مقدمه: یکی از مهمترین علل شکست درمانهای اندودونتیک باقی ماندن و یا ادامه رشد میکروارگانیسم ها در سیستم پیچیده کانال ریشه و یا ناحیه پری رادیکولار می باشد. هدف از این مطالعه مقایسه خاصیت ضدمیکروبی هیپوکلریت سدیم، کلرهگزیدین کلوگونات و MTAD بر انتروکوکوس فکالیس در شرایط in vitro بود.روش کار: در این مطالعه تجربی هفتاد نمونه دندان انسان یک ریشه و تک کاناله انتخاب شدند. ابتدا با یک فایل متناسب با قطر کانال بقایای پالپی خارج و طول کانال تعیین گردید و پاکسازی شدند. سپس نمونه ها در داخل دستگاه اولترا سونیک و بعد از آن در اتوکلاو جهت استریل شدن قرار داده شدند. بعد از این مرحله کانال دندان ها به جز 5 مورد که به عنوان کنترل در نظر گرفته شدند. از سوسپانسیون خالص سلول های انتروکوکوس در شرایط آسپتیک پر شدند. کلیه نمونه ها در دستگاه انکوباتور و در دمای 37oC به مدت 4 هفته نگهداری شدند. بعد از این مرحله، به ترتیب یک میلی لیتر از محلولهای آزمایشی (%, NaOCL 2.5% MTAD, CHX 2) به وسیله سرنگ انسولین داخل کانال ها تزریق شده سپس نمونه ها در فلاسک های حاوی دو میلی لیتر از محلولهای فوق به مدت 5 دقیقه قرار گرفتند. برای بررسی میکروارگانیسم های مورد نظر از محیط کشت اختصاصی Bile Sculin Agar استفاده شد. برای تجزیه و تحلیل آماری به کمک نرم افزار SPSS از آزمون کروسکال-والیس استفاده شد.نتایج: در گروه MTAD در یک نمونه (5%) باکتری رشد کرده بود. این میزان در گروه هیپوکلریت سدیم 5/2%، 5 نمونه (25%) و در گروه مایع کلرهگزیدین 2%، 4 نمونه (20%) بود. مقادیر یاد شده با یکدیگر اختلاف آماری معنی داری نداشتند.نتیجه گیری: بر اساس نتایج این مطالعه in vitro هر سه محلول آزمایشی به طور قابل توجهی باعث از بین رفتن انتروکوکوس شدند ولی تفاوت معنی داری بین آنها وجود نداشت.