مقدمه: اطلاع از آسیب شناسی و اپیدمیولوژی اسهال حاد کودکان کمک بزرگی به پیشگیری و درمان بیماری مینماید. بر اساس مطالعات گذشته، ویروسها، باکتریها و انگلها عوامل اصلی اسهال کودکان هستند لذا این مطالعه با هدف جداسازی عوامل شایع باکتریایی اسهال حاد کودکان زیر ده سال و بررسی عوامل زمینهای آن و همچنین تعیین سروتایپ سویههای جدا شده انجام شد.مواد و روشها: این پژوهش بصورت توصیفی انجام گردیده و جامعه آماری آنرا تعداد 544 کودک 3 ماهه تا 10 سال شهر همدان و حومه تشکیل میدادند که با بیماری اسهال حاد به مراکز درمانی شهر جهت کشت مدفوع ارجاع داده میشدند. برای جداسازی اولیه پاتوژنهای معمول مانند شیگلا و سالمونلا از محیطهای اختصاصی و افتراقی سلنیت F و سالمونلاـ شیگلا آگار S.S) آگار) و برای اشریشیاکلی پاتوژن از محیط کشت ائوزین متیلن بلو (EMB) و برای یرسینیا آنتروکولیتیکا از محیط مایع فسفات بافر (PBS) و محیط اختصاصی سفسولیدین ـ ایرگازان نووبیوسین آگار (CIN agar) استفاده شد و برای شناسایی نهایی از تستهای افتراقی بیوشیمیایی و آنتی سرمهای اختصاصی پلی والان و منووالان استفاده شد. نتایج از پرسشنامهها استخراج و با استفاده از نرمافزار آماری EPI6 مورد آنالیز قرار گرفت. نتایج: از مجموع 544 نمونه آزمایش شده تعداد 134 نفر (24.6%) به یکی از باکتریهای پاتوژن آلوده بودند که بترتیب عبارت بودند از اشریشیاکلی انتروپاتوژن 88 (EPEC)مورد (65.8%)، شیگلاها 26 مورد (19.5%)، سالمونلاها 13 مورد (9.5%) و یرسینیا انتروکولیتیکا 7 مورد (5.2%). بر اساس نتایج سروتایپینگ، فراوانترین سروتایپ شناسایی شده عبارت بود از اشریشیا کلی 055 با 34 مورد (38.6%) کمترین سروتایپ عبارت بودند از اشریشیاکلی 0119 با 9 مورد (10.3%) و همچنین فراوانترین سروتیپ سالمونلاها نیز عبارت بود از سالمونلا پاراتیفیB و تیفی هر کدام 4 مورد (30.8%) و کمترین سروتیپ پاراتیفی C,A هر کدام یک مورد (7.7% ).نتیجهگیری: با توجه به نتایج بدست آمده در این مطالعه، شناخت و بررسی عوامل ایجادکننده اسهال کودکان در مناطق جغرافیایی مختلف به طور منظم و ادواری ضرورت داشته و بایستی علاوه بر جداسازی عوامل شناخته شده کلاسیک، عوامل نوظهور نیز با راهاندازی روشهای جدیدتر و تجهیز آزمایشگاه تشخیص طبی صورت گیرد.