بمنظور بررسی مولکولی جمعیت ماهی حلوا سفید خلیج فارس و دریای عمان تعداد 162 نمونه شامل 38 نمونه ارسالی از کویت و 124 نمونه از ایران که 44 نمونه از استان خوزستان و 42 نمونه از چابهار و 38 نمونه از بوشهر بود، مورد آزمایش قرار گرفت.DNA کلیه نمونه ها با روش فنل- کلروفرم استخراج شد و با یک جفت پرایمر ژن PCR, ND2 گردید که در کلیه نمونه ها محصول PCR در حدود 1300 جفت باز بود. جهت آنالیز RFLP از 16 آنزیم محدود الاثر شامل: Hinc 1I, Acc II, BseN I, Hin6I, Alw26 I, Tru I, Hpa II, Hinf I, Hae III, EcoR I, Pst I, Hind III, Bcl I, Alu I, Tas I, Dra Iاستفاده شد و با انجام الکتروفورز سیستم PAGE (ژل پلی آکریل آمید) و رنگ آمیزی نیترات نقره باند های DNA مشاهده گردید. از بین 16 آنزیم بررسی شده، 4 آنزیم Acc II, Alu I, Hinf I و Hpa II دارای الگو های پلی مورفیسم بوده است. بطور کلی الگو های پلی مورفیسم در 13 نمونه از 162 نمونه دیده شد. از بین هاپلوتیپ های پلی مورفیسم بدست آمده، 6 هاپلوتایپ از هاپلوتایپهای نادر بودند و تنها هر کدام یک بار تکرار شدند، اما سایر هاپلوتایپهای پلی مورفیسم که تنها 4 نوع بودند بیش از یک بار تکرار شدند. آنالیز آماری صورت گرفته با استفاده از نرم افزار REAP تفاوت معنی داری را در بین مناطق مورد بررسی نشان نداد (P≥0.05)، در جمع بندی می توان اعلام کرد که ژن ND5 میتوکندری قادر به تفکیک جمعیتهای احتمالی حلوا سفید در آبهای ایرانی خلیج فارس و دریای عمان و همچنین آبهای کویت نبوده و نمونه های بررسی شده وجود یک جمعیت را نشان می دهند.