مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

404
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

484
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

ارزیابی بیولوژیکی کروناویروس ها و مطالعه داکینگ مولکولی، لینالول و تیمول به عنوان مهارکننده پروتئین orf1ab و نقش ویروسSARS-CoV-2 در بیوتروریسم

صفحات

 صفحه شروع 77 | صفحه پایان 96

چکیده

 مقدمه: کروناویروس ها جزء ویروس های پوشش دار با منشا جانوری هستند که علاوه بر بیماری تنفسی و گوارشی, در بیماری های عصبی نیز دیده شده اند؛ همچنین برخی از گونه های آن سبب نفریت گشته و یا در بیماران مبتلا به ام اس و هپاتیت موش نیز دیده شده اند؛ اما در مجموع, مهم ترین تاثیر کروناویروس ها بر سیستم تنفسی و گوارشی است. هدف از تحقیق حاضر مقایسه ژنوم ویروس SARS-CoV-2 با سایر ویروس های خانواده کروناویروس, بررسی احتمال ساختگی بودن آن و درنهایت, ارزیابی تاثیر لینالول و تیمول بر فعالیت نداشتن پروتیین orf1ab ویروس SARS-CoV-2 است. مواد و روش ها: توالی ژنوم ویروس های خانواده Coronaviridae از پایگاه NCBI تهیه و پس از هم ردیف شدن, تعداد جهش ها, تنوع نوکلیوتیدی, تعداد جایگاه هایی که در آن ها جایگزینی مشابه اتفاق افتاده, خوشه بندی, تعیین شباهت و فاصله ژنتیکی و شاخص dN/dS ارزیابی شد. ساختار سه بعدی پروتیین orf1ab پیش بینی و دقت الگوی پیش بینی شده بررسی گردید. موتیف و دومین های حفاظت شده برای ژن orf1ab در همه ویروس های خانواده Coronaviridae و همچنین دومین های غشایی, سیتوپلاسمی و کینازی در orf1ab ویروس SARS-CoV-2 بررسی شد. برای داکینگ مولکولی, از لینالول (مهم ترین ماده تشنه داری Scrophularia striata) گیاه مدل یعنی آرابیدوپسیس و تیمول (Thymol) (مهم ترین ماده زنیان) برای فعالیت نداشتن پروتیین orf1ab کروناویروس SARS-CoV-2 استفاده گردید. یافته های پژوهش: ویروس SARS-CoV-2, 11 دومین حفاظت شده و از سویی, 11 ژن دارد. حضور دومین های NSP13 super family و SUD-M super family در ژنوم ویروس SARS-CoV-2, نشان دهنده توانایی و تلاش این ویروس برای پایداری بیشتر در محیط است. بر اساس مقدار عددی شاخص های dN/dS (036/1) و Tajima s D (39/4) برای orf1ab, شیب تغییرات در طول تکامل برای ژن orf1ab بسیار کند و عدم انتخاب جهت دار در تغییرات ویروس ها است. بر اساس بیشترین اثر متقابل میان پروتیین لینالول و پروتیین orf1ab (0/41-) و بیشترین دقت (172/0) و بر اساس کمترین سطح انرژی (Kcal/mol23/6-Δ G=) و بهترین ترکیب (Kcal/mol18/1340-Full Fitness=) میان ماده فیتوشیمیایی تیمول و پروتیین orf1ab, نتایج داکینگ مولکولی نشان داد که هم پروتیین لینالول و هم ماده تیمول بر پروتیین orf1ab پیوند گردیده و مانع فعالیت آن خواهند شد. بحث و نتیجه گیری: لینالول و تیمول بر فعالیت نداشتن پروتیین orf1ab ویروس SARS-CoV-2 موثر بوده اند, هرچند برای اثبات این قضایا, باید تست بالینی خاصیت درمانی لینالول و تیمول انجام و در صورت تایید, استفاده از آن پیشنهاد شود. ضمنا با بررسی شاخص dN/dS, شاخص D و ارزیابی سینگلتن ها, دومین ها و مناطق حفاظت شده همه ویروس ها مشخص شد که ویروس SARS-CoV-2 نمی تواند ساختگی باشد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

    استناددهی

    APA: کپی

    فاضلی نسب، بهمن. (1399). ارزیابی بیولوژیکی کروناویروس ها و مطالعه داکینگ مولکولی, لینالول و تیمول به عنوان مهارکننده پروتئین orf1ab و نقش ویروسSARS-CoV-2 در بیوتروریسم. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام، 28(6 )، 77-96. SID. https://sid.ir/paper/414882/fa

    Vancouver: کپی

    فاضلی نسب بهمن. ارزیابی بیولوژیکی کروناویروس ها و مطالعه داکینگ مولکولی, لینالول و تیمول به عنوان مهارکننده پروتئین orf1ab و نقش ویروسSARS-CoV-2 در بیوتروریسم. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام[Internet]. 1399؛28(6 ):77-96. Available from: https://sid.ir/paper/414882/fa

    IEEE: کپی

    بهمن فاضلی نسب، “ارزیابی بیولوژیکی کروناویروس ها و مطالعه داکینگ مولکولی, لینالول و تیمول به عنوان مهارکننده پروتئین orf1ab و نقش ویروسSARS-CoV-2 در بیوتروریسم،” مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام، vol. 28، no. 6 ، pp. 77–96، 1399، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/414882/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.
  • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا