شناسایی فلور دیاتومه ای و بررسی تغییرات جمعیتی آن ها در رودخانه هراز برای اولین بار، از فروردین تا اسفند ماه سال 1386 با نمونه برداری ماهیانه از 10 ایستگاه صورت گرفت و همراه با آن عوامل فیزیکوشیمیایی آب نظیر دما، PH، اکسیژن محلول (DO)، هدایت الکتریکی (EC) آب اندازه گیری شد. نمونه برداری از بسترهای سنگ و رسوب انجام گرفت. نمونه ها در محل توسط فرمالدئید %3 تثبیت شدند و در آزمایشگاه برای شناسایی بهتر دیاتومه ها اقدام به تمیز کردن سلول ها شد. در بررسی دیاتومه ها از روش شمارش استفاده شد که در این روش می توان فراوانی گونه ها را نیز مشخص کرد. در مجموع 33 گونه متعلق به 5 جنس از شاخه Bacillariophyta شناسایی گردید. Navicula با 21 گونه، Gyrosigma با 4 گونه، Fragilaria با 3 گونه، Cocconies, Achnanthes با 2 گونه, Achnanthidium با 1 گونه، شناسایی شدند.گونه های Navicula, Viridule, Navicula halaphila به عنوان گونه های غالب مشاهده شدند. بیشترین تراکم جمعیت در زمستان (دی و بهمن) مشاهده شد. نتایج آنالیز همبستگی اختلاف معنی داری را بین تراکم اجتماعات دیاتومه در ایستگاه های مختلف و زمان نمونه برداری نشان داد. همچنین آنالیز یاد شده نشان داد که بین متغیرهای فیزیکوشیمیایی آب و گونه های دیاتومه ارتباط معنی داری وجود دارد. به طور کلی کاهش تنوع دیاتومه ها از بالادست رودخانه به سمت پایین دست رودخانه نشانه ای از افزایش آلودگی و تاثیر آن بر ترکیب گونه ای و فراوانی دیاتومه در رودخانه هراز می باشد.