پیش زمینه و هدف: پمپ های افلاکس نقش مهمی در ایجاد مقاومت دارویی در کلبسیلا پنومونیه ایفا می کنند. هدف از این مطالعه، بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی، حضور ژن های افلاکس و همچنین تایپینگ مولکولی جدایه های بالینی کلبسیلا پنومونیه بود. مواد و روش کار: در این مطالعه توصیفی مقطعی درمجموع، 100 جدایه بالینی کلبسیلا پنومونیه از بیمارستان میلاد تهران جمع آوری شد. شناسایی باکتری ها بر اساس آزمون های بیوشیمیایی و آزمایش حساسیت ضد میکروبی مطابق با توصیه های موسسه استاندارد روش های آزمایشگاهی (CLSI) انجام شد. حضور ژن های tolC، AcrAB، mdtK با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) و تایپنگ مولکولی با استفاده از روش PCR عناصر تکراری بین ژنی (ERIC-PCR) انجام شد. یافته ها: نتایج حاصل نشان داد که 48 درصد ایزوله ها مقاومت چند دارویی (MDR) داشتند. بیشترین میزان مقاومت نسبت به آنتی بیوتیک های آمیکاسین (65 درصد) و سفپیم (57 درصد) و کم ترین میزان مقاومت به ترتیب نسبت به آزترئونام (صفر درصد) و فسفومایسین (1 درصد) مشاهده شد. ژن AcrAB با فراوانی 96 درصدی، فراوان ترین ژن افلاکس در ایزوله ها بود و پس از آن ژن های mdtK با 82 درصد و tolC با 79 درصد قرار داشتند. ERIC-PCR، 16 ژنوتیپ متفاوت را در جدایه های کلبسیلا پنومونیه نشان داد. ارتباط معنی داری بین الگوی اریک و ژن های پمپ افلاکس در برخی کلون ها مشاهده شد (p<0. 05). بحث و نتیجه گیری: یافته های ما شیوع بالای مقاومت چند دارویی و ژن های افلاکس را در جدایه های کلبسیلا پنومونیه نشان داد. سرکوب سیستم های افلاکس ممکن است در درمان و کنترل عفونت های کلبسیلا پنومونیه مقاوم به چند دارو مفید باشد.