایی که توسط هر دو روش الایزا و RT-PCR سالم تشخیص داده شدند، تکثیر و ریشه دار شدند و در شرایط گلخانه ای سازگار شدند.

این مطالعه با هدف تولید نهال سالم گلابی جهت تکثیر و ایجاد یک باغ سالم مادری در سال 1393 در پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (ابری) انجام شد. آزمایش ها با ارزیابی کارایی شیمی درمانی (تیمارهای ریباویرین با غلظت های صفر، 20، 40 و 80 میلی گرم) و کشت مریستم انتهایی (در سه اندازه: کوچک تر از 2/0 میلی متر، بین 2/0 تا 7/0 میلی متر و بزرگ تر از 7/0 میلی متر) بر حذف ویروس (ACLSV، ASGVو ASPV) از هفت رقم گلابی (ابته فتل، بیروتی، درگزی، کوشیا، لوئیزبون، ملینا و اسپادونا) صورت گرفتند. در ابتدا حضور ویروس های ACLSV، ASGV و ASPV در نمونه های مادری با روش RT-PCR بررسی شد و تمام ریز نمونه ها به هر سه ویروس آلودگی داشتند به جز ارقام ابته فتل و بیروتی که عاری از ویروس ASP بودند. تیمارهای شیمی درمانی و کشت مریستم در شرایط درون شیشه ای انجام شد. ریز شاخه های رشد یافته از مریستم توسط RT-PCR برای هر سه ویروس مورد آزمایش قرار گرفتند. نتایج نشان داد که افزایش غلظت ریباویرین و کاهش اندازه مریستم در افزایش کارآیی حذف هر سه ویروس بسیار مؤثر بود. همچنین واکنش ارقام و ویروس های موردمطالعه به تیمارهای این پژوهش متفاوت بود. نمونه هایی که توسط RT-PCR سالم تشخیص داده شدند، تکثیر و ریشه دار شده و به گلدان منتقل شدند تا بتوانند به منظور ایجاد باغ مادری سالم مورداستفاده قرار گیرند.

سیب (Malus domesticca Borkh)، یکی از ارزشمند ترین گیاهان خانواده Rosaceae است که به دلیل ارزش غذایی و اقتصادی بالا، یکی از محصولات کشاورزی با اهمیت محسوب می گردد. بیماری سفیدک سطحی سیب که در اثر قارچ Podosphaera leucotricha ایجاد می شود، یکی از بیماری های مهم سیب است که سالانه خسارت کمی و کیفی فراوانی به محصوی سیب وارد می کند. در سال های اخیر، استفاده از ارقام مقاوم جهت ایجاد مقاومت به بیماری سفیدک پودری سیب مورد توجه واقع گردیده است؛ به این منظور جهت ردیابی ژن های مقاومت Pl1، Pld، Plbj وRGAs به قارچ P. leucotricha روی ژنوتیپ های وحشی سیب ایران، از مناطق مختلف استان های آذربایجان غربی، گلستان، فارس، چهار محال و بختیاری و اصفهان، نمونه برداری شد. حضور دامنه های محافظت شده NBS-LRR، موتیف AAA از خانواده بزرگ موتیف های P-loop NTPase در پروتیین NBS-LRR-like و نیز دامنه ی محافظت شده NB-ARC در ناحیه N-tetminal، و همچنین ناحیه غنی از اسید آمینه لوسین در ناحیه C-terminal در دامنه LRR که توسط RGAs کد می شود، در نمونه های مذکور، مورد تایید واقع شد. ژن مقاومت Pl1 در تمامی ژنوتیپ ها به جز یک موردردیابی شد. ژن مقاومتPld تنها در سه نمونه از 47 نمونه جمع آوری شده و ژن مقاومت Plbj در 13 نمونه از تمامی ژنوتیپ های وحشی جمع آوری شده از مناطق سردسیر استان های اصفهان و آذربایجان غربی وجود داشت. توالی این ژن در بانک ژن جهانی ثبت گردید. ردیابی ژن های مقاومت و آنالوگ های آن می تواند در ایجاد ارقام مقاوم سیب به بیماری در آینده کمک شایانی نماید.

پاتولین مایکوتوکسینی است که بوسیله گونه های مختلف از کپک ها تولید می شود. در مطالعه حاضر 70 نمونه شامل 35 نمونه لواشک و 35 نمونه آب سیب به طور تصادفی از فروشگاه های شهرستان شهرکرد جمع آوری و جهت بررسی حضور پاتولین به روش کروماتوگرافی مایع با کارآیی بالا (HPLC-DAD) مطابق روش استاندارد ملی ایران مورد آزمایش قرار گرفتند. نتایج این این تحقیق نشان داد که پاتولین در 14 نمونه لواشک سیب (40 درصد) و 7 نمونه آب سیب (20 درصد) وجود دارد. میانگین غلظت پاتولین در نمونه های لواشک و آب سیب به ترتیب 34.9±26.3 و 26±19.7 میکروگرم در کیلوگرم بود. اگرچه غلظت میانگین پاتولین در نمونه های مورد مطالعه کمتر از حداکثر میزان مجاز ایران (50 میکروگرم در کیلوگرم) می باشد ولی غلظت پاتولین در 5.7 درصد نمونه های لواشک سیب و 2.9 درصد نمونه های آب سیب بالاتر از حداکثر مجاز اتحادیه اروپا و ایران (50 میکروگرم در کیلوگرم) بود.

Golden delicious  به عنوان شاهد، به باکتری Erwinia amylovora (Burrill.) Winslow et al. عامل بیماری آتشک گلابی بررسی شد. سویه های باکتری عامل آتشک از باغ های درختان میوه دانه دار مناطق ارومیه، کرج، مشهد، زنجان، شاهرود، قزوین و سنندج جمع آوری و با آزمون های فنوتیپی و مولکولی شناسایی شدند. مخلوط هفت سویه بیماریزا از مناطق مختلف به عنوان مایه باکتری به کار برده شد. ارزیابی مقاومت ژنوتیپ ها با تزریق سرشاخه نهال های یکساله پیوندی بر روی پایه M26 در شرایط گلخانه انجام و شدت بلایت شش هفته پس از مایه زنی تعیین شد. بر اساس نتایج این پژوهش، 5% ارقام و ژنوتیپ های مقاوم (ارقام موروتی، قرمز تابستانه و سفید و قرمز)، 17% نیمه مقاوم، 18% نیمه حساس، 28% حساس و 32 % بسیار حساس بودند. با توجه به این یافته ها می توان نتیجه گرفت که ژرم پلاسم سیب بومی ایران نسبت به بیماری آتشک نسبتا حساس است.