شناسایی فلور سیانوباکتریایی و بررسی تغییرات جمعیتی آن ها در شالیزاری نمونه در کلات از اردیبهشت تا شهریور 1386 در طول دوره رشد برنج با نمونه برداری خاک در چهار مرحله صورت گرفت و همراه با آن عوامل فیزیکوشیمیایی مانند EC و pH و دما اندازه گیری شد. در مجموع، 23 گونه مربوط به 8 جنس از 5 خانواده شناسایی شدند؛ از خانواده Chroococcaceae جنس های Chroococcus Nägeli, Gloeothece Nägeli, Aphanothece Nägeli و از خانواده Oscillatoriaceae جنس Oscillatoria Gomont و از خانواده Rivulariaceae جنس Calothrix C.Agardh و از خانواده Nostocaceae جنس های Cylindrospermum Kützing, Nostoc Vaucher, Anabaena Bory و از خانواده Scytonemataceae جنس Scytonema C.Agardh. در خصوص نمونه های هتروسیست دار، فراوان ترین گونه ها متعلق به جنس Nostoc بود. تغییرات pH در 4 مرحله نمونه برداری قلیایی بود و تغییرات معنی داری را نشان نداد. تعداد کلنی با pH رابطه مستقیمی نداشت. برخلاف آن EC رابطه مستقیمی با تعداد کلنی را نشان داد. در خصوص دما، بیش ترین تعداد کلنی در کم ترین دما مشاهده شد.