آلودگی قارچی می تواند باعث تلفات و کاهش درصد تفریخ در تخم آزادماهیان گردد. در ایران، در اغلب مراکز تکثیر هنوز هم از مالاشیت سبز جهت کنترل قارچ زدگی تخمها استفاده می شود. ولی، با توجه به اثرات نامطلوب مالاشیت سبز مانند سرطانزایی، ضروری است از مواد مطلوب شیمیایی دیگر نظیر فرمالین که در چند سال اخیر به عنوان داروی مناسب معرفی شده است، استفاده گردد. در این تحقیق فرمالین با دو غلظت 1000 و 1500 میکرولیتر بر لیتر، مالاشیت سبز با غلظت متعارف کارگاه (5/1 میلی گرم در لیتر) و تیمار کنترل (شاهد) بدون استفاده از دارو، جهت ارزیابی قارچی شدن تخم ها در نظر گرفته شدند. هر تیمار شامل 3 تکرار و هر تکرار شامل 1000 عدد تخم بود. از مدت زمان 48 ساعت پس از لقاح، تیمار دارویی با فرمالین و مالاشیت سبز به صورت یک روز در میان تا 4 روز قبل از تفریخ به مدت 15 دقیقه انجام شد. در پایان آزمایش، بر اساس آزمون واریانس یکطرفه و دانکن، میزان قارچ زدگی تخمها در تیمار مالاشیت سبز نسبت به سایر تیمارها کمتر بود و با آنها اختلاف معنی داری داشت (p£0.05). میزان چشم زدگی در تیمار فرمالین با غلظت 1500 میکرولیتر بر لیتر نسبت به تیمارهای مالاشیت سبز و تیمار شاهد بیشتر و دارای اختلاف معنی دار بود (p£0.05)، ولی نسبت به تیمار فرمالین با غلظت 1000 میکرولیتر بر لیتر دارای اختلاف معنیدار نبود (p>0.05). میزان تفریخ در تیمار فرمالین با غلظت 1500 میکرولیتر بر لیتر نسبت به تیمار مالاشیت سبز دارای اختلاف معنیدار بود (p£0.05). در نهایت، میزان ناهنجاری لاروی در هیچ کدام از تیمارها اختلاف معنی دار نداشت (p>0.05).