اشریشیا کلای و سالمونلا از مهمترین عوامل عفونت های باکتریایی در گله های طیور تجاری هستند. در این بررسی بر اساس نمونه های دریافتی از گله های مرغ مادر گوشتی، میزان آلودگی این گله ها به اشریشیا کلای و سالمونلا مورد ارزیابی قرار گرفت. به همین منظور در طی سال های 1391-1389، از تخم مرغ های هچ نشده 28 گله و جوجه های یکروزه 132 گله دریافت شده از شش استان ایران شامل آذربایجان غربی، آذربایجان شرقی، زنجان، کرمانشاه، گیلان و مازندران نمونه برداری و کشت باکتریولوژیک به عمل آمد. در مجموع از 160 گله، 54 گله (%33.75) به سالمونلا و 88 گله (%55) به اشریشیا کلای آلوده بودند. از تخم مرغ های هچ نشده مربوط به 28 گله، سالمونلا از 4 گله (%14.28) و اشریشیا کلای از 7 گله (25%) جدا گردید. اما از مجموع کشت جوجه های یکروزه مربوط به 132 گله، 50 گله (%37.87) آلوده به سالمونلا و 81 گله (%61.36) آلوده به اشریشیا کلای بودند. از 50 گله آلوده به سالمونلا مربوط به کشت جوجه های یکروزه، در 4 گله (8%) سالمونلا گروه B و در 46 گله (92%) سالمونلا گروهD شناسایی شدند. در آزمایش تعیین مقاومت ضد میکروبی باکتریهای جداشده از جوجه های یکروزه نیز بیشترین میزان مقاومت جدایه های سالمونلا و اشریشیا کلای، به ترتیب، نسبت به سولفامتوکسازول + تریمتوتریم (%16) و فوزومیکس Ò (%70.37) مشاهده شد. استفاده بی رویه از ترکیبات ضد میکروبی مختلف در گله ها باعث افزایش مقاومت آنتی بیوتیکی می شود که از نظر بهداشت عمومی حائز اهمیت است.