مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

769
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

0
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

ژنوتایپینگ جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه RAPD-PCR

صفحات

 صفحه شروع 131 | صفحه پایان 139

چکیده

 مقدمه: استرپتوکوکوس پیوژنز بیماری های عفونی و غیرعفونی متنوعی را ایجاد می کند. تایپینگ جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز یکی از ابزارهای ضروری در مطالعات اپیدمیولوژی مربوط به این باکتری هستند. RAPD-PCR یک تکنیک تایپینگ بر اساس PCR و روشی سریع, ارزان, آسان است. مشکل اصلی این روش تکرارپذیری کم نتایج است که با بهینه سازی پروتکل RAPD حل خواهد شد. مواد و روش ها: در این مطالعه بهینه سازی پروتکل RAPD-PCR شامل روش استخراج DNA, نوع پرایمر, غلظت ترکیبات PCR و برنامه PCR با استفاده از طراحی فاکتوریال آزمایش ها برای استرپتوکوکوس پیوژنز ATCC 19615 به عنوان سویه استاندارد انجام شد. سپس 16 جدایه استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه ژنوتایپ شدند. تایپ پذیری, تکرارپذیری و قدرت افتراق پروتکل بهینه تعیین شد. نتایج: از سه روش استخراج DNA, روش ست بافر تغییر یافته و از هفت پرایمر, پرایمر P14 انتخاب شدند. غلظت های بهینه ترکیبات PCR, 3 mM MgCl2, 150 pmol primer P14, 0. 2 mM dNTPs, 10 ng template DNA و 2 U Taq DNA polymerase بودند. برنامه بهینه PCR از دناتوراسیون اولیه min 4 در C° 94 و 45 چرخه شامل min 1 در C° 94, min 2 در 31, min 2 در C° 72 و min 10 در C° 72 برای تکثیر پایانی تشکیل شد. استرپتوکوکوس پیوژنز ATCC 19615 و همه جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه تایپ پذیر بودند و نتایج RAP-PCR آن ها تکرارپذیر بود. قدرت افتراق محاسبه شده بسیار مطلوب بود (DI = 1). 16 جدایه استرپتوکوکوس پیوژنز متعلق به 16 سویه بودند که در سه کلاستر اصلی با سطح تشابه 14 درصد طبقه بندی شدند. بحث و نتیجه گیری: با بهینه سازی صحیح شرایط RAPD-PCR, یک پروتکل مناسب و تکرارپذیر برای ژنوتایپینگ جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز به دست آمد. پروتکل بهینه به دست آمده در این پژوهش را می توان برای انجام RAPD-PCR در مطالعات اپیدمیولوژی جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز استفاده نمود. متن کامل این مقاله به زبان انگلیسی می باشد. لطفا برای مشاهده متن کامل مقاله به بخش انگلیسی مراجعه فرمایید.لطفا برای مشاهده متن کامل این مقاله اینجا را کلیک کنید.">اینجا را کلیک کنید.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    رحیمی مقدم، اکرم، سلمان زاده اهرابی، سیاوش، فلسفی، طاهره، سیفعلی، مهوش، و پوررمضان، زهرا. (1398). ژنوتایپینگ جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه RAPD-PCR. زیست شناسی میکروارگانیسم ها، 8(32 )، 131-139. SID. https://sid.ir/paper/237333/fa

    Vancouver: کپی

    رحیمی مقدم اکرم، سلمان زاده اهرابی سیاوش، فلسفی طاهره، سیفعلی مهوش، پوررمضان زهرا. ژنوتایپینگ جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه RAPD-PCR. زیست شناسی میکروارگانیسم ها[Internet]. 1398؛8(32 ):131-139. Available from: https://sid.ir/paper/237333/fa

    IEEE: کپی

    اکرم رحیمی مقدم، سیاوش سلمان زاده اهرابی، طاهره فلسفی، مهوش سیفعلی، و زهرا پوررمضان، “ژنوتایپینگ جدایه های استرپتوکوکوس پیوژنز با استفاده از پروتکل بهینه RAPD-PCR،” زیست شناسی میکروارگانیسم ها، vol. 8، no. 32 ، pp. 131–139، 1398، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/237333/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button