در این تحقیق گیاهان آبزی برخی از اکوسیستم های آبی مهم استان خوزستان در سال های 89-87 بررسی شد. در منطقه مورد مطالعه 50 گونه گیاهی، متعلق به 32 جنس و 24 خانواده شناسایی شدند. غالب ترین گونه های آبزی غوطه ور در این منطقه Ceratophyllum demersum،Najas marina و Potamogeton crispus می باشند که گونه سراتوفیلوم در بیشتر کانال ها و آبگیرهای استان خوزستان وجود دارد و توده های وسیعی را در کانال های آبرسانی استخرهای پرورش ماهیان گرمابی و کشاورزی تشکیل می دهد. گونه های Typha laxmanni و Polygonum cespitosum،Phragmites australis و Cyperus pygmaeus در حاشیه آب ها و مناطق مردابی اجتماعات وسیعی را تشکیل می دهند. خانواده Potamogetonaceae،Cyperaceae و سپس Polygonaceae و Juncaceae بیشترین آمار را در بین خانواده های گیاهی آبزی مورد مطالعه به خود اختصاص داده بودند. در منطقه حفاظت شده بیشه عباس آباد شهرستان دزفول، گونه های آبزی بیشترین تنوع را به خود اختصاص داده بود که جنس پوتاموژتون با 5 گونه Potamogeton crispus، P.nodosus، P.perfoliatus و P.illiniensis و P.pectinatus بالاترین تنوع را داشت. در اکوسیستم های آبی حوزه شوش تا اهواز (ایستگاه شاوور) بیشترین تنوع مربوط به گونه Polygonum hydropiper بود. در اکوسیستم های آبی اطراف شهر اهواز (ایستگاه رودخانه کارون) بیشترین تنوع گیاهی آبزی مربوط به گیاهان بن در آب Phragmites australis بود. در تالاب شادگان بیشترین تنوع گیاهی مربوط به گونه های Cyperus pygmaeus ,Phragmites australis و Scripus lariaceae و جنس Juncus بود. از لحاظ تعلق جغرافیای گیاهی، گونه های ایرانی- تورانی با 24 درصد بیشترین تنوع را داشت و بیشترین طیف زیستی منطقه با 13 درصد متعلق به هیدروفیت ها بود.