تازه های بیوتکنولوژی سلولی مولکولی
سال:1390 | دوره:1 | شماره:3 |تعداد مقالات:8

RNA interference (RNAi) در فرآیند خاموشی ژن نقش دارد که منشا آن (dsRNA) Double-stranded RNA می باشد. معمولا در انواع مختلف سلول ها dsRNA از 24-21 نوکلئوتید تشکیل شده که(siRNA) Small interference RNA  نامیده می شود و با هدایت RNA-induced silencing complex (RISC)،mRNA  هدف شناسایی و شکسته می شود. siRNA فعال کننده قوی سیستم ایمنی اولیه است که می تواند بیان سایتوکاین ها و اینترفرون ها را با مقدار زیاد القا نماید.(TLR) Toll like receptor  اولین خط دفاعی سیستم ایمنی ذاتی است که بیان ژن های زیادی را در سلول میانجی گری می کند. برهم کنش siRNA در داخل سیتوپلاسم توسط حسگرهایRNA  از قبیل (Retinoic-acid Inducible Gene-IRIG-I)، (PKR) RNA-Activated protein kinase R،(IRF) Interferon Regulatory Factor  و `-5`2 الیگو آدنیلات سنتتاز(2`-5`OAS)  انجام می گیرد. با ایجاد تغییراتی در اسیدهای نوکلئیک و نوکلئوتیدهای انتهایی و آویزان در siRNA می توان نیمه عمر siRNA ها را افزایش داد. در این مقاله درباره خاموشی ژن توسط RNAi و پاسخ ایمنی حاصل از siRNA توضیح داده می شود.

سابقه و هدف: هدف از این تحقیق تعیین شایع ترین عوامل باکتریال عفونت خون نوزادان بوده است. این مطالعه از نوع توصیفی مقطعی بوده که در طی سال های 85-1384 در بیمارستان شهید عارفیان ارومیه بر روی 402 نوزاد مشکوک به عفونت خون نوزادان انجام پذیرفت.مواد و روش ها: پس از جمع آوری نمونه خون از این نوزادان و انجام کشت میکروبی، ارزیابی حساسیت آنتی بیوتیکی سویه های باکتریال جداسازی شده با به کارگیری روش انتشار دیسک منطبق با اصول کمیته بین المللی بالینی آزمایشگاه (CLSI) صورت پذیرفت.یافته ها: از 402 نمونه خون مورد مطالعه، (%8.9) 36 کشت خون مثبت حاصل شد که شیوع عفونت در نوزادان پسر با (%61.1) 22 مورد بیشتر از نوزادان دختر با (%38.9) 14 مورد و از این نوزادان، 23 نوزاد حاصل زایمان طبیعی و 13 نوزاد حاصل زایمان سزارین بودند و رابطه معنی داری بین نوع زایمان و شیوع بیماری وجود نداشت (P=0.093). میانگین وزن 36 نوزاد 2117±837 گرم بود و رابطه معنی داری بین وزن کم هنگام تولد و افزایش شیوع عفونت مشاهده شد (P=0). شایع ترین میکروارگانیسم های مولد عفونت خون نوزادان به ترتیب، استافیلوکوک کوآگولاز منفی (50 درصد) و کلبسیلا پنومونیه (19.4 درصد) بودند. بیشترین مقاومت باکتری های گرم مثبت به آمپی سیلین و سویه های گرم منفی به سفوتاکسیم و بیشترین حساسیت باکتری های گرم مثبت به وانکومایسین و سویه های گرم منفی به سیپروفلوکساسین و عامل خطرزای اصلی در ابتلا به عفونت، نارس بودن و وزن کم حین تولد بود.نتیجه گیری: با توجه به افزایش شیوع عفونت با استافیلوکوک کوآگولاز منفی در این مطالعه و مطالعات مشابه، با درمان صحیح آنتی بیوتیکی منطبق با نتایج دقیق آنتی بیوگرام به همراه رعایت اصول بهداشتی در بخش زایمان، نوزادان و مراقبت های ویژه نوزادان و مراقبت های مناسب قبل از تولد برای جلوگیری از تولد نوزاد نارس می توان از مرگ و میر و ناتوانی های حاصل از این بیماری کاست.

سابقه و هدف: امروزه با توجه به مصرف بسیار زیاد پلیمرهای مقاوم به تخریب زیستی از جمله انواع پلاستیک ها در بسته بندی مواد غذایی، کالا و همچنین استفاده از کیسه های پلاستیکی برای جابجایی و حمل زباله مشکل بزرگ تجمع ضایعات پلیمری در طبیعت به وجود آمده است. یکی از راه ها برای حل این مشکل تولید پلیمرهای زیست تخریب پذیر می باشد.مواد و روش ها: باکتری تولید کننده پلیمر پلی هیدروکسی آلکانوآت (PHA) از نمونه های محیطی جداسازی شد. این سویه باکتریایی با روش های شیمیایی و مولکولی از طریق تعیین توالی ژن 16s rDNA شناسایی گردید. تولیدPHA  توسط این باکتری با استفاده از کروماتوگرافی گازی و ستون HP-5 تحت شرایط مختلف کشت اندازه گیری شد.یافته ها: در این مطالعه باکتری بومی تولید کننده PHA بعنوان Bacillus thuringiensis ZK 86 شناسایی گردید. شرایط مناسب برای تولید این پلیمر دمای 37oC، pH=7 و هوادهی در rpm=150 تعیین گردید. تحت این شرایط بیشترین میزان تولید حدود 0.367 گرم در لیتر با منبع گلوکز پس از کشت به مدت 72 ساعت بدست آمد و 35% از وزن خشک سلولی را پلیمر تشکیل داد.نتیجه گیری: این مقاله اولین گزارش از تولید PHA توسط سویه باسیلوس تورینجنسیس بومی ایران می باشد که در طی آن شناسایی باکتری تولید کننده و روش های تولید و اندازه گیری میزان و نوع پلیمر تولید شده مورد ارزیابی قرار گرفتند.

سابقه و هدف: لاکتوباسیل ها متشکل از ارگانیزم های گرم مثبت، کاتالاز منفی، بدون اسپور و میله ای شکل هستند و بیش از 90 گونه از این باکتری شناخته شده است. سوش های متعددی از لاکتوباسیل های پروبیوتیک در طیف وسیعی از محصولات غذایی انسان ها وجود دارند. ظرفیت های پروبیوتیکی وابسته به سوش می باشند، انتخاب متدهای قابل اطمینان برای شناسایی لاکتوباسیل ها از اهمیت خاصی برخوردار است با توجه به وقت گیر بودن و ابهام آمیز بودن روش های بیوشیمیایی، روش های مولکولی مناسب تر و دقیق تر بوده و جایگزین روش های قبلی شده اند. هدف از این تحقیق، شناسایی لاکتوباسیل های جدا شده از محصولات لبنی سنتی ایران با استفاده از مارکرهای RAPD به عنوان یک ابزار موثر در طبقه بندی لاکتوباسیل ها و بررسی تنوع ژنتیکی در سویه های جدا شده می باشد.مواد و روش ها: در این مطالعه 20 ایزوله از محصولات لبنی مختلف جدا شدند و پس از کشت بر روی محیط اختصاصی MRS استخراج DNA از باکتری ها انجام شد و برای بررسی تنوع ژنتیکی از مارکرهای RAPD استفاده شد.یافته ها: از 20 پرایمر به کار رفته در این تحقیق، 19 پرایمر باندهای قابل کدگذاری ایجاد کردند. تعداد کل باندهای تکثیر شده توسط کل پرایمرها، 225 عدد برآورد شد که شامل 219 باند پلی مورف، 6 باند مشترک و 63 باند اختصاصی بود. توسط نرم افزار NTSYS-PC ماتریس تشابه بر اساس ضریب Jaccard برای ژنوتیپ ها محاسبه شد. سپس گروه بندی ایزوله ها با روش UPGMA و NJ توسط نرم افزار NTSYS-PC انجام گرفت و نتایج یکسان و مشابهی از مقایسه گروه بندی با دو روش مختلف حاصل شد.نتیجه گیری: بر اساس ماتریس تشابه k2l3 و y1m4 بیشترین تشابه ژنتیکی را با یکدیگر نشان دادند و در هر دو دندروگرام با هم در یک گروه قرار گرفتند. در گروه بندی بر اساس روش UPGMA دو شاخه اصلی A و B وجود داشت. شاخه اصلی A به دو زیرگروه با ژنوتیپ های y2f3، y1l4، c6m3 و c1d2 و شاخه اصلی B نیز به دو گروه با ژنوتیپ هایy1m4 ، k2l3، y2c4، d3b1، c2h1 و p تقسیم شدند.

سابقه و هدف: در ایران جنس اسپرس (Onobrychis) دارای 63 گونه یک ساله و چند ساله می باشد که در مناطق مختلف آب و هوایی پراکنش یافته اند. تعدادی از گونه های این جنس دارای ارزش علوفه ای بوده و در کنترل فرسایش و یا به عنوان گیاهان جلب کننده زنبورعسل مورد استفاده قرار می گیرند. این گونه ها تنوع ژنتیکی بالایی داشته و به عنوان یک ذخیره ژنتیکی غنی و ارزشمند می توان از آنها برای اصلاح گونه های زراعی استفاده کرد. در پژوهش حاضر با شمارش و اندازه گیری کروموزم های مرحله متافازی میتوز نه گونه اسپرس که بسیاری از آنها انحصاری ایران می باشند، کاریوتیپ و تقارن گونه ها بررسی می شود.مواد و روش ها: نه گونه از جنس (اسپرس)، از مناطق طبیعی کشور جمع آوری شد و با استفاده از سلول های مریستم انتهایی ریشه آنها، تعداد و ابعاد کروموزم ها در مرحله میتوز اندازه گیری و فرمول کاریوتیپی هر گونه تعیین گردید.یافته ها: تعداد کروموزوم پایه در گونه ها بین x=7 و x=8 متغیر و تیپ کروموزوم ها نیز از نوع متاسنتریک تا ساب متاسنتریک بود. از نظر میانگین طول ژنوم، بیشترین مقدار طول ژنوم متعلق به گونه O. scrobiculata (24.26) و کمترین میانگین طول ژنوم به گونه O. lunata (14.76) تعلق دارد. گونه O. heliocarpa با فرمول کاریوتیپی 16m از بیشترین درصد شکل کلی (44.856) و کمترین مقدار شاخص نامتقارن بودن درون کروموزومی (0.218) برخوردار بود و نیز گونه O. oxyptera با فرمول کاریوتیپی 2m+14sm دارای کمترین درصد شکل کلی (32.552) و بیشترین شاخص عدم تقارن درون کروموزومی (0.489) بود. در میان گونه های مورد بررسی گونه های O. heliocarp وO. lunata  بر خلاف سایر گونه ها که در کلاس B استیبنز بودند در کلاس A قرار گرفتند و دارای کاریوتیپ های متقارن تر می باشند که نشان دهنده ابتدایی تر بودن این دو گونه می باشد. گونه O. oxyptera در کلاس 3B قرار گرفته و کاریوتیپ آن به سوی نامتقارنی و پیشرفته بودن میل می کند. در تجزیه خوشه ای به روش Ward بر اساس صفات کاریوتیپی گونه های مورد مطالعه در دو گروه مجزا قرار گرفتند. کمترین فاصله بین گونه های O. buhseana و O. atropatana و بیشترین فاصله بین گونه های O. heliocarpa O. oxyptera مشاهده شد.نتیجه گیری: نتایج حاصل از این تجزیه جهت رده بندی گونه ها و انتخاب گونه های نزدیک به یکدیگر برای انجام تلاقی بین گونه ای استفاده می شود.

سابقه و هدف: تاثیر عوامل محیطی در ایجاد سرطان مغز و اختلال در تقسیمات سلولی از اهمیت بسزایی برخوردار بوده و مورد نظر محققین قرار گرفته و ارزیابی و شناسایی می شود. هدف از انجام این مطالعه، بررسی تاثیر فاکتورهای محیطی متفاوت مانند سن، جنس، وزن، عادات غذائی، میزان مصرف ویتامین ها، مشروبات الکلی و همچنین سابقه خانوادگی در ایجاد سرطان مغز در بیمارانی که در بیمارستان شهدای تهران پذیرش شده بودند بود.مواد و روش ها: برای این منظور پرسشنامه ای شامل سوالاتی در مورد عوامل فوق در دسترس قرار گرفت. سپس مطالعات انجام شده توسط نرم افزار (SPSS version 11) مورد تجزیه و تحلیل آماری قرار گرفت. این جامعه اماری شامل 100 بیمار مبتلا به سرطان مغز و 100 شخص سالم جهت کنترل بود.یافته ها: بررسی های انجام شده نشان می دهد که رابطه مستقیمی بین مصرف بیش از حد گوشت قرمز و خطر ابتلا به سرطان مغز وجود دارد. افرادی که در رژیم غذائی شان از انواع ویتامین ها استفاده می کردند، تعداد کمی از مبتلایان را تشکیل می دادند. بین سن و جنسیت و خطر ابتلا به این بیماری رابطه معناداری گزارش نشده است. در حالی که میزان تحصیلات و درآمد نقش به سزائی در ابتلا افراد به این بیماری نشان داده است. همچنین مصرف بالای الکل و سیگار خطر ابتلا را افزایش داده است. رابطه مستقیمی نیز بین افرادی که سابقه خانوادگی مثبت داشتند و افزایش خطر ابتلا به سرطان مغز گزارش شده است. شغل افراد نیز یکی دیگر از فاکتورهای مهم محسوب می گردد چنان که درصد بالائی از بیماران مورد مطالعه در معرض اشعه X بودند.نتیجه گیری: فاکتورهای محیطی نقش به سزائی در ایجاد سرطان مغز دارند.

سابقه و هدف: به منظور بررسی اثر تنش خشکی بر خواص اکوفیزیولوژیکی سه رقم چغندرقند، طرح تحقیقی با بلوک های نواری (استریپ پلات) با طرح پایه بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار در سال 1388 در ایستگاه تحقیقات کشاورزی خوی اجرا شد.مواد و روش ها: ارقام مورد بررسی رسول، شیرین و 7112 بودند. در شرایط تنش خشکی دو نوبت از آبیاری ها در موقع دو ماه پس از کاشت و 100 روز پس از کاشت حذف گردید.یافته ها: نتایج نشان داد که اثر تنش روی صفات عملکرد ریشه، عملکرد شکر ناخالص، درصد قند، قند قابل استحصال، طول ریشه، وزن تر و خشک برگ و دمبرگ، وزن تر ریشه، راندمان آب درصد قند و راندمان دما درصد قند و ماده خشک ریشه معنی دار بود ولی این تیمار بر روی صفات عملکرد شکر سفید، ناخالصی ازت و سدیم، قند ملاس، وزن خشک ریشه و راندمان آب ماده خشک ریشه اثر معنی داری نداشت. بیشترین عملکرد ریشه با 66.73 تن در هکتار از تیمار آبیاری معمولی به دست آمد. اثر رقم روی تمام صفات مورد بررسی به غیر از ناخالصی ازت و سدیم و قند ملاس معنی دار بود. رقم رسول از نظر عملکرد ریشه و مقدار شکر سفید به ترتیب با تولید 75.64 و 8.77 تن در هکتار با اختلاف معنی داری از بقیه بالاتر بود. با توجه به محیط های تنش و بدون تنش خشکی، کاهش وزن تر اندام هوایی بیانگر ذخیره سازی غیر یکسان آب در توده ها است. همچنین کاهش وزن خشک اندام هوایی و وزن خشک کل بیانگر این است که تنش خشکی می تواند روی رشد قسمت های هوایی گیاه و وزن خشک کل تاثیر گذاشته و باعث کاهش آنها گردد.نتیجه گیری: صفت عملکرد شکر سفید، ناخالصی های ازت و سدیم، قند ملاس در دو محیط رطوبتی، تفاوت معنی داری نشان نداد. این بدان معنی است که اعمال تنش در دو مرحله اجرا شده در این آزمایش ضمن صرفه جویی در مصرف آب در زمان بحرانی آن (که آب در این زمان مورد نیاز غلات و سایر زراعت های رقیب در منطقه می باشد) تاثیر سوء قابل ملاحظه ای در مهمترین صفت کمی و کیفی چغندرقند (مقدار قند قابل استحصال) نداشته است. اثر متقابل دو فاکتور تنش و ارقام بر روی هیچ یک از صفات مورد بررسی معنی دار نبود.

سابقه و هدف: سلول های تومور گلیوبلاستوما میکرووزیکول های (اکسوزوم های) محتویmiRNA ،mRNA  و پروتئین های آنژیوژنیک را آزاد می کنند. این میکرووزیکول ها بوسیله سلول های نرمال میزبان همچون سلول های اندوتلیال ریزرگی مغز (brain microvascular endothelial cells) جذب می شوند.مواد و روش ها: از طریق ترکیب یک mRNA با یک پروتئین گزارش گر و انتقال آنها به درون این میکرووزیکول ها، تشخیص دادیم که پیام های تحویل شده توسط میکرووزیکول ها بوسیله سلول های گیرنده ترجمه شده اند. این میکرووزیکول ها همچنین غنی از پروتئین های رگ زایی می باشند و تشکیل توبول را از طریق سلول های اندوتلیال تحریک می کنند.یافته ها: میکرووزیکول های مشتق شده از تومور به عنوان وسیله تحویل دهنده اطلاعات ژنتیکی و پروتئین ها به سلول های گیرنده در محیط توموری به کار می روند. میکرووزیکول های گلیوبلاستوما همچنین تکثیر دودمان سلولی گلیومای انسان را تحریک می نمایند، که نمایان کننده جنبه خودترقی دهنده آنها است. RNA پیامبر جهش یافته / متغیر و miRNA اختصاصی گلیوماها را می توان در میکرووزیکول های سرم بیماران مبتلا به گلیوبلاستوما تشخیص داد.نتیجه گیری:EGFRvIII  مختص تومور (tumor-specific) در میکرووزیکول های 7 نفر از 25 بیمار مبتلا به گلیوبلاستوما تشخیص داده شد. بنابراین میکرووزیکول های مشتق شده از تومور ممکن است اطلاعات تشخیصی را فراهم کرده و به واسطه آزمایش خون به تصمیمات درمانی در مورد بیماران سرطانی کمک نمایند.