ویروس موزاییک سویا (SMV) در تمام مناطق کشت سویا به طور وسیعی وجود دارد. خسارت ناشی از این ویروس بسته به رقم سویا، سویه ویروس و شرایط محیطی متفاوت می باشد. با توجه به اینکه توصیه ارقام مقاوم سویا جهت کنترل خسارت این ویروس در هر منطقه، با آگاهی از نوع سویه یا سویه های ویروس موجود در آن منطقه امکان پذیر است، نیز به دلیل عدم آگاهی از وضعیت سویه های این ویروس در شمال کشور، این پژوهش صورت گرفته است. در این تحقیق، طی نمونه برداری های انجام شده در ماههای خرداد و تیر و مرداد سال 1381 تعداد 253 نمونه با علایم آگاهی به SMV از مناطق مختلف استانهای مازندران و گلستان جمع آوری شد. از این تعداد پس از انجام آزمونهای سرولوژیکی [الیزا (ELISA)، دیبا (DIBA) و تپیا (TPIA)] 149 نمونه آلوده به SMV تشخیص داده شد. پس از خالص سازی بیولوژیک، با توجه به تفاوت علایم مشاهده شده در مزرعه و نیز واکنش ارقام حساس تعداد 47 جدایه جهت مطالعات تکمیلی انتخاب گردید. این جدایه ها بر اساس واکنش ارقام افتراقی سویا (York, Ogden, Marshall, Kwanggyo, Davis, Buffalo) در چهار گروه III, II, I) و (IV طبقه بندی شدند. نتایج حاصل از واکنش ارقام افتراقی نشان داد که گروههای III, II, I و IV شناسایی شده در این تحقیق به ترتیب متعلق به سویه های G4, G3, G1 و G5 (Cho & Goodman 1979) می باشند. همچنین دو جفت آغازگر طراحی شده برای سویه های G2 و G7 ویروس موزاییک سویا، جهت تفکیک سویه ها در آزمون RT- PCR مورد استفاده قرار گرفت. هیچکدام از سویه های شناسایی شده با آغازگر مربوط به سویه G2 واکنش نداد و قطعه ای تکثیر نشد. در حالیکه کلیه سویه ها با آغازگرهای سویه G7، که با کلیه سویه ها واکنش می دهد، قطعه ای به طول 277 جفت باز تکثیر نمودند. نتایج آزمونهای فوق تفکیک سویه ها بر اساس واکنش ارقام افتراقی را تایید کرد.