زمینه: در بعضی از کشورهای دنیا، با وجود عدم جداسازی ویروس پولیوی وحشی از نمونه های کلینیکی، گردش خفته ویروس در سیستم فاضلاب گزارش شده است. از طرفی به توصیه سازمان بهداشت جهانی در مواردی ک احتمال ورود ویروس وحشی از کشورهای اندمیک وجود دارد، پایش محیطی جهت تکمیل پایش موارد فلج شل حاد (پایش AFP) پیشنهاد می شود.مواد و روش ها: در این پژوهش به صورت همزمان پایش AFP و محیطی در استان سیستان و بلوچستان به منظور تایید ریشه کنی ویروس فلج اطفال انجام شد. جهت پایش موارد فلج شل حاد، 21 نمونه مدفوع از بیماران مشکوک به این بیماری در مدت یک سال جمع آوری و در رده های سلولی Hep-2, RD, L20B مورد ارزیابی قرار گرفتند. جهت پایش محیطی، 86 نمونه از سیستم های تصفیه فاضلاب شهری و بیمارستانی تهیه و به صورت مستقیم، و با استفاده از روش های تغلیظ، تغلیظ رسوبی (Pellet) و روش تغییر یافته Two- phase، وجود انتروویروس ها در رده های مذکور بررسی شد.یافته ها: از 53.49 درصد نمونه های فاضلاب، انتروویروس غیر پولیوی و از 20.93 درصد ویروس پولیوی واکسن جدا شد. همچنین 9.52 درصد نمونه های مدفوع دارای ویروس پولیو واکسن و 14.28 درصد دارای انتروویروس غیر پولیوی بودند. از نمونه های مدفوع ویروس پولیوی تیپ 2 و از نمونه های فاضلاب ویروس پولیوی تیپ 1 جداسازی نشد.نتیجه گیری: نتایج این پژوهش تاییدی بر صحت پایش محیطی ویروس پولیو و ریشه کنی ویروس فلج اطفال در استان سیستان و بلوچستان می باشد.