زمینه و هدف: SCC شایعترین سرطان حفره دهان است که عوامل اتیولوژیک مختلفی در ایجاد آن نقش دارند. در سالهای اخیر ویروس پاپیلومای انسانی یا HPV بعنوان یکی از عوامل احتمالی در ایجاد SCC حفره دهان مورد مطالعات زیادی قرار گرفته است. هدف از مطالعه حاضر بررسی ارتباط بین HPV و SCC حفره دهان به روش PCR است که نتایج حاصله با بافت طبیعی مخاط دهان مقایسه شده است.روش بررسی: در این بررسی تحلیلی مجموعا 51 نمونه SCC حفره دهان و 28 نمونه شاهد از حفره دهان که همگی بصورت بلوک پارافینی بودند به روش PCR، مورد بررسی ژنومیک قرار گرفتند. نمونه های مثبت از نظر وجود انواع 6، 11، 16، 18، 31 و 33 مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج حاصله از طریق آزمونهای آماری Chi square و Fisher exact test مورد بررسی قرار گرفتند.یافته ها: HPV DNA در 21.5% (11 از 51) موارد از گروه مورد و 3.6% (1 از 28) موارد از گروه شاهد با اختلاف معنی داری بین دو گروه مثبت بود (P<0.05). نمونه های HPV مثبت پس از آن، مجددا از نظر تعیین تیپ با PCR مورد بررسی قرار گرفتند. HPV16 با 4 مورد از 11 مورد بیشترین موارد و انواع HPV 31، 6، 33، 35 به ترتیب 3، 2، 1، 1 مورد را شامل می شدند. مکانهای بعدی را به خود اختصاص دادند. هیچ موردی با HPV18 و HPV11 یافت نشد. تفاوت معنی داری بین مردان و زنان HPV مثبت ملاحظه نشد. 4 مورد HPV مثبت از SCC های حفره دهان در کف دهان قرار داشتند. 4 مورد از 11 مورد سابقه استفاده از توتون و تنباکوی جویدنی را داشتند.نتیجه گیری: بطور کلی به نظر می رسد که HPV در اتیولوژی SCC حفره دهان نقشی ایفا می کند. گرچه با توجه به نقایص مطالعات این امر نیاز به بررسی های بیشتری دارد.