زیست شناسی میکروارگانیسم ها
سال:1391 | دوره:1 | شماره:2 |تعداد مقالات:6

مقدمه: در بین میکروارگانیسم های تولیدکننده علف کش های زیستی، اکتینومیست ها از مهم ترین میکروارگانیسم های مولد هستند. علف کش های میکروبی برخلاف مواد شیمیایی، مشکلات زیست محیطی ایجاد نمی کنند، به همین دلیل امروزه به استفاده از آن ها توجه زیادی می شود.مواد و روش ها: 40 نمونه سویه های اکتینومیستی از ریزوسفر و فیلوسفر گیاهان جدا شدند. غربال گری نخستین روی محیط GAP به وسیله دو بذر شاهی و تربچه انجام شد. سویه هایی که بالای  70درصد اثر مهاری نشان دادند، انتخاب و سوپرناتانت حاصل از رشد آن ها در دو محیط مایع GPM و SCD سنجش زیستی شد. سپس استخراج فیتوتوکسین با حلال های آلی انجام شد. میزان تولید، قدرت مهارکنندگی عصاره برای 6 سویه برتر و زمان بهینه تولید و طیف اثر فیتوتوکسین سه سویه برتر از این 6 سویه، با استفاده از 10 گیاه علف هرز بررسی شد.نتایج: از بین 457 جدایه، 11 سویه مهار بالای 70 درصد نشان دادند. همه این سویه ها به جنس Streptomyces متعلق بودند. 3 سویه PM2-2،TM14-5  و KB2-2 برای بررسی طیف اثر فیتوتوکسین انتخاب شدند. سویه PM2-2 از لحاظ زمان تولید، قدرت مهارکنندگی و طیف اثر نسبت به سایر سویه ها برتری داشت.بحث و نتیجه گیری: اعضای جنس Streptomyces، تولیدکننده های بسیار مناسبی برای تولید فیتوتوکسین ها به شمار می روند. تنها فیتوتوکسین هایی که به طور مستقیم به مرحله تجاری شدن رسیده اند توسط اعضای این جنس تولید می شوند. مهار رشد بیشتر بذرهای گیاهان مورد آزمون توسط سویه های جدا شده در این پژوهش، نشان از توانمندی بسیار بالای فیتوتوکسین آن ها دارد. فیتوتوکسین برخی از سویه های این پژوهش مانند بیشتر فیتوتوکسین-های تجاری قدرت مهارکنندگی بالا و طیف اثر وسیعی دارند که باعث می شود استفاده از آن ها از لحاظ اقتصادی مقرون به صرفه باشد.

مقدمه: با توجه به نقش شناخته شده اگزوپروتئین های استافیلوکوکوس اورئوس در سرکوب کردن پاسخ ایمنی ذاتی در عفونت های انسانی، هدف از مطالعه حاضر، تعیین نقش عوامل مترشحه باکتری در زنده مانی نوتروفیل ها و مونوسیت ها در گاوان سالم و مبتلا به ورم پستان است.مواد و روش ها: در تحقیق حاضر، پنج نمونه شیر از گاوان مبتلا به ورم پستان و پنج نمونه از گاوان سالم تهیه شد. نمونه خون هپارینه از گاوان مبتلا و سالم به منظور جداسازی نوتروفیل ها و مونوسیت ها گرفته شد. نوتروفیل ها با استفاده از داروی مگلومین و مونوسیت ها در هیستوپک جدا سازی شدند. عوامل مترشحه از باکتری استافیلوکوکوس اورئوس ATCC23219 تهیه و غلظت پروتئین موجود در آن به روش برادفورد به میزان 400 میکروگرم در میلی لیتر تعیین شد. تاثیر غلظت های مختلف عوامل مترشحه بر میزان زنده مانی نوتروفیل ها و مونوسیت ها به ترتیب بروش فلوسیتومتری و ایمونوفلورسانس تعیین شد.نتایج: در مورد گاوان سالم، عوامل مترشحه حاوی 800 میکروگرم در میلی لیتر پروتئین و در مورد گاوان مبتلا به بیماری 400 میکروگرم در میلی لیتر پروتئین، بیشترین مرگ سلولی مونوسیت ها و نوتروفیل ها را داشتند. بررسی مراحل مختلف آپوپتوز در مونوسیت ها و نوتروفیل های گاوان سالم و مبتلا به بیماری نشان داد که حضور عوامل مترشحه در گاوان سالم موجب کاهش آپوپتوزدر مونوسیت ها و در گاوان بیمار موجب افزایش آپوپتوز شد.بحث و نتیجه گیری: ترشحات استافیلوکوکوس اورئوس باعث القا آپوپتوز و تا حدودی نکروز، هم در نوتروفیل ها و هم در مونوسیت های گاوان سالم و بیمار می شود، ولی این سلول ها در گاوان بیمار نسبت به مرگ سلولی حساس تر از گاوان سالم هستند. از طرفی در گاوان سالم نوتروفیل ها و در گاوان بیمار مونوسیت ها نسبت به مرگ سلولی حساس ترند. وقتی گاوان به بیماری ورم پستان استافیلوکوکوس اروئوس مبتلا می شوند، عوامل مترشحه از این باکتری تاثیر بیشتری روی مونوسیت ها نسبت به نوتروفیل ها دارند. آنچه مسلم است، تعیین دقیق محتویات ترشحات باکتری و نیز مکانیسم عمل آن ها به روشن شدن مطلب کمک خواهد کرد.

مقدمه: باکتری های مقاوم به حلال جزو گروه کمابیش جدیدی از باکتری های اکسترموفیل هستند که توانایی تولید پروتئازهایی مقاوم به حلال آلی را با کاربرد استفاده در بیوتکنولوژی صنعتی، برای تولید ترکیبات با ارزش دارند. از این رو، یافتن این باکتری ها به تازگی مورد توجه ویژه محققان قرار گرفته است.مواد و روش ها: در این تحقیق، از چشمه آب گرم گور، واقع در شهرستان جیرفت، نمونه برداری شد. نمونه ها در محیط حاوی سیکلوهگزان و تولوئن به مدت سه روز کشت داده شدند. غربال گری باکتری های مولد پروتئاز روی محیط جامد اختصاصی (Skim milk agar) SKM بر اساس قطر هاله، انجام شد. بهترین گونه باکتریایی توسط روش 16S rDNA شناسایی و میزان فعالیت پروتئازی در دماهای مختلف، اسیدیته و حلال های آلی بررسی شد.نتایج: نتایج حاصل از تطبیق توالی و درخت فیلوژنتیکی نشان دادند که گونه فوق، 97 درصد به گونه Bacillus niacini شباهت دارد. مطالعات آنزیمی نشان داد که این آنزیم در گستره دمایی 20 تا 90 درجه سانتی گراد فعالیت پروتئازی دارد که بیشترین آن در دمای 60 درجه سانتی گراد گزارش می شود. علاوه بر این، بیشترین فعالیت پروتئازی نیز در محدوده اسیدیته های 8 تا 9 و بیشترین پایداری در اسیدیته 9 گزارش می شود. بررسی فعالیت پروتئازی در حضور حلال های آلی متانول، تولوئن، DMF، ایزوپروپانول و سیکلوهگزان نشان می دهد که میزان فعالیت آنزیمی باقی مانده نسبت به نمونه فاقد حلال آلی بیش از 80 درصد است.بحث و نتیجه گیری: قابلیت های گرما دوست بودن، فعالیت در اسیدیته های قلیایی و پایداری در حضور حلال های آلی این پروتئاز اهمیت درخور توجهی برای استفاده در صنایع مختلف را دارد.

مقدمه: دریاچه ارومیه واقع در شمال غربی ایران بزرگ ترین دریاچه دائمی ایران و یکی از سه دریاچه شور دائمی در سطح جهان است. از چهار منطقه غربی این دریاچه نمونه برداری انجام شد و تنوع میکروارگانیسم ها با روش های مبتنی بر کشت و مستقل از کشت بررسی شد.مواد و روش ها: در روش مبتنی بر کشت، باکتری های هالوفیل و هالوتالرنت در شرایط هوازی در چهار محیط کشت MH، SWN،SWNLN  و MHLN جداسازی شدند. جدایه ها بر اساس تفاوت های کلونی، واکنش گرم، رنگ آمیزی اسپور و ویژگی های بیوشیمیایی اولیه تفکیک شدند. محتوای ژنومی نمونه های محیطی آب و خاک برای بررسی های مستقل از کشت استخراج شد. با استفاده از تکثیر 16S rRNA و کلونینگ کتابخانه ژن 16S rRNA تهیه و 20 درصد کلون های نوترکیب حاصل تعیین ترادف شدند.نتایج: از بین 217 جدایه حاصل در روش مبتنی بر کشت ژن 16S rRNA برای 52 سویه ترادف یابی شد که از نظر فیلوژنتیک در جنس های Halobacillus، Halomonas، Planococcus، Gracilibacillus، Bacillus، Pontibacillus، Paracoccus، Marinobacter، Providencia، Staphylococcus، Alkalibacterium، Sanguibacter، Lysobacter، Kocuria، Pontibacter، Salicola، Micrococcus، Oceanobacillus، Brevundimonas، Thalassobacillus،Microbacterium  و Piscibacillus قرار گرفتند. در روش مستقل از کشت کلون های بررسی شده در جنس های Salinibacter،Adhaeribacter  و Cesiribacter قرار گرفتند.بحث و نتیجه گیری: در روش مبتنی بر کشت بین جدایه های تعیین توالی شده 18 جدایه شباهت کمتر از 98.7 درصد با سویه استاندارد نشان دادند که محدوده مرزی برای ارائه گونه جدید میکروبی بومی است. در روش مستقل از کشت کلون های بررسی شده در گروه Bacteroidetes قرار گرفتند. که مشابه با سایر گزارش های موجود در مورد محیط های پر شور بررسی شده است.

مقدمه: ورم پستان یکی از شایع ترین و مهم ترین بیماری های گله های گاو شیری است. ورم پستان یک بیماری التهابی غده پستان است که به وسیله عوامل عفونی زیادی ایجاد می شود. استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس به فراوانی از نمونه های شیر ورم پستانی گاو جدا شده اند.مواد و روش ها: در کل 123 نمونه شیر از گاوان مبتلا به ورم پستان بالینی جمع آوری و بلافاصله به آزمایشگاه انتقال داده شد. شیر این مطالعه، به منظور بررسی میزان شیوع استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس در شیر گاوان مبتلا به ورم پستان بالینی در گاوداری های صنعتی اطراف اصفهان، انجام شد های ورم پستانی به وسیله آزمایش ورم پستان کالیفرنیایی تایید و همه نمونه ها با استفاده از آزمایش های میکروبی و بیوشیمیایی آزمایش شدند. در نهایت همه 123 نمونه با واکنش زنجیره ای پلیمراز دوباره ارزیابی شدند.نتایج: نتایج روش کشت نشان داد که باکتری های استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس به ترتیب در 13 و 7.31 درصد از نمونه های شیر، تشخیص داده شدند. واکنش زنجیره ای پلیمراز نشان داد که باکتری های استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس به ترتیب در 19.51 و 10.56 درصد از نمونه های شیر تشخیص داده شدند.بحث و نتیجه گیری: نتایج این بررسی نشان داد، واکنش زنجیره ای پلیمراز برای تشخیص دو باکتری استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس از دقت بالایی برخوردار است. ما استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز را برای کنترل کیفیت میکروبی نمونه های شیر، پیشنهاد می کنیم.

مقدمه: آلودگی های نفتی از مسائل مهم زیست محیطی هستند. گازوییل از متداول ترین آلاینده های نفتی است. زیست پالایی، فنآوری جدید پاک سازی خاک است. برخی از میکروارگانیسم ها قابلیت زیست پالایی گازوییل را دارند. این پژوهش، با هدف دستیابی به میکروارگانیسم های بومی، با قدرت تجزیه زیستی گازوییل در شرایط آب وهوایی شهر همدان انجام شد.مواد و روش ها: نمونه های خاک آلوده به گازوییل از 10 منطقه شهر همدان جمع آوری و باکتری های آن جداسازی و بر اساس ویژگی های ریخت شناسی و آزمایش های بیوشیمیایی دسته بندی شد. توانایی هر دسته در مصرف گازوییل در محیط کشت نمکی حداقل و غلظت های مختلف آلاینده (0.1، 0.5، 1، 3 درصد) از طریق کدورت سنجی در طول موج 600 نانومتر بررسی شد. نتایج از طریق آزمون آماری تحلیل واریانس چندعاملی با هم مقایسه شد.نتایج: در این تحقیق، 10 سویه مختلف باکتریایی از خاک های آلوده به گازوییل شهر همدان یافت شد. نتایج کدورت سنجی نشان داد که اثر عامل زمان، غلظت آلاینده، نوع باکتری و اثر تعاملی آن ها در تمامی نمونه های تیمارشده معنی دار می باشد. در غلظت خاص آلاینده، با افزایش زمان ماند، کدورت نمونه هابیش تر شده که این میزان افزایش از غلظت 0.1 تا 1 درصد چشمگیرتر از غلظت 1 تا 3 درصد آلاینده است. افزایش غلظت از 3 درصد به بالا موجب کاهش کدورت در برخی نمونه ها شده که می تواند کاهش راندمان حذف میکروبی آلاینده در این غلظت را به دنبال داشته باشد. سه سوش جدا شده نسبت به سایر سوش ها در کلیه غلظت ها و زمان های ماند کدورت بیشتری ایجاد کردند.بحث و نتیجه گیری: در بین سه سوش جداشده، بیش ترین کدورت ایجاد شده به باکتری شماره 3 مربوط بود که پس از شناسایی، به عنوان سودوموناس آیروژنز، گزارش شد. این باکتری به عنوان بهترین تجزیه کننده گازوییل از خاک های آلوده در شرایط آب و هوایی شهر همدان انتخاب شد.