مقدمه: بیماری مالتیپل اسکلروزیس (MS) یک بیماری التهابی دمیلینه کننده ی سیستم اعصاب مرکزی است. هدف از مطالعه ی کنونی بررسی کتابخانه های ریز آرایه موجود در NCBI و آنالیز عملکرد کتابخانه برای بررسی ژن های تغییربیان یافته و استخراج مسیرهای سلولی درگیر در پاتوژنز MS بود.روش کار: داده های موجود در مجموعه داده GSE21942 ، در ابتدا توسط GEO2R و سپس توسط نرم افزار R نسخه 4.2.0 آنالیز شدند. نرمال سازی داده ها و استخراج ژن های دارای تفاوت بیان معنادار (DEGs) انجام شد و آنالیز عملکرد توسط Enrichr و DAVID 6.8 انجام شد. یافته ها: 300 ژن در گروه MS با Log2FC>1 افزایش بیان و 205 ژن با Log2FC<-1 کاهش بیان داشتند. مسیر پیام دهی گیرنده سلول B و مسیر پیام دهی MAPK کیناز مهمترین مسیر استخراج شده است.نتیجه گیری: مسیرهای استخراج شده برای ژن های تغییر بیان یافته با مسیر پیام دهی MAPK کیناز مرتبط می باشند که ممکن است طیف گسترده ای از فرآیندهای سلولی از جمله تکثیر، تمایز، آپوپتوز و پاسخ های استرس را در بیماری MS تنظیم کنند. لذا مسیر اشاره شده احتمالا بتوانند به عنوان اهدافی جهت درمان MS مورد استفاده قرار گیرد.