افت ناشی از همخونی، پدیده ای مضر در حیوانات اهلی است که ناشی از پرورش خویشاوندی است. پرورش خویشاوندی تلاقی های متوالی بین دو فرد است که رابطه خویشی آنها بیش از میانگین جامعه است و منجر به کاهش شایستگی فرزندان و تنوع ژنتیکی در جامعه می شود. گسترش آرایه های جهش تک نوکلئوتیدی متراکم اندازه گیری همخونی را با داده های مولکولی از طریق محاسبه اتوزایگوسیتی در ژنوم افراد آسان ساخته است. اتوزایگوسیتی به قطعه کروموزمی اتلاق می شود که یکسان اجدادی باشد و می تواند از طریق رشته های هموزیگوت اندازه گیری شود. بنابراین ROH مناطق هموزایگوت بهم پیوسته ای است که دو هاپلوتیپ به ارث رسیده از والدین در آن محل یکسان اجدادی اند. طول و فراوانی ROH می تواند تاریخچه، گلوگاه ژنتیکی و نشانه های انتخاب را در جامعه تعیین کند. ضریب خویشاوندی نیز می تواند از طریق ROH تعیین شود (FROH)، که در قالب کل طول ROH به طول ژنوم تعریف می شود. مطالعات زیادی سطح همخونی را از طریق FROH در گاو، خوک، گوسفند، مرغ و سایر حیوانات مزرعه ای از طرق آرایه های جهش تک نوکلئوتیدی بدست آورده اند. در بیشتر این مطالعات صحت و دقت FROH در مقایسه با FPED تایید شده است. برخی افت ناشی از همخونی را با FROH برآورد کرده اند و برخی ارتباط بین محل ROH را با موقعیت QTL ها و ژنها ارزیابی کرده اند. این مطالعات نشان دادند که سطح همخونی در جمعیت های خوکی و گاوی بسیار بیشتر از انسان است. اگر چه بیشتر تحقیقات نتیجه گرفتند که FROH می تواند همخونی را به دقت اندازه گیری کند و در هنگام عدم دسترسی به شجره مفید باشد. اما نگرانی های در رابطه با تراکم پانل ها، خطای تعیین ژنوتیپ و عدم شناسایی هتروزیگوسیتی در درون ROH بهم پیوسته که تعیین و تشخیص ROH را دشوار می کند وجود دارد. این مقاله به تعریف ROH و بحث در مورد جزئیات آن در انسان و حیوانات اهلی می پردازد.
متن کامل این مقاله به زبان انگلیسی می باشد، لطفا برای مشاهده متن کامل مقاله به بخش انگلیسی مراجعه فرمایید.
لطفا برای مشاهده متن کامل این مقاله اینجا را کلیک کنید.