مجله میکروب شناسی پزشکی ایران
سال:1396 | دوره:11 | شماره:4 |تعداد مقالات:12

زمینه و اهداف: داروهای ضد التهاب غیر استروئیدی (NSAIDs) به دلیل خواص کاهش دهنده درد، تب و التهاب کاربرد دارند. در این مطالعه NSAIDs برای شکستن مقاومت باکتری به توبرامایسین به کار گرفته شدند. هدف این مطالعه، ارائه یک روش آسان و کم هزینه برای مقابله با بیوفیلم باکتری Pseudomonas aeruginosa، با استفاده از NSAIDs و توبرامایسین می باشد. مواد و روش کار: پس از انجام مدل سازی مولکولی، NSAIDs در کنار آنتی بیوتیک توبرامایسین برای باکتری P. aeruginosa سویه PAO1، استفاده شد. دستگاه Plate Reader جذب محلول کریستال ویوله در اتانول را اندازه گیری کرد. میزان نفوذ NSAIDs در بیوفیلم، توسط نمک تترازولیوم اندازه گیری و جذب آن نیز توسط دستگاه Plate Reader اندازه گیری شد. یافته ها: پس از داکینگ، بهترین کونفورماسیون هرکدام از NSAIDs برای مهار پروتئین های LasR و PqsE انتخاب شد. با توجه به اینکه انجام کار روی مهارکننده دوگانه بود، توانستیم به شکلی دست پیدا کنیم، که ثابت مهار برای LasR و PqsE هم زمان در پائین ترین حالت قرار گیرد. نتایج نشان داد که تشکیل بیوفیلم باکتری در مجاورت NSAID و آنتی بیوتیک توبرامایسین کمتر بود. نتیجه گیری: با توجه به شباهت ساختمانی NSAID هایی مانند پیروکسیکام، ملوکسیکام و کتورولاک با لاکتون های هموسرین N (AHL S) این داروها، با مهار پروتئین های LasR و PqsE می توانند به عنوان مهارکنندگان سیستم Quorum-sensing به کار روند و مانع از بیماری زایی باکتری گردند.

زمینه و اهداف: بروسلوز یا تب مالت یکی از شایع ترین بیماری های مشترک بین انسان و دام است که در بسیاری از کشورهای خاورمیانه ازجمله ایران به عنوان یک معضل بهداشتی و اقتصادی مورد توجه ویژه قرار دارد. مصرف شیر و فرآورده های لبنی آلوده و نیز تماس با ترشحات دام آلوده از اصلی ترین راه های انتقال سویه های بیماری زای بروسلا در انسان می باشند. هدف از بررسی حاضر جستجوی هم زمان بروسلا آبورتوس و بروسلا ملی تنسیس در تانک های ذخیره شیر خام و غیرپاستوریزه گاو مراکز فروش لبنیات سنتی در شهرستان خرم آباد می باشد. مواد و روش کار: در این مطالعه مقطعی – توصیفی طی ماه های آبان و آذر سال 1394 درمجموع 120 نمونه از تانک های ذخیره شیر خام و غیرپاستوریزه گاو مراکز فروش لبنیات سنتی شهرستان خرم آباد جمع آوری گردید. برای اثبات حضور جنس بروسلا در کلیه نمونه ها آزمون PCR منفرد با استفاده از پرایمرهای اختصاصی B4 و B5، و برای جستجوی گونه های بروسلا آبورتوس و بروسلا ملی تنسیس از آزمون PCR چندگانه استفاده شد. یافته ها: مطالعه حاضر نشان داد که 10% از نمونه های شیر تانک های ذخیره شیر خام و غیرپاستوریزه گاو مراکز فروش لبنیات سنتی در شهرستان خرم آباد به بروسلا آلوده هستند.نتیجه گیری: نتایج آزمون PCR نشان داد که تانک های ذخیره شیر خام و غیرپاستوریزه گاو مراکز فروش لبنیات سنتی در شهرستان خرم آباد عامل بالقوه بروسلوز انسانی در منطقه است.

زمینه و اهداف: سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم یکی از علل شایع مسمومیت های غذایی در انسان می باشد. با توجه به این که انتخاب مارکرهای مناسب یکی از چالش های اصلی روش های تشخیصی ارائه شده برای این پاتوژن می باشد، در مطالعه حاضر، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، مارکرهای ژنتیکی این سرووار به عنوان اهداف تشخیصی مناسب غربال گردید. در فاز دوم کار، ساختار و عملکرد پروتئین های کد شده به وسیله این مارکرها تعیین شد.مواد و روش کار: این مطالعه در سال 96-1395 اجرا گردید. به منظور یافتن مارکرهای ژنی سالمونلا تیفی موریوم، 45 ژنوم کامل سرووار سالمونلا تیفی موریوم و سایر جنس های خانواده انتروباکتریاسه با استفاده از نرم افزار Mauve مورد مقایسه قرار گرفتند. به منظور تعیین ساختار و عملکرد پروتئین های مربوط به این توالی ها به ترتیب از نرم افزارهای I-TASSER و Phyre2 برای مدل سازی ساختاری و از پایگاه ها و نرم افزارهای CDD، InterProScan، DALI و ProFunc برای تعیین عملکرد استفاده شد.یافته ها: نواحی خاصی از ژن های STM4491 - STM4496 به عنوان مارکرهای اختصاصی سالمونلا تیفی موریوم تعیین شدند. عملکرد پروتئین های مربوط به این ژن ها در 5 گروه شامل Lon پروتئازها، پروتئین های متصل شونده به نوکلئوتید، NTPase ها، پروتئین های درگیر در مسیر ترمیم DNA و DNA متیلازها پیش بینی شد.نتیجه گیری: نواحی اختصاصی از ژن های STM4491-STM4496 می توانند به عنوان اهداف تشخیصی کارآمد برای شناسایی سرووار بیماری زای سالمونلا تیفی موریوم مورداستفاده قرار گیرند. علاوه بر این، پروتئین های کد شده به وسیله این مارکرها می توانند به عنوان اهدافی مناسب در طراحی عوامل درمانی جدید در پیشگیری و درمان عفونت های ناشی از این پاتوژن پیشنهاد شوند.

زمینه و اهداف: اثر کمبود ویتامین D3 درخطر ابتلای به بیماری هایی مانند نرمی استخوان، استئوپنی، پوکی استخوان و انواع سرطان، به خوبی شناخته شده است. سویه پروبیوتیک باکتری لاکتوباسیلوس پلانتاروم که بتواند ویتامین محلول در چربی D3 را در توده زیستی خود ذخیره کند، علاوه بر اینکه می تواند زمینه ساز تولید محصولاتی با مزایای پروبیوتیک شود، احتمالا اثرات نقص ویتامین D3 را کاهش خواهد داد.مواد و روش کار: در این مطالعه که در سال 1395 انجام شد، با طراحی آزمایش های یک فاکتور در زمان، گستره متغیرهای موثر احتمالی بر جذب ویتامین D3 در توده زیستی باکتری مشخص و فاکتورهای موثر انتخاب گردیدند. سپس با طرح رویه پاسخ، با انجام آزمایش های باکس- بنکن این متغیرها بهینه سازی شدند. روش تعیین کمی ویتامین در توده زیستی، کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (HPLC) می باشد.یافته ها: از میان فاکتورهای بررسی شده، سه فاکتور دما، غلظت اولیه ویتامین D3 و غلظت ساکارز از بقیه اهمیت بیشتری داشت. در غلظت اولیه ویتامین 351723.537 IU/mL D3، غلظت ساکارز افزوده شده به محیط کشت (g/L) 2.89 و دمای 33.8 درجه سلسیوس، بیشترین میزان انباشته شدن ویتامین در وزن خشک سلولی (1028.5 IU/g) به دست آمد که با مدل آماری پیشنهادی مطابقت داشت.نتیجه گیری: این مطالعه، اولین گزارش در زمینه غنی سازی توده زیستی لاکتوباسیلوس پلانتاروم با ویتامین D3 و بهینه سازی آن می باشد. مطالعات آزمایشگاهی و آماری انجام شده نشان دهنده صحت و اعتبار این بهینه سازی می باشد.

زمینه و اهداف: اسفنج های دریایی باقابلیت تولید برخی متابولیت های ثانویه، توانایی زندگی در شرایط پیچیده دریایی و مقابله با میکروارگانیسم ها را دارند. از این متابولیت ها می توان در جهت تخریب و ممانعت از تشکیل بیوفیلم های میکروبی استفاده نمود. از بین بردن بیوفیلم ها از جنبه صنعتی و سلامتی دارای اهمیت می باشد.مواد و روش ها: در این مطالعه، اثر ضد میکروبی عصاره متانولی: دی کلرومتانی (1:1) سه گونه اسفنج دریایی از جنس Dysidea sp. جمع آوری شده در سال 1394 از خلیج فارس بر روی 6 باکتری پاتوژن انسانی به فرم منفرد، با استفاده از روش دیسک پلیت انجام گردید. حداقل غلظت ممانعت کنندگی (MIC) و حداقل غلظت کشندگی (MBC) هر یک از عصاره ها مشخص شد. در سطح بیوفیلم میکروبی، آزمون تخریب بیوفیلم تشکیل شده و مهار تشکیل بیوفیلم توسط هر کدام از عصاره ها به صورت مجزا انجام پذیرفت.یافته ها: نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که اسفنج Dysidea sp.c بیشترین اثر مهاری را بر روی فرم منفرد باکتری های مورد مطالعه داشت. بیشترین اثر مهاری تشکیل بیوفیلم عصاره Dysidea sp.a در غلظت 12.5 mg/ml بر باکتری باسیلوس سرئوس و کمترین درصد مهار نیز در همین غلظت اما بر باکتری پسودوموناس آئروژینوزا تعیین گردید. بیشترین اثر تخریب بیوفیلم تشکیل شده عصاره Dysidea sp.c در غلظت 6.25 mg/mL و بر باکتری کلبسیلا پنومونیه بوده و همچنین کمترین این اثر در غلظت 12.5 mg/mL بر باکتری باسیلوس سرئوس تعیین گردید.نتیجه گیری: نتایج این تحقیق تایید کردند که هر کدام از گونه های اسفنج دریایی فعالیت ضدمیکروبی متفاوتی بر علیه باکتری های این پژوهش از خود نشان دادند که می تواند به دلیل تفاوت در تولید ترکیبات بیواکتیو و یا میکروارگانیسم های همزیست با آن ها باشد.

زمینه و اهداف: کلبسیلا پنومونیه یکی از عوامل شایع در عفونت های مهم بیمارستانی می باشد. هدف از این مطالعه تعیین میزان فراوانی ژن bla TEM و bla SHV در سویه های کلبسیلا پنومونیه جدا شده از عفونت خون از نمونه های کلینیکی شهر رشت می باشد.مواد و روش ها: در این مطالعه، 163 جدایه در بازه زمانی 6 ماهه از مرداد تا دی 1394 به دست آمد. حساسیت آنتی بیوتیکی به روش انتشار دیسک و تست غربالگری به روش دیسک ترکیبی بررسی شد. همچنین وجود ژن های bla TEM و bla SHV با استفاده از PCR مورد بررسی قرار گرفت.یافته ها و نتیجه گیری: از مجموع 163 نمونه خون کشت داده شده، 16 نمونه کشت مثبت بود. تنها 3 سویه (17.75 درصد) به عنوان کلبسیلا پنومونیه تشخیص داده شدند. در آزمون غربالگری اولیه از 3 نمونه مثبت، 2 نمونه (67 درصد) تولیدکننده بتالاکتاماز وسیعالطیف تعیین شد. جدایه های کلبسیلا پنومونیه بیشترین مقاومت را نسبت به ( پنیسیلین و آموکسی سیلین (100 درصد) و کمترین مقاومت را نسبت به ایمی پنم و سفتازیدیم (33 درصد) داشتند. نتایج PCR و بر روی 3 نمونه نشان داد که 3 مورد (100 درصد) حاوی ژن SHV، 1 مورد (33.3 درصد) حاوی ژن TEM و 1 مورد (33.3 درصد) نیز هر دو ژن SHV و TEM را دارا بودند. در مجموع انتقال افقی ژن به دیگر باکتری های در بیمارستان ها و مراکز درمانی و الگوی مصرف آنتی بیوتیک ها، باید موردتوجه بیشتری قرار گیرد.

زمینه و اهداف: سالمونلوز یک بیماری مهم در انسان و حیوانات است که به وسیله سرووارهای مختلف سالمونلا انتریکا ایجاد می شود. سرووارهای انتریتیدیس و تیفی موریوم از شایع ترین سرووارها در انسان و دام و همچنین عامل بیماری منتقله از طریق غذا می باشند. هدف از این مطالعه بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در سویه های سالمونلای جداسازی شده از گوشت قرمز و شناسایی مولکولی ژنهای مقاومت به تتراسایکلین می باشد.مواد و روش کار: در این مطالعه در سال 1394، تعداد230 نمونه گوشت قرمز از کشتارگاهها و مراکز توزیع گوشت قرمز جمع آوری شد و با استفاده از روشهای کشت و بیوشیمیایی جهت جداسازی سالمونلا مورد بررسی قرار گرفت. سروتایپینگ نمونه ها با استفاده از آنتی سرم های O و H انجام شد. آزمون حساسیت آنتی بیوتیکی برای تمامی جدایه ها انجام گرفت. جهت تشخیص ژنهای مقاومت به تتراسایکلین از روش MultiplexPCR و پرایمرهای اختصاصی ژنهای tetA، tetB، tetC و tetD استفاده شد.یافته ها و نتیجه گیری: تعداد60 نمونه سالمونلا جداسازی و شناسایی شد. نتایج سروتایپینگ نشان داد هر60 نمونه مربوط به گروه D و سرووار انتریتیدیس هستند. بیشترین میزان مقاومت به آنتی بیوتیک آموکسی سیلین و کمترین میزان مقاومت به آنتی بیوتیک جنتامایسین بدست آمد. 25 درصد نمونه ها به تتراسایکلین مقاومت داشته اند. در میان ایزوله های مقاوم به تتراسیکلین، در مجموع 60 درصد واجد ژنهای tet بودند که 7 ایزوله (46.6%) دارای ژن tetA و یک جدایه دارای ژن tetB و یک جدایه دارای ژن tetC بود. مطالعه حاضر نشان دهنده شیوع بالای سالمونلا در نمونه های گوشت قرمز و مقاومت آنتی بیوتیکی از جمله مقاومت به تتراسیکلین می باشد.

زمینه و هدف: استافیلوکوکوس آرئوس یک عامل مهم در بروز عفونت های بیمارستانی است. برخی حامل این باکتری در بخش هایی از بدن مانند بینی هستند. ناقلین این باکتری در کارکنان بیمارستان ها مانند پرستاران بیشتر از معمول است و سپس سویه های استافیلوکوکوس آرئوس مقاوم به آنتی بیوتیک ها به بیماران منتقل می شوند. این مطالعه با هدف شناسایی و ارزیابی حاملین استافیلوکوکوس آرئوس در بینی و تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی باکتری های جدا شده در جامعه آماری منتخب دانشجویان پرستاری دانشگاه آزاد اسلامی واحد اقلید می باشد.مواد و روش : اطلاعات لازم از طریق پرسشنامه جمع آوری شده و سپس نمونه گیری از دانشجویان پرستاری از هر دو حفره بینی با استفاده از سواپ مرطوب پنبه ای انجام شد. سویه های جدا شده از نمونه ها با استفاده از روش های متداول مانند رنگ آمیزی گرم و تست های کاتالاز و کواگولاز و کشت در محیط های DNase و مانیتول سالت اگار انجام گرفت تا باکتری های استافیلوکوکوس آرئوس جدا شوند و الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی برای آنتی بیوتیک های گوناگون مانند آمپی سیلین، اریترومایسین، تتراسیکلین و کلرامفنیکل با روش انتشار دیسک ارزیابی شد.یافته ها و نتیجه گیری: از 216 دانشجو، 68 مورد (31.4%) ناقل استافیلوکوکوس آرئوس بودند. بر اساس نتایج بیشترین و کمترین میزان مقاومت آنتی بیوتیکی به ترتیب علیه پنی سیلین (94.1%) و سیپروفلوکساسین (3%) مشاهده شد. بسیاری از دانشجویان حامل استافیلوکوکوس آرئوس بینی بودند که این مساله می تواند منجر به افزایش بروز عفونت های بیمارستانی گردد. از اینرو پیشنهاد می شود که غربالگری و درمان برای استافیلوکوکوس آرئوس برای تمام دانشجویان و کارکنان بیمارستانی که در تماس مستقیم با بیماران هستند انجام گیرد.

زمینه و هدف: ویروس اپشتین بار با سرطان نازوفارنکس، لنفوم بورکیت و لنفوم هوجکین مرتبط است. هدف از این تحقیق شناسایی میزان فراوانی ویروس اپشتین بار در نمونه های بافتی بیماران مبتلا به لنفوم هوجکین با روش ایمونوهیستوشیمی در استان فارس می باشد.مواد و روش کار: تعداد 30 نمونه بافتی لنفوم هوجکین از بلوک های پارافینه فیکس شده در فرمالین از بیمارستان های استان فارس انتخاب شدند و بیان پروتئین ویروسی LMP1 با روش ایمونوهیستوشیمی ارزیابی گردید. داده ها با نرم افزار آماری SPSS و آزمون دقیق فیشر آنالیز شدند.یافته ها و بحث: ویروس اپشتین بار در 77% (23 از 30) نمونه ها حضور داشت که موارد مثبت شامل 16 مرد و 7 زن بود. حضور ویروس بر اساس گروه های سنی لنفوم هوجکین بترتیب 87% (7 از 8) در گروه سنی 14-1 سال، 60% (3 از 5) در گروه سنی 49-15 سال و 76% (13 از 17) در گروه سنی بالای 49 سال به دست آمد. همچنین بالاترین بیان ویروس در زیرتایپ میکس سلولاریتی (93%) دیده شد. آزمون دقیق فیشر ارتباط معنی داری بین جنس، سن و زیرتایپ ها نشان نداد (p values > 0.05). نتایج نشان داد در استان فارس بیان ویروس اپشتین بار در نمونه های لنفوم هوجکین در کودکان و سالمندان شیوع بالایی دارد. همچنین حضور ویروس در مردان مبتلا به لنفوم هوجکین بیشتر از زنان بوده و زیرتایپ هیستولوژیکی میکس سلولاریتی غالب است. این یافته ها مشابه با سایر کشورهای در حال توسعه می باشد.