Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,214
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

676
Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی ویژگی های توپولوژیکی ژن های تغییر بیان یافته خون در شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای بیماری دیابت نوع 1

صفحات

 صفحه شروع 86 | صفحه پایان 94

چکیده

 سابقه و هدف: بیماری دیابت نوع 1 در نتیجه تخریب خودایمنی سلول های بتا تولید کننده انسولین در پانکراس ایجاد می شود. برای گسترش درمان بیماری, شناسایی نشانگرهای درمانی کارآمد مورد نیاز است. روش های سیستم بیولوژی سبب فهم بهتری از عوامل عملکردی در بیماری می گردند. هدف این مطالعه, جستجوی نشانگرهای کاندید در این بیماری با بررسی ویژگی های توپولوژیکی زیرشبکه حاصل از تلفیق داده های بیان ژن و برهمکنش پروتئین-پروتئین بود.مواد و روش ها: در این مطالعه, پروفایل بیان ژن سلول های تک هسته ای خون محیطی بیماران تاره مبتلا شده به دیابت از پایگاه داده Gene Expression Omnibus (GEO) دانلود و ژن های تغییر بیان یافته مشخص گردیدند. سپس این ژن ها روی شبکه برهم کنش پروتئین-پروتئین منطبق شدند. پنج ویژگی توپولوژیکی توسط نرم افزار Cytoscape آنالیز شد. در نهایت از سه پارامتر مهم درجه راس, Betweenness و Closeness centrality برای معرفی نشانگرهای کاندید استفاده گردید.یافته ها: با انجام آنالیز آماری, 2467 ژن تغییر بیان یافته مشخص گردیدند که 1024 افزایش و 1443 کاهش بیان داشتند. با قرار دادن این ژن ها در شبکه, زیر شبکه ای با 949 نود و 1776 یال ساخته شد. با آنالیز توپولوژیکی زیرشبکه, پروتئین های با درجه راس بالا (Hub) و پروتئین های با Betweenness بالا (گلوگاه یا Bottleneck) شناخته شدند. 9 پروتئین Hub-bottleneck که مرکزیت بالا (Closeness centrality) در شبکه داشتند, به عنوان نشانگرهای کاندید معرفی شدند.نتیجه گیری: نشانگرهای کاندید به دست آمده از شبکه با نگاه سیستماتیک, می توانند به عنوان نشانگرهای تشخیصی جدید و اهداف دارویی مورد بررسی بیش تر قرار گیرند.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

    استناددهی

    APA: کپی

    صفری علی قیارلو، ناهید، تقی زاده، محمد، طباطبائی، سیدمحمد، شهسواری، سوده، نمکی، سعید، خداکریم، سهیلا، رضایی طاویرانی، مصطفی، و رشیدی پور، علی. (1395). بررسی ویژگی های توپولوژیکی ژن های تغییر بیان یافته خون در شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای بیماری دیابت نوع 1. کومش، 18(1 (پیاپی 61))، 86-94. SID. https://sid.ir/paper/36987/fa

    Vancouver: کپی

    صفری علی قیارلو ناهید، تقی زاده محمد، طباطبائی سیدمحمد، شهسواری سوده، نمکی سعید، خداکریم سهیلا، رضایی طاویرانی مصطفی، رشیدی پور علی. بررسی ویژگی های توپولوژیکی ژن های تغییر بیان یافته خون در شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای بیماری دیابت نوع 1. کومش[Internet]. 1395؛18(1 (پیاپی 61)):86-94. Available from: https://sid.ir/paper/36987/fa

    IEEE: کپی

    ناهید صفری علی قیارلو، محمد تقی زاده، سیدمحمد طباطبائی، سوده شهسواری، سعید نمکی، سهیلا خداکریم، مصطفی رضایی طاویرانی، و علی رشیدی پور، “بررسی ویژگی های توپولوژیکی ژن های تغییر بیان یافته خون در شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای بیماری دیابت نوع 1،” کومش، vol. 18، no. 1 (پیاپی 61)، pp. 86–94، 1395، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/36987/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا