زمینه و هدف: بیماری کیست هیداتیک یکی از مهم ترین بیماری های مشترک بین انسان و دام در بسیاری از نقاط دنیا است که توسط مرحله لاروی اکینوکوکوس گرانولوزوس اتفاق می افتد. شناسایی ژنوتیپ های مختلف ایزوله های انگل، میزبانان مرتبط و مسیرهای انتقال آن ها حایز اهمیت است. تاکنون تعداد 10 ژنوتیپ مختلف (G1-G10) بر پایه آنالیز مارکرهای ژنتیکی هسته و میتوکندری در مناطقی از جهان و ایران توصیف شده است. این مطالعه با هدف تعیین ژنوتیپ ایزوله های حیوانی و انسانی کیست هیداتیک در استان زنجان انجام شد.روش بررسی: تعداد 86 نمونه شامل 49 نمونه گوسفندی، 28 نمونه گاوی از کشتارگاه و 9 نمونه انسانی کیست هیداتیک از بیمارستان های استان زنجان جمع آوری شد. پس از استخراج DNA ژنومی، ناحیه rDNA-ITS1 توسط PCR تکثیر و محصول به دست آمده با روش PCR-RFLP آنالیز گردید.یافته ها: اندازه قطعه ITS1 تکثیر یافته حدود1000bp به دست آمد. الگوهای قطعات به دست آمده از محصول PCR ناحیه rDNA-ITS1 بعد از برش با آنزیم های Msp1, Rsa1, Alu1 و Taq1 نشان داد که تمامی نمونه ها منطبق با استرین شایع گوسفندی هستند.نتیجه گیری: در این منطقه، استرین غالب اکینوکوکوس گرانولوزوس در دام ها و انسان همانند سایر مناطق مطالعه شده ایران، ژنوتیپ G1 یا همان استرین شایع گوسفندی است.