مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

394
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

521
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

بررسی مقایسه ای جهش R213G در دومین اتصالی به DNA پروتئین P53 با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی

صفحات

 صفحه شروع 105 | صفحه پایان 116

کلیدواژه

ریشه میانگین مربعات نوسان (RMSF)Q2

چکیده

 مقدمه: P53 یک پروتیین سرکوبگر تومور است و جهش های missense زیادی در ژن این پروتیین شناسایی شده است. این جهش ها در تعداد زیادی از سرطان ها مشاهده می شوند. R213G یکی از این موارد است که در ایجاد سرطان های متاستاتیک ریوی نقش دارد. در این پژوهش R213G در مقایسه با گونه وحشی با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفت. روش: برای ساختار سه بعدی پروتیین P53 گونه وحشی, زنجیره A از ساختار کریستالوگرافی با pdb ایدی 1TSR استفاده شد. برای جهش R213G, باقیمانده 213 این ساختار به گلایسین تغییر داده شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی با استفاده از بسته نرم افزاری گرومکس 5-1-2, میدان نیروی AMBER99SB و مدل آب TIP3P به مدت 15 نانوثانیه و به صورت دو بار تکرار انجام شد. آنالیزهای RMSD, RMSF, شعاع ژیراسیون و انرژی پتانسیل بر روی تراژکتوری های حاصل انجام شد. نتایج: آنالیز RMSF نشان داد جهش R213G باعث تغییر انعطاف پذیری در یازده باقیمانده از جمله R-248 می شود. جالب است که این باقیمانده ها نزدیک محل جهش نیستند؛ اما همه آن ها در قطعه 220-250 از این دومین واقع شده اند و یا باقیمانده های همسایه این قطعه هستند. نتایج شعاع ژیراسیون و انرژی پتانسیل کاهش پایداری پروتیین در اثر این جهش را تایید می کند. نتیجه گیری: آنالیز RMSF جهش R213G به همراه تغییرات پایداری و شعاع بیان می کند که این جهش می تواند بر روی برهمکنش P53 با دیگر درشت مولکول ها تاثیر گسترده ای بگذارد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    اکبری، الهام، تقی زاده، محمد، و نعمتی، فهیمه. (1400). بررسی مقایسه ای جهش R213G در دومین اتصالی به DNA پروتئین P53 با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی، 8(1 )، 105-116. SID. https://sid.ir/paper/410443/fa

    Vancouver: کپی

    اکبری الهام، تقی زاده محمد، نعمتی فهیمه. بررسی مقایسه ای جهش R213G در دومین اتصالی به DNA پروتئین P53 با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی[Internet]. 1400؛8(1 ):105-116. Available from: https://sid.ir/paper/410443/fa

    IEEE: کپی

    الهام اکبری، محمد تقی زاده، و فهیمه نعمتی، “بررسی مقایسه ای جهش R213G در دومین اتصالی به DNA پروتئین P53 با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی،” انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی، vol. 8، no. 1 ، pp. 105–116، 1400، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/410443/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.
  • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button