زیست شناسی میکروارگانیسم ها
سال:1392 | دوره:2 | شماره:5 |تعداد مقالات:6

مقدمه: در تولید فرآورده های زیستی با ارزش افزوده پایین، هزینه سوبسترا سهم زیادی از قیمت تمام شده محصول را تشکیل می دهد؛ بنابراین، انتخاب یک سوبسترای ارزان قیمت که دارای بازده بالایی از محصول باشد، می تواند قیمت تمام شده محصول را تا حد زیادی کاهش دهد. نشاسته به عنوان یکی از منابع کربن فراوان و ارزان قیمت می تواند سوبسترای مناسبی برای تولید صمغ زانتان باشد. تاکنون در بیشتر تحقیقات انجام شده بر روی تولید میکروبی صمغ زانتان، از گلوکز به عنوان سوبسترای اصلی استفاده شده است.مواد و روش ها: در این تحقیق، تولید میکروبی صمغ زانتان توسط باکتری زانتاموناس کمپستریس PTCC 1473 با استفاده از نشاسته هیدرولیز شده بررسی شده است. دو عامل زمان و غلظت منبع کربن (نشاسته هیدرولیز شده) با استفاده از روش تحلیل آماری سطح رویه پاسخ-طراحی ترکیبی مرکزی (RSM-CCD) بهینه شده است. هر دو عوامل موثر بر تولید زانتان از سوبسترای نشاسته هیدرولیز شده شناخته شدند.نتایج: بر اساس نتایج حاصل از تحقیق، زمان 38.4 ساعت و غلظت 56.0 گرم بر لیتر از نشاسته هیدرولیز شده، به عنوان زمان و غلظت بهینه از سوبسترا برای تولید 8.34 گرم بر لیتر صمغ زانتان به دست آمدند.بحث و نتیجه گیری: این نتایج نشان دهنده قابلیت استفاده از نشاسته هیدرولیز شده به عنوان یک منبع کربن ارزان قیمت و ضایعاتی به جای گلوکز برای تولید زانتان است. همچنین، از بین دو عامل غلظت منبع کربن و زمان، عامل غلظت منبع کربن اثر بیشتری بر تولید زانتان داشت. این دو عامل با یکدیگر اثر متقابل نداشته و هر یک به تنهایی موثر بودند.

مقدمه: به علت اثرات مفید پروبیوتیک ها بر سلامت، این باکتری ها به شکل روز افزون به مواد لبنی و سایر مواد غذایی افزوده می شوند. لاکتوباسیل ها از پر کاربردترین باکتری ها برای این منظور، هستند. هدف این مطالعه، جداسازی لاکتوباسیل های بومی با توانایی پروبیوتیک است.مواد و روش ها: به کمک واکنش گرم و آزمایش کاتالاز، لاکتوباسیل ها از میان باکتری های جدا شده از 40 نمونه ماست بومی، تفکیک شدند. جدایه ها در اسیدیته 2.5 به مدت 2 ساعت قرار گرفتند و با کشت نمونه ها و شمارش تعداد کلونی ها، توانایی مقاومت به اسید جدایه ها ارزیابی شد. سپس، از بین 18 باکتری مقاوم به اسید از طریق روش انتشار در ژل اثر ممانعتی جدایه ها روی بیماری زا هایی نظیر اشریشیا کلی و عامل عفونت های سوختگی پسودوموناس آئروژینوزا بررسی و نتایج با نتایج سویه های تجاری مقایسه شد.نتایج: نتایج نشان داد بیش ترین اثر مهاری علیه عوامل بیماری زا به جدایه S4 مربوط است که حدود 80 درصد بازدارنده خوب و 20 درصد بازدارنده قوی بودند. نتایج حاصل از این جدایه با نتایج به دست آمده در مورد سویه تجاری لاکتوباسیلوس گاسری به طور کامل منطبق بود. همچنین کم ترین اثر ممانعتی علیه بیماری زاها به جدایه های (Y4-Y5-Y11-Y14-Y15) مربوط بود که همه (100 درصد) بازدارنده ضعیف بودند و سایر جدایه ها در دسته بازدارنده خوب قرار گرفتند.بحث و نتیجه گیری: با توجه به افزایش روز افزون مقاومت دارویی بیماری زاها، امروزه استفاده از پروبیوتیک ها به ویژه لاکتوباسیل ها به عنوان جایگزین مناسب آنتی بوتیک ها حائز اهمیت است. باکتری های مورد بررسی در این مطالعه، تا حدودی قادر به جلوگیری از رشد بیماری زاها بودند اما به منظور بررسی دقیق تر بهتر است از روش هایی با حساسیت بیشتر نظیر روش دو لایه و MIC نیز استفاده شود.

مقدمه: سیپروفلوکساسین از جمله فلوروکینولون هاست که بر روی مایکوباکتریوم ها فعال بوده و از طریق اختلال در عملکرد DNA ژیراز و آنزیم توپوایزومراز IV باکتری اثر خود را اعمال می کند. امروزه مواردی از بروز مقاومت نسبت به این آنتی بیوتیک در مناطق جغرافیایی مختلف جهان گزارش شده که درمان بیماری های ناشی از مایکو باکتریوم های غیر توبرکلوز را با مشکل روبرو ساخته است.مواد و روش ها: در این مطالعه، تعداد 39 ایزوله مایکوباکتریوم غیر توبرکلوز محیطی و بالینی از کلکسیون میکروبی گروه میکروب شناسی دانشگاه علوم پزشکی اصفهان و مرکز سل استان اصفهان جمع آوری و پس از تایید گونه ها از طریق رنگ آمیزی اسید فست، بررسی سرعت رشد و آزمایش های بیوشیمیایی رایج، حساسیت دارویی آن ها در برابر غلظت های 1، 2 و 4 میکروگرم بر میلی لیتر سیپروفلوکساسین با استفاده از روش آگار دایلوشن بر اساس الگوی ارائه شده توسط CLSI تعیین شد.نتایج: از 39 ایزوله شناسایی شده توسط آزمایش های فنوتیپیک، 25 مورد Mycobacterium fortuitum،10  مورد M. gordonae، یک مورد M. smegmatis، یک مورد M. conceptionense و دو مورد M. abscessus بود. همه ایزوله ها به جز M. abscessus در برابر هر سه غلظت 1، 2 و 4 میکروگرم بر میلی لیتر سیپروفلوکساسین، حساس بودند.بحث و نتیجه گیری: با توجه به حساسیت بیش ترین ایزوله های مایکوباکتریوم غیر توبرکلوز محیطی (به غیر از 2 ایزولهM. abscessus )  و ایزوله های بالینی شامل گونه های M. fortuitum و M. gordonae به آنتی بیوتیک سیپروفلوکساسین در این مطالعه، این دارو می تواند در استراتژی درمانی این دسته از عفونت ها به عنوان داروی اصلی استفاده شود.

مقدمه: استفاده از باکتری های مقاوم به اشعه، فرابنفش و دیگر شرایط سخت، برای پاک سازی زیستی و بازیابی فلزات موجود در زباله های محیطی و صنعتی به خاطر توانایی بقا و کاتالیز عملکردی مطلوب تحت شرایط استرس بالای اشعه بسیار حائز اهمیت است.مواد و روش ها: پس از غربال گری اولیه و ثانویه به وسیله تابش اشعه با لامپ UV، یک جدایه به دست آمد که بر اساس ویژگی های ریخت شناسی و بیوشیمیایی، تعیین توالی ژن 16S rRNA و تحلیل فیلوژنتیک، شناسایی شد. به منظور مطالعه ویژگی های مقاومت جدایه فوق، سویه در معرض برخی شرایط سخت از قبیل اشعه فرابنفش (25 ژول)، خشکی (28 روز)، هیدروژن پراکسید (1 تا 5 درصد)، میتومایسین C (1 تا 8 میکروگرم)، غلظت های مختلف نمک (5 تا 25 درصد) و مقادیر مختلف اسیدیته (1 تا 11) گذاشته و رشد یا بقای باکتری در محیط TGY به وسیله اسپکترومتری یا فلوسیتومتری ارزیابی شد.نتایج: جدایه MG6 باکتری میله ای گرم مثبت مقاوم به اشعه فرابنفش بود که توالی 16S rRNA آن 99.7 درصد شباهت با Microbacterium resistens نشان داد. این شباهت با تحلیل فیلوژنتیک تائید شد. رشد بهینه سویه در اسیدیته 5 و غلظت 5 درصد کلریدسدیم دیده شد. همچنین به غلظت 1 تا 4 درصد هیدروژن پراکسید و 2 میکروگرم میتومایسین C مقاومت نشان داد. تحلیل میزان بقا نشان داد که این سویه در مقایسه با Deinococcus radiodurans R1 مقاومت بالایی در برابر اشعه فرابنفش، ولی در برابر خشکی مقاومت متوسطی دارد.بحث و نتیجه گیری: در این تحقیق، سویه جدیدی از M. resistens جداسازی شد که مقاوم به اشعه UV بود و تحمل برخی شرایط سخت مثل اسیدیته، عوامل اکسیدان و موتاژن، شوری و خشکی را نیز نشان داد. مقاومت سویه MG6 به اشعه UV قابل مقایسه با سویه مقاوم به اشعه D. radiodurans R1 بود. تحقیق حاضر اولین گزارش درباره مقاومت به شرایط سخت سویه جدید M. resistens در ایران می باشد.

مقدمه: با توجه به مقاومت آنتی بیوتیکی روز افزون باکتری ها و گرایش عمومی به ترکیبات طبیعی، شناسایی گلسنگ ها و بررسی اثرات ضد باکتریایی آن ها اهمیت خاصی دارد.مواد و روش ها: پس از جمع آوری گلسنگ ها، عصاره متانولی و استونی آن ها تهیه و رقت های مختلف از عصاره ها، روی 6 باکتری بیماری زا به روش انتشار دیسک تاثیر داده شد و با آنتی بیوتیک های متی سیلین، کلیندامایسین، استرپتومایسین و آمپی سیلین به عنوان شاهد مثبت مقایسه شد. مقدار حداقل غلظت مهارکننده و حداقل غلظت کشندگی عصاره ها نیز برای آن ها تعیین شد.نتایج: بررسی قطر هاله ها نشان داد که عصاره استونی گلسنگ های مورد بررسی بر روی باکتری ها تاثیر نداشت. از بین گلسنگ ها عصاره متانولیFulgensia fulgens Sw. (Elenkin) فعالیت ضد باکتریایی در خور توجهی داشت.  بحث و نتیجه گیری: از بین گلسنگ های مورد بررسی فقط گونه Fulgensia fulgens دارای خواص ضدباکتریایی بود، بنابراین، عصاره متانولی این گلسنگ می تواند به عنوان یک فراورده ضدباکتریایی در درمان عفونت های این باکتری ها جایگزین داروهای شیمیایی شود.

مقدمه: باکتری های اندوفیتیک باکتری هایی هستند که در درون بافت های گیاهان بدون ایجاد آسیب ظاهری به گیاه زندگی می کنند. به تازگی این گروه از میکروارگانیسم ها از بخش های مختلف گیاهان جدا شده اند که توانایی فعالیت ضد قارچی و باکتریایی را از خود نشان می دهند. از آنجایی که امروزه از اندوفیت ها به عنوان بارور کننده ها و یا ترکیبات شیمایی میکروب کش در کشاورزی استفاده می شود، بنابراین هدف از تحقیق حاضر، جداسازی این باکتری ها از گیاه سویا و تاثیر متابولیت های ضد میکروبی تولید شده توسط این ارگانیسم ها بر پاتوژن های قارچی فوزاریوم سولانی و و آلترناریا آلترناتاست.مواد و روش ها: در تحقیق حاضر، ابتدا جداسازی باکتری های اندوفیتیک از ساقه و برگ گیاه سویا به شکل رقت متوالی بر روی محیط کشت برین هارت اینفیوژن آگار انجام شد. سپس، نمونه ها از نظر توانایی تولید متابولیت های ضد میکروبی علیه دو پاتوژن قارچی آلترناریا الترناتا (5224PTCC ) و فوزاریوم سولانی (5284PTCC ) در شرایط آزمایشگاهی به روش خطی و انتشار در چاهک مطالعه شدند. باکتری هایی که توانایی تولید متابولیت های ضد میکروبی را داشتند با استفاده از کیت Api20NE شناسایی و منحنی رشد آن ها ارزیابی شد.نتایج: در مجموع 39 باکتری از ساقه و برگ سویا جداسازی شد که از بین آن ها 20 باکتری متعلق به ساقه ها و 19 باکتری از برگ های گیاه سویا جداسازی شدند. از کل باکتری های جداسازی شده 3 باکتری اثر ممانعتی نشان دادند که نمونه های شناسایی شده توسط Api، به جنس سودوموناس آئروجینوزا متعلق هستند. از بین باکتری های تولید کننده متابولیت های ضد میکروبی، سودوموناس ائروجینوزا بیش ترین تاثیر را روی فوزاریوم سولانی داشت. همچنین نتایج به دست آمده از منحنی رشد باکتری ها بیانگر آن است که بیشتر میکروارگنیسم ها ترکیبات خود را در 18 ساعت اولیه تولید نموده اند که در برخی از سوش ها تا 72 ساعت ادامه یافته است.بحث و نتیجه گیری: مطالعه حاضر نشان داد که گیاه سویا حاوی باکتری های اندوفیتیکی است که اثر ممانعتی علیه پاتوژن های گیاهی دارد و می توان از ترکیبات تولید شده در تحقیقات بعدی استفاده نمود.