تولید متابولیتهای ضد میکروبی توسط ریزوباکتریهای آنتاگونیست به عنوان یک عامل مهم درکاهش بسیاری از بیماریهای ریشه می باشد. سیانید هیدروژن، پروتئاز، سیدروفور و تعدادی از ترکیبات آنتی بیوتیک که بوسیله سودموناسهای فلورسنت تولید میگردد از نظر ساختمان شیمیایی شناسایی شده است که 4، 2- دی استیل فلور و گلوسینول از مهمترین آنها می باشد. جدایه های pf15,pf16,pf26,pf27 و نیز استرین CHAO pseudomonas fluorescens رشد بهترین تاثیر را درجلوگیری از رشد دانه P.ultimum درشرایط آزمایشگاهی داشتند. جدایه pf6 هیچگونه تاثیری در کاهش رشد این گونه نداشت. درمورد قارچ R. solani جدایه های pf32,pf16,pf26 و نیز استرین CHAO بهترین تاثیر را درجلوگیری از رشد قارچ داشتند. جدایه های PF24,PF6,PF10,PF21 هیچگونه تاثیری درکاهش رشد قارچ نداشتند. از بین ریزوباکتریهای آنتاگونیست مورد استفاده جدایه های PF32,PF15,PF16,PF22,PF26,PF27,PF31,PF9,PF2 و نیز استرین CHAO تولید سیانید هیدروژن کردند. 8 جدایه شامل pf27,pf1,pf6,pf12,pf15,pf21,pf2,pf32 و نیز استرین CHAO تولید پروتئاز کردند. اغلب جدایه ها تولید سیدروفورکردند . جدایه های pf1,pf32,pf16,pf26,pf27 و نیز استرینCHAO با توجه به اندازه قطر هاله نارنجی رنگ اطراف کلنی باکتریها بیشترین تولید سیدروفور را داشتند. هیچیک از جدایه های مورد آزمایش نتوانستند درون لوله آزمایش حاوی محیط سلولاز باعث تغییر رنگ کاغذ صافی بشوند. از بین 19 باکتری مورد آزمایش، 15 جدایه تولید مقادیر قابل اندازه گیری از آنتی بیوتیک دی استیل فلوروسینول، 2 جدایه مقادیر غیرقال تشخیص و 2 جدایه نیز اصلا تولید آنتی بیوتیک نکردند. بیشترین تولید آنتی بیوتیک مربوط به استرین CHAO به میزان 11.4 میکروگرم در میلی لیتر بود. جدایه های pf31,pf29 مقادیر بسیارکم و جدایه های pf21,pf3 تولید آنتی بیوتیک نکردند.