زمینه و هدف: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس همچنان به عنوان شایع ترین علت مرگ های مرتبط با عوامل بیماریزای عفونی در جهان مطرح است. ریفامپین نیز از مهم ترین داروهای خط اول درمان بیماری سل می باشد. شایع ترین موتاسیون های مرتبط با مقاومت به داروی ریفامپین در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بر اثر جابه جایی در کدون های 531، 526 و 516 در ژن rpoB اتفاق می افتد. این مطالعه با هدف معرفی روش (Multiplex Allele Specific) PCR برای شناسایی بیماران مبتلا به سل مقاوم به ریفامپین از طریق یافتن موتاسیون های ایجادشده در ژنrpoB صورت گرفت. روش بررسی: در این پژوهش، وجود جهش در 3 کدون ژن rpoB در 90 نمونه کشت مثبت بیماران مسلول ریوی مراجعه کننده به مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی واقع در بیمارستان مسیح دانشوری تهران در سال 1387-1385 پس از انجام تست های حساسیت دارویی، بررسی گردید. برای ارزیابی جهش در 3 کدون 531، 526 و 516 از روشMAS-PCR استفاده شد. یافته ها: بر اساس نتایج کشت، %33.3 از نمونه ها حساس و %66.6 مقاوم به دارو بودند که از این میزان نمونه مقاوم به دارو، %44.4 مقاوم به ریفامپین بودند. با استفاده از روشMAS-PCR ، %32.2 از این مقاومت ها شناسایی گردید که %43.4 دارای موتاسیون در کدون rpoB531، %34.5 دارای موتاسیون در کدونrpoB526 و 531 دارای موتاسیون در کدون rpoB516بودند. نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد روشMAS-PCR ، روشی دقیق و مناسب برای تشخیص سریع مقاومت به ریفامپین در نمونه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس می باشد.