مجله میکروب شناسی پزشکی ایران
سال:1396 | دوره:11 | شماره:2 |تعداد مقالات:13

زمینه و اهداف: سالمونلوزیس یکی از بیماری های مهم عفونی و به عنوان یک بیماری مشترک در انسان و حیوانات می باشد که اهمیت شناخت و کنترل این گونه را ضروری تر می کند. ژن های خانه دار، ژن هایی هستند که به طور معمول برای حفظ و بقای عملکرد سلول ها ضروری می باشند و می توانند به عنوان ژن های تشخیصی در غربالگری عوامل باکتریایی مدنظر قرار گیرند. هدف از این مطالعه بررسی ژن های خانه دار flic، sdf1 و fljB برای غربالگری سرووارهای تیفی موریوم، انتریتیدیس و اینفنتیس سالمونلا می باشد.مواد و روش کار: در یک مطالعه توصیفی از بهمن ماه سال 1393 تا مردادماه سال 1394، 132 نمونه از بیماران مبتلا به اسهال و استفراغ حاد مراجعه کننده به مراکز درمانی و بیمارستان های مختلف کرمان گرفته شد. نمونه ها برای شناسایی سالمونلا با روش های استاندارد سرولوژی و باکتریولوژی به آزمایشگاه میکروبیولوژی منتقل شدند. DNA سویه های جنس سالمونلا به روش CTAB استخراج و در آزمون PCR از پرایمرهای اختصاصی ژن های خانه دار جنس سالمونلا (invA) و سروتیپ های تیفی موریوم (fliC)، اینفنتیس (fljB) و انتریتیدیس (sdfI) استفاده گردید.یافته ها: با استفاده از روش PCR حضور جنس سالمونلا با تکثیر ژن invA در 130 نمونه از 132 نمونه تاییدشده سالمونلا با روش های میکروبی و تست های بیوشیمیایی (98 درصد) تایید گردید. همچنین نتایج نشان دهنده شیوع 19 درصدی سالمونلا اینفنتیس، 22 درصدی سالمونلا تیفی موریوم و 32 درصدی سالمونلا انتریتیدیس بود.نتیجه گیری: نتایج حاکی از این بود که در این منطقه شیوع سالمونلا انترتیدیس نسبت به سایر سرووارها بیشتر است، اما شیوع سالمونلا تیفی موریوم و اینفنتیس همانند آمارهای جهانی در حال افزایش می باشند.

زمینه و اهداف: استرپتوکوکوس پنومونیه (پنوموکوک) باکتری بیماری های گرم- مثبت است که عامل ایجاد پنومونی، سپتی سمی، مننژیت، عفونت گوش میانی، سینوزیت، برونشیت، باکتریمی و سایر پروسه های عفونی معرفی شده است. با توجه به اهمیت بالینی این باکتری و جداسازی و تشخیص درست و به موقع آن از نمونه های بیماران، این مطالعه به منظور شناسایی و جداسازی سویه های پنوموکوک از نمونه های بالینی به روش های کشت و PCR انجام شده است.مواد و روش کار: د ر این مطالعه تعداد 175 نمونه بالینی مختلف از بیماران بستری در بیمارستان های شهر تهران طی مدت 3 سال (1394-1392)، جمع آوری و از روش های کشت و PCR (پس از استخراج ژنوم و در حضور پرایمر اختصاصی)، برای جداسازی و شناسایی سویه های پنوموکوک در کنار سویه استاند ارد 49619 ATCC (به عنوان کنترل) استفاده گردید.یافته ها: در این تحقیق، تعداد 40 سویه پنوموکوک به روش های کشت و PCR شناسایی و مورد تایید قرار گرفته است. آمپلیکون تکثیرشده در این تحقیق یک قطعه 160 جفت بازی بود که در همه سویه های استرپتوکوکوس پنومونیه یافت گردید. نتیجه تعیین توالی نیز محصول PCR را تایید نمود.نتیجه گیری: طبق نتایج به دست آمده در این مطالعه، PCR همانند کشت، روشی مطمئن اما نسبتا سریع تر از آن ارزیابی شده است که در آینده می تواند جایگزین روش های قدیمی و متداول (آزمایش های بیوشیمیایی و کشت) گردد.

زمینه و اهداف: آزمون پوستی توبرکولین روش رایجی برای تشخیص سل نهفته است، ولی نتایج مثبت و منفی کاذب زیادی دارد. در آزمون کوآنتی فرون میزان اینترفرون گامای مترشحه از لنفوسیت ها در پاسخ به آنتی ژن های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس سنجیده می شود. این مطالعه به منظور تعیین میزان توافق نتایج کوآنتی فرون با اندوراسیون پوستی توبرکولین در تشخیص سل نهفته سالمندان انجام شد.مواد و روش کار: این مطالعه در سال 1394 روی 30 سالمند دارای علائم سل نهفته، 50 سالمند سالم و 10 سالمندی که سل آنها به طور قطعی اثبات شده بود در دانشگاه علوم پزشکی ایران انجام گردید. میزان اینترفرون گامای مترشحه از لنفوسیت های T اختصاصی خون محیطی با آزمون کوآنتی فرون سنجیده شد. بعلاوه تست پوستی توبرکولین به روش استاندارد انجام شد و میزان اندوراسیون پوستی اندازه گیری شد. با ترسیم منحنی ROC، حساسیت، ویژگی و سطح زیر منحنی (AUC) آزمون های رهاسازی اینترفرون گاما و توبرکولین محاسبه شد. نتایج بیماران و افراد سالم با آزمون کروسکال والیس مقایسه گردید.یافته ها: حساسیت و ویژگی آزمون رهاسازی اینترفرون گاما برای سل فعال در بیماران مسن به ترتیب 100% و 98% بود (سطح زیر منحنی 0.99) در حالی که حساسیت و ویژگی آزمون توبرکولین بترتیب 80% و 94% بود (سطح زیر منحنی 0.89). در رابطه با افراد مسن مبتلا به سل نهفته، حساسیت و ویژگی آزمون رهاسازی اینترفرون گاما 73% و 98% و حساسیت و ویژگی آزمون توبرکولین به ترتیب 36% و 94% بود.نتیجه گیری: آزمون کوانتی فرون حساسیت و ویژگی بیشتری برای تشخیص سل نهفته نسبت به آزمون توبرکولین دارد و بکارگیری آن تشخیص سل نهفته را در افراد مسن قابل اطمینان تر می کند.

زمینه و اهداف: مایکوباکتریوم آویوم زیرگونه پاراتوبرکلوزیس (MAP)، عامل به وجود آورنده پاراتوبرکلوزیس است که به عنوان بیماری یون نیز نامیده می شود و علت ضررهای اقتصادی جبران ناپذیر در صنعت دامپروری به حساب می آید. جهت تشخیص آلودگی به پاراتوبرکلوزیس، الیزای غیرمستقیم به عنوان یک روش ساده با حساسیت و ویژگی بالا بیشتر مورد توجه بوده است. از این رو هدف از این مطالعه طراحی یک سیستم الیزای غیرمستقیم جهت تشخیص بیماری پاراتوبرکلوزیس می باشد.مواد و روش کار: تعداد 100 نمونه سرم از 10 گله در سال 1394 در استان های تهران و البرز که پاراتوبرکلوزیس توسط کشت در آن ها به اثبات رسیده با کیت استاندارد مورد مطالعه قرار گرفت و سیستم داخلی مطابق کیت استاندارد طراحی گردید. جهت طراحی سیستم الیزا با استفاده از پادگن های ترشحی، سرم مثبت و منفی واقعی پلیت متقاطع تیتراسیون انجام گرفت. جهت تعیین حد آستانه از نتایج کیت خارجی به عنوان استاندارد طلایی استفاده شد.یافته ها: با در نظر گرفتن نتایج (15 نمونه مثبت و 85 نمونه منفی) در ارزیابی های کیت تجاری، بهترین غلظت پادگن و رقت پادتن در سیستم طراحی شده به ترتیب 1.2 میکروگرم و 1.100 به ترتیب در هر چاهک ارزیابی شد. علاوه بر این، میزان حد آستانه برابر با 0.44 مشخص گردید. حساسیت و ویژگی به ترتیب 100 و 70 درصد ارزیابی شد.نتیجه گیری: پادگن های ترشحی مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس حساسیت لازم را جهت تشخیص بیماری ایجاد می کنند، اما تشخیص باکتری از مدفوع در مراحل اولیه بیماری، مشکل است. بنابراین با استفاده از الیزای غیرمستقیم طراحی شده می توان پادتن را در مراحل اولیه بیماری ردیابی کرد.

زمینه و اهداف: در این مطالعه باکتریوفاژ لیتیک موثر بر اشریشیا کلی مقاوم به درمان جداشده از نمونه زخم بیماران مبتلابه دیابت نوع دو جداسازی گردید.مواد و روش کار: دو نمونه مختلف از زخم بیماران بستری در بیمارستان رازی رشت گرفته شد و سویه های اشریشیا کلی جداسازی شده با روش های استاندارد شناسایی شدند. نمونه برداری از فاضلاب همان بیمارستان برای جداسازی فاژ لیتیک انجام شد. از روش آگار دولایه برای جداسازی و مشاهده پلاک استفاده گردید. برای تعیین واکنش کراسینگ فاژ روی سویه های باکتری جداسازی شده و 5 سویه استاندارد اشریشیا کلی انجام گردید. درنهایت برای تایید و بررسی مرفولوژیکی از میکروسکوپ الکترونی گذاره استفاده شد. مورفوتیپ و خانواده فاژ جداشده بر اساس طبقه بندی Bradley و نسخه نهایی گزارش International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV))، به ترتیب مشخص گردید.یافته ها: نتایج نشان داد که باکتری های جداشده مقاومت بالایی در برابر آنتی بیوتیک های استفاده شده دارند. بر مبنای خصوصیت مورفولوژیک، ویروس جداشده متعلق به خانواده siphoviridae بود. بر مبنای طبقه بندی Bradley فاژ جداشده برعلیه سویه های اشریشیا کلی متعلق به مورفوتایپ B1 بود.نتیجه گیری: فاژ جداشده در این مطالعه می تواند به طور موثر سویه های اشریشیا کلی بیماری زا جداشده از زخم بیماران دیابتی را لیز کنند. در نتیجه شاید بتوان به عنوان یک عامل درمانی موثر در برابر عفونت های مقاوم به درمان مربوط به این باکتری در داخل بدن در مطالعات آینده استفاده شود.

زمینه و اهداف: باکتری های اسیدلاکتیک نقش مهمی در تولید و نگهداری مواد غذایی تخمیری ایفا می کنند. این مطالعه باهدف ارزیابی خواص ضد میکروبی یکی از باکتری های اسیدلاکتیک غالب جداشده از خمیرترش آرد جو برعلیه برخی از شاخص های میکروبی غذازاد انجام گردید.مواد و روش کار: در این مطالعه تجربی که در سال های 1394 و 1395 در دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان انجام شد، پس از شناسایی مولکولی جدایه لاکتیکی غالب خمیرترش آرد جو، اثر ضد میکروبی جدایه مذکور و همچنین پالیده های خام و خنثی شده حاصل از فازهای رشد لگاریتمی و سکون آن بر اساس روش های انتشار در دیسک و میکرودایلوشن (ضد باکتریایی) و همچنین کشت دولایه و لکه گذاری سوسپانسیون اسپور (ضد قارچی) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این پژوهش با استفاده از آنالیز واریانس یک طرفه، تجزیه و تحلیل گردید.یافته ها: توالی یابی محصولات PCR، منجر به شناسایی ویسلا سیباریا به عنوان یکی از جدایه های لاکتیکی غالب خمیرترش آرد کامل جو شد. نتایج ارزیابی اثر ضد باکتریایی نیز حاکی از بروز معنی دار (p<0.05) بیشترین تاثیر بازدارنده این جدایه و همچنین پالیده خام حاصل از فاز رشد لگاریتمی آن بر روی باسیلوس سوبتیلیس در مقایسه با سایر شاخص های باکتریایی بود. علاوه بر این، مشخص شد که ویسلا سیباریا و پالیده های کشت آن از قابلیت ضد قارچی مناسبی برعلیه آسپرژیلوس فلاووس و آسپرژیلوس نایجر برخوردار هستند.نتیجه گیری: بر اساس نتایج این پژوهش، می توان از جدایه لاکتیکی ویسلا سیباریا و پالیده های کشت آن به عنوان نگه دارنده زیستی در کنترل رشد برخی از شاخص های میکروبی در صنایع غذایی و دارویی استفاده نمود.

زمینه و اهداف: کاندیدا یکی از فلورهای قارچ در انسان است که می تواند در سطوح مخاطی و پوست کلونیزه شود. عوامل مختلفی در ایجاد بیماری توسط کاندیداها نقش دارند، یکی از مهم ترین فاکتورها، هیدرولازهای ترشحی هستند و آنزیم های آسپارتیل پروتئیناز به عنوان یک عامل بالقوه می باشند، ولی ترشح سایر آنزیم های هیدرولیتیک مانند فسفولیپازها و لیپازها نیز از عوامل مهم بیماری زا می باشند. در این تحقیق به بررسی بیان ژن های LIP2، LIP3 و LIP5 در کاندیدا آلبیکنس جداشده از بیماران مختلف پرداخته شده است.مواد و روش کار: تعداد 100 سویه کاندیدا آلبیکنس در طی سال های 95-1394 به روش مورفولوژی و مولکولی از نمونه های بالینی جداسازی و شناسایی شد. پس از استخراج RNA آن ها به روش کیت RNX-Plus و سنتز cDNA، بیان ژن های LIP2، LIP3 و LIP5 با استفاده از تست RT-PCR بررسی گردید.یافته ها: در 100 نمونه مورد آزمایش ژن %55 LIP2، ژن %41 LIP3 و %48 LIP5 بیان شدند. در بین نمونه هایی که بیان ژن در آن ها مثبت بود، 24 نمونه (%33.80) هر 3 ژن را هم زمان بیان کردند.نتیجه گیری: در این مطالعه، درصد فراوانی ژن های لیپاز در سویه های کاندیدا آلبیکنس متفاوت بود. در 30% موارد ژن لیپاز بیان نگردید و می توان نتیجه گرفت که ژن های دیگری می تواند در بیماری زایی نقش داشته باشند.

زمینه و اهداف: در این تحقیق، روشی سه جزئی برای تهیه مشتقات 3، 4-دی هیدروپیرانو [c] کرومن در حضور آمونیوم تری فلورو استات ارائه می گردد. همه ترکیبات به دست آمده جهت فعالیت ضد باکتریایی در محیط آزمایشگاهی در مقابل سویه های مختلف باکتری مورد ارزیابی و رفتار ضدباکتریایی محصولات بر روی باکتری های گرم- مثبت و گرم- منفی مورد مطالعه قرار گرفتند.مواد و روش کار: 3، 4-دی هیدروپیرانو [c] کرومن ها با استفاده از واکنش تراکمی کارا از واکنش 4-هیدروکسی کومارین، آریل هالیدها و مالونونیتریل کاتالیز شده توسط آمونیوم تری فلورو استات تهیه شدند. غلظت های مختلف از داروهای کنترلی مثبت و مشابه در DMSO آماده شدند. ماده تلقیحی و آب مقطر به 14 لوله آزمایش حاوی یک میلی لیتر محلول حاوی محیط کشت و باکتری اضافه شد. لوله ها به مدت 24 ساعت در دمای 37oC در انکوباتور قرار داده شد. پس از زمان انکوبه شدن، فعالیت ضد باکتریایی محیط به دقت مورد بررسی قرار گرفت.یافته ها: در شرایط واکنش بهینه شده، محصولات مورد نظر 4c-j تحت شرایط بازروانی با بازده بالایی به دست آمدند. داده های غربالگری ضد میکروبی آشکار کرد که ترکیبات 4b و 4e فعالیت خوبی در مقابل اشریشیا کلی نشان می دهند.نتیجه گیری: از روش تهیه رقت در لوله برای بررسی و تعیین حداقل غلظت مهار کننده رشد باکتری استفاده گردید. روش حاضر مزایای متعددی چون زمان واکنش کوتاه، فرآیند ساده با خالص سازی آسان و شرایط واکنش ملایم را پیشنهاد می کند. انتظار می رود که این روش توجه شیمی دان های دارویی را جلب کرده و برای تهیه و غربالگری دارویی مولکول های بر پایه کرومن مورد استفاده قرار گیرد.

زمینه و اهداف: اسینتوباکتر بومانی یکی از مهم ترین پاتوژن های فرصت طلب بوده که مسوول عفونت های بیمارستانی به ویژه در بخش های مراقبت های ویژه است. شیوع مقاومت های آنتی بیوتیک اسینتوباکتر بومانی در سراسر جهان در حال افزایش است و این ممکن است مشکلات بالینی قابل توجهی را باعث شود. بنابراین این مطالعه با هدف ارزیابی میزان مقاومت آنتی بیوتیک اسینتوباکتر بومانی به روش متاآنالیز انجام شده است.مواد و روش کار: اطلاعات این مطالعه با جستجو در پایگاه های اطلاعاتی شامل: Scopus، PubMed، ISI Web of Science، ISC، SID و Google Scholar با استفاده از کلیدواژه های استاندارد و بدون محدودیت زمانی توسط نویسندگان این مقاله به صورت مستقل انجام شد. سپس مطالعات حاوی معیار ورود به مطالعه موردبررسی قرار گرفتند. داده ها با استفاده از مدل به روش متاآنالیز و با نرم افزار STATA Ver.12.0 بررسی شدند.یافته ها و نتیجه گیری: 11 مطالعه واجد شرایط بودند. این مطالعات برای آنتی بیوتیک های: سفوتاکسیم، سفتازیدیم، آمیکاسین، جنتامایین، سیپروفلوکساسین و ایمی پنم بر اساس مدل اثرات تصادفی مورد تجزیه وتحلیل قرار گرفتند. بیشترین میزان مقاومت نسبت به سفوتاکسیم و کمترین میزان مقاومت مربوط به ایمی پنم بود. این مطالعه نشان داد سویه های اسینتوباکتر بومانی نسبت به طیف وسیعی از آنتی بیوتیک ها مقاوم هستند. با توجه به اهمیت این باکتری در عفونت های بیمارستانی به ویژه در بخش مراقبت های ویژه ضروری است اقدامات فوری جهت کنترل گسترش این باکتری ها به عمل آید.

زمینه و اهداف: بتالاکتامازهای وسیع الطیف گروهی از آنزیم ها با توانایی هیدرولیز سفالوسپورین ها و آزترونام می باشند. انواع مختلفی از بتالاکتامازهای وسیع الطیف (ESBLs) از قبیل blaTEM و blaSHV به طور برجسته در سویه های اشریشیاکلی حضور دارند. هدف از این مطالعه بررسی فراوانی ژن های blaSHV و blaTEM در سویه های اشریشیاکلی مولد بتالاکتامازهای وسیع الطیف جداسازی شده از نمونه های ادراری در کرج بود.مواد و روش کار: در این مطالعه که در طول تابستان 1393 و در سطح شهر کرج انجام گردید، الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی 119 ایزوله اشریشیاکلی جداشده از عفونت ادراری نسبت به 16 آنتی بیوتیک مختلف با روش انتشار دیسک کربی بائر مشخص گردید. باکتری های مولد بتالاکتامازهای وسیع الطیف با روش دابل دیسک دیفیوژن توسط دیسک های ترکیبی مشخص شدند و با استفاده از پرایمر های اختصاصی برای ژن های blaTEM و blaSHV مورد بررسی قرار گرفتند.یافته ها و نتیجه گیری: بیشترین و کمترین درصد مقاومت به ترتیب به آنتی بیوتیک تتراسایکلین (61%) و نیتروفورانتوئین (%8.5) بود؛ %42.8 ایزوله ها مولد بتالاکتامازهای وسیع الطیف بودند که از این تعداد %60.78 و %39.21 به ترتیب دارای ژن های blaTEM و blaSHV و %9.32 دارای هر دو ژن بودند. میزان بالای مقاومت سویه های واجد ژن های blaTEM و blaSHV به سفالوسپورین های نسل سوم یک معضل محسوب شده و شناسایی اشریشیاکلی های تولیدکننده بتالاکتامازهای وسیع الطیف باید در دستور کار آزمایشگاه های تشخیص طبی قرار گیرد و با تعیین الگوی مقاومت ایزوله ها تجویز سفالوسپورین ها به باکتری های حساس محدود گردد.

زمینه و اهداف: عفونت هلیکوباکتر پیلوری در حال حاضر به صورت یک مساله بهداشتی جهان گستر تبدیل شده است. این عفونت می تواند باعث بیماری های مختلف گوارشی شود. نقش گروه های خونی در نحوه پاسخگویی بدن به میکروارگانیسم ها و گسترش اختلالات دستگاه گوارش تثبیت شده است. هدف از این مطالعه بررسی ارتباط بین گروه های خونی و سن و جنس در جمعیت ایرانی با شدت آلودگی به این باکتری است.مواد و روش کار: در این مطالعه 160 بیمار دارای ناراحتی های گوارشی که به بیمارستان هاجر مراجعه کرده بودند وارد مطالعه شدند. نمونه های بیوپسی بیماران ازلحاظ آلوده بودن به هلیکوباکتر پیلوری با روش PCR برای ژن های 16SRNA و glmM بررسی شدند و تعیین گروه های خونی بیماران نیز با تست روتین هماگلوتیناسیون صورت گرفت.یافته ها و نتیجه گیری: مشاهده شد که %61.87 از بیماران ازلحاظ وجود باکتری مثبت بودند و 61 نفر از بیماران منفی بودند. در میان بیماران آلوده به باکتری %62.26 زن بودند. بیشترین فراوانی گروه های خونی ABO در میان بیماران آلوده برای گروه خونی O با %40.66 بود (p>0.05)؛ %77.12 از افراد Rh مثبت نیز آلوده به هلیکوباکتر پیلوری بودند (p<0.05). ارتباط معنی داری بین سن و جنس با میزان آلودگی مشاهده نشد. شدت آلودگی به این باکتری نیز در بیماران دارای گروه خونی O+ بیشتر از بقیه مشاهده شد (p<0.05). مثبت بودن Rh در بیماران آلوده و گروه خونی O ممکن است در تشدید آلودگی به این باکتری نقش داشته باشد.