در این تحقیق قارچ عامل بیماری از طوقه های پوسیده فلفل جداسازی و Phytophthora capsiciتشخیص داده شد. در مجموع 151 جدایه باکتریایی از ریزوسفر گیاهان مختلف جدا شد که 37 جدایه متعلق به باکتریهای گرم مثبت و سودوموناسهای فلورسانت با استفاده از روش کشت متقابل توانایی آنتاگونیستی علیه قارچ P.capsici نشان دادند. از میان جدایه های آنتاگونیست 6جدایه با بیشترین تأثیر روی قارچ P.capsici جهت مطالعات بعدی انتخاب شد. براساس آزمونهای بیوشیمیایی، فیزیولوژیکی و مرفولوژیکی، جدایه های 1083 و Pseudomonas fluorescens,D و جدایه های 1061,2001,BS و Bacillus subtilis,703 تشخیص داده شدند. دو جدایه 1083 و D توانستند از طریق تولید آنتی بیوتیک و متابولیتهای فرار، از رشد میسلیوم قارچ P.capsici در شرایط آزمایشگاه جلوگیری نمایند. جدایه 1083 روی محیط کینگ ب (KB) حاوی 25 میکرومول کلرید آهن تولید سیدروفور نمود و از رشد قارچ Geotrichum candidum ممانعت نمود در حالیکه جدایه D در هیچیک از غلظت های کلرید آهن نتوانست تولید سیدروفور کند. در آزمایش اثر متابولیتهای مایع جدایه های B.subtilis روی قارچ P.capsici جدایه های BS و2001 بیشترین و جدایه 1061 کمترین تأثیر ر ادر جلوگیری از رشد میسلیوم قارچ فوق داشتند. متابولیتهای فرار کلیه جدایه های B.subtilis از رشد میسلیوم قارچ P.capsici ممانعت به عمل آوردند و میزان بازدارندگی هر یک از جدایه ها تحت تآثیر محیط کشت مورد استفاده بود. در آزمایش بررسی تولید سیانید هیدروژن (HCN) توسط جدایه های آنتاگونیست، تنها جدایه های P.fluorescens توانایی تولید سیانید هیدروژن را داشتند. در مجموع باکتریهای آنتاگونیست بخصوص جدایه های B.subtilis از کارایی مؤثری در جلوگیری از رشد میسلیوم قارچ عامل بیماری در محیط کشت برخوردار بودند.