سابقه و هدف: عفونت با ویروس هپاتیتC (HCV)، یکی از عوامل اصلی بیماری مزمن کبدی در سراسر جهان است. HCV یک ویروس انتقال یابنده از طریق خون و در نتیجه تهدیدی جدی برای سلامت عمومی است. تعیین ژنوتیپ های HCV نقش مهمی را در بررسی راه های انتقال عفونت ایفا می نماید. این پژوهش با هدف بررسی وجود تغییر در الگوی ژنوتیپ هایHCV در اهداکنندگان ایرانی انجام پذیرفت. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی از آذر ماه سال 1394 تا خرداد ماه 1396، 239 اهداکننده از سراسر کشور که دارای نتیجه مثبت در آزمایش تاییدی ویروسHCV بودند، مورد بررسی قرارگرفتند. از روش Semi nested PCR جهت تکثیر قسمتی از ناحیه NS5B ژنوم ویروس استفاده شد. محصول PCR، توالی یابی و ژنوتیپ HCVبا استفاده از نرم افزار(BLAST) Basic Local Alignment Search Tool تعیین شد. با استفاده از رسم درخت فیلوژنتیک، ژنوتیپ ها تایید شدند. برای تجزیه و تحلیل داده ها از نرم افزار آماری 13 STATA استفاده شد. یافته ها: از 239 شرکت کننده، در 106 فرد(3/6% ± 35/44%) ژنوتیپ تعیین و تایید شد. در درخت فیلوژنتیک، تمامی توالی های مورد مطالعه، 3 کلاستر جداگانه تشکیل دادند. سه ژنوتیپ 3a، 1a و 1b به ترتیب ژنوتیپ های رایج در اهداکنندگان ایران بودند. نتیجه گیری: به نظر می رسد طی دهه گذشته، اپیدمیولوژی مولکولی عفونت HCV در اهداکنندگان ایران از نظر تنوع ژنوتیپ تغییری نداشته است ولی تغییر در فراوانی ژنوتیپ ها و در نتیجه جابه جایی ژنوتیپ شایع 1a توسط ژنوتیپ 3a رخ داده است.