مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

676
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

521
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

یک مدل ریاضی جدید برای مساله استنباط هاپلوتایپ ها از ژنوتایپ ها با معیار پارسیمونی

صفحات

 صفحه شروع 61 | صفحه پایان 77

چکیده

 مساله استنباط هاپلوتایپ ها از ژنوتایپ ها یکی از مسایل مهم حوزه ریاضیات زیستی است. اهمیت این مساله به دلیل کاربردهای فراوان آن در تشخیص و درمان بیماری های ژنتیکی همچون دیابت, آلزایمر و امراض قلبی است که موجب رقابت پژوهشگران در ارایه مدل های ریاضی بهتر و طراحی الگوریتم های کاراتر برای حل این مساله شده است. علی رغم پژوهش های فراوان, به دلیل NP-hard بودن مساله همچنان نیاز به ارایه مدل های جدید و یا بهبود روش های قبلی احساس می شود. استنباط هاپلوتایپ ها تحت معیارهای متفاوتی بیان می شود. پارسیمونی یکی از مهم ترین آن هاست و در این مقاله مساله با این معیار مورد بررسی قرار گرفته است. روش های حل مساله استنباط هاپلوتایپ ها از ژنوتایپ ها با معیار پارسیمونی به دو دسته دقیق و تقریبی تقسیم می شود. اغلب روش های دقیق مساله را به صورت یک مساله برنامه ریزی با اعداد صحیح فرمول بندی می کنند. اخیرا در مقاله ای یک مدل دقیق به نام HI Base-10 برای این مساله ارایه شده که ابتدا به هر هاپلوتایپ و ژنوتایپ یک عدد متناظر کرده و سپس مدل را بر اساس این اعداد تشکیل می دهد که درآن هیچ متغیر و قیدی متناظر جایگاه های هتروزیگوت به مساله تحمیل نمی شود. در این مقاله نیز با شیوه ای متفاوت به ژنوتایپ ها اعدادی متناظر کرده و بر اساس این اعداد یک مساله برنامه ریزی با متغیرهای دودویی و آمیخته می سازیم. در نتیجه این تبدیلات, مدل جدید, متغیر عدد صحیح نداشته و متغیرهای کم تری نسبت به HI Base – 10 دارد. به علاوه در مدل جدید هیچ متغیر و قیدی متناظر جایگاه های هموزیگوت وجود ندارد و متغیرها به جایگاه های هتروزیگوت اختصاص داده می شوند. با توجه به تعداد زیاد جایگاه های هموزیگوت در مقایسه با جایگاه های هتروزیگوت در داده های واقعی ارزش این مدل مشخص می-شود.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    فیض آبادی، رضا، و باقریان، مهری. (1397). یک مدل ریاضی جدید برای مساله استنباط هاپلوتایپ ها از ژنوتایپ ها با معیار پارسیمونی. تحقیق در عملیات در کاربردهای آن (ریاضیات کاربردی)، 15(4 (پیاپی 59) )، 61-77. SID. https://sid.ir/paper/164490/fa

    Vancouver: کپی

    فیض آبادی رضا، باقریان مهری. یک مدل ریاضی جدید برای مساله استنباط هاپلوتایپ ها از ژنوتایپ ها با معیار پارسیمونی. تحقیق در عملیات در کاربردهای آن (ریاضیات کاربردی)[Internet]. 1397؛15(4 (پیاپی 59) ):61-77. Available from: https://sid.ir/paper/164490/fa

    IEEE: کپی

    رضا فیض آبادی، و مهری باقریان، “یک مدل ریاضی جدید برای مساله استنباط هاپلوتایپ ها از ژنوتایپ ها با معیار پارسیمونی،” تحقیق در عملیات در کاربردهای آن (ریاضیات کاربردی)، vol. 15، no. 4 (پیاپی 59) ، pp. 61–77، 1397، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/164490/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا