مقایسه ی نواحی ژنی ITS-rDNA و tef1α در بررسی ارتباط تبارزایی بعضی گونه های Trichoderma

Q: چگونه مقاله دانلود کنم؟

برای دانلود مقاله از SID، ابتدا وارد سایت شوید، عنوان مقاله را جستجو کرده و بر روی گزینه 'دانلود مقاله' کلیک کنید.

Q: چگونه مقاله ISI دانلود کنم؟

برای دانلود مقاله ISI در SID، کلمه کلیدی یا عنوان مقاله را در نوار جستجو وارد کرده و نتایج مرتبط را مشاهده کنید. سپس روی مقاله مورد نظر کلیک کرده و گزینه 'دانلود مقاله' را انتخاب کنید.

Q: چگونه میتوانم به پایگاه داده SID دسترسی داشته باشم؟

برای دسترسی به پایگاه داده SID، وارد سایت SID.ir شوید، یک حساب کاربری ایجاد کنید و سپس با ورود به حساب خود به منابع علمی دسترسی پیدا کنید.

Q: آیا دانلود مقاله از SID رایگان است؟

بعضی از مقالات در SID بهصورت رایگان در دسترس هستند، اما برخی دیگر نیاز به پرداخت هزینه دارند. اطلاعات بیشتر در صفحه مقاله مشخص شده است.

مهرابی کوشکی مهدی; باورساد مریم; فرخی نژاد رضا; جمشیدی مهدی; علی محمدی اشکان

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

نشریه: دانش گیاهپزشکی ایران
:1395 | دوره:47 | شماره:1
صفحات :61-70

دانلود متن کامل

نسخه انگلیسی

بازدید:

546

دانلود:

581

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

مقایسه ی نواحی ژنی ITS-rDNA و tef1α در بررسی ارتباط تبارزایی بعضی گونه های Trichoderma

نویسندگان

کلیدواژه

TrichodermaQ2

ITSQ2

tef1αو درست نمایی بیشینهQ2

چکیده

جنس Trichoderma قارچی تک نیائی است که بعضی از گونه های آن به عنوان عامل کنترل زیستی (بیوکنترل) شناخته می شوند. در این بررسی, یازده جدایه از هفت گونه ی Trichoderma شامل Trichoderma harzianum, T. capillare, T. pleuroticola, T. asperellum, T. koningiopsis, T. brevicompactum و T. virens برای بررسی ارتباط تبارزایی (فیلوژنتیکی) آن ها با یکدیگر و با توالی گونه های مرجع ثبت شده در بانک ژن و ISTH استفاده شد. توده ی میسیلیومی رشدکرده در محیط PDB با استفاده از کاغذ صافی گرد آوری و پس از خشک- انجماد کردن, DNA ژنگانی (ژنومی) آن استخراج شد. نواحی ITS-rDNA و اینترون 2, 3 و 4 از tef1α با استفاده از آغازگرهای عمومی و اختصاصی افزایش و توالی یابی شدند. بررسی تبارزایی با الگوریتم درست نمایی بیشینه و انتخاب مناسب ترین مدل جانشینی نوکلئوتیدی با استفاده از نرم افزار MEGA 6 انجام شد. همه ی درختان تبارزایی حاصل, کلاد های معتبری برای بیشتر جدایه ها تولید کردند که ارتباط به نسبت یکسانی را از آن ها نشان داد. در همه ی درختان تبارزایی به جز درخت مبتنی بر داده های حاصل از توالی یابی ناحیة ITS, جدایه هایT. koningiopsis و T. asperellum یک کلاد قاعده ای معتبر ایجاد کردند. نتیجه ی بررسی تبارزایی که بر پایه ی توالی نواحی مختلف tef1α , اینترون 2 و3, اینترون 4 و هر سه اینترون, برای گونه های T. brevicompactum, T. virens, T. koningiopsis و T. pleuroticola به دست آمد کلاد های معتبرتری نسبت به درخت حاصل از تجزیه ی توالی های ITS نشان داند. تجزیه و تحلیل درست نمایی بیشینه که بر پایه ی توالی اینترون 4 از tef1α انجام شد, کلادهای معتبری برای بیشتر جدایه هایTrichoderma ازجمله T. asperellum ایجاد کرد. این نتایج تأیید می کند که تبارزایی مبتنی بر اینترون 4 از tef1α گروه بندی تبارزایی مناسبی برای گونه های تریکودرما فراهم می کند.

استنادها

ثبت نشده است.

ارجاعات

ثبت نشده است.

استناددهی

APA: کپی

مهرابی کوشکی، مهدی، باورساد، مریم، فرخی نژاد، رضا، جمشیدی، مهدی، و علی محمدی، اشکان. (1395). مقایسه ی نواحی ژنی ITS-rDNA و tef1α در بررسی ارتباط تبارزایی بعضی گونه های Trichoderma. دانش گیاهپزشکی ایران (علوم کشاورزی ایران)، 47(1 )، 61-70. SID. https://sid.ir/paper/171572/fa

Vancouver: کپی

مهرابی کوشکی مهدی، باورساد مریم، فرخی نژاد رضا، جمشیدی مهدی، علی محمدی اشکان. مقایسه ی نواحی ژنی ITS-rDNA و tef1α در بررسی ارتباط تبارزایی بعضی گونه های Trichoderma. دانش گیاهپزشکی ایران (علوم کشاورزی ایران)[Internet]. 1395؛47(1 ):61-70. Available from: https://sid.ir/paper/171572/fa

IEEE: کپی

مهدی مهرابی کوشکی، مریم باورساد، رضا فرخی نژاد، مهدی جمشیدی، و اشکان علی محمدی، “مقایسه ی نواحی ژنی ITS-rDNA و tef1α در بررسی ارتباط تبارزایی بعضی گونه های Trichoderma،” دانش گیاهپزشکی ایران (علوم کشاورزی ایران)، vol. 47، no. 1 ، pp. 61–70، 1395، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/171572/fa

مقالات مرتبط نشریه ای