مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

291
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

514
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

ارایه یک روش جدید انطباق چندگانه توالی های دی ان ای و پروتئین بر اساس الگوریتم های تکاملی

صفحات

 صفحه شروع 13 | صفحه پایان 20

چکیده

 مقدمه: مطالعه حیات و آشکارسازی وظایف ژن ها یک مساله مهم در محاسبات زیستی است. در انطباق توالی های زیستی, برای شناسایی ژن ها, اندازه گیری شباهت بین توالی ها انجام می شود. وقتی با مساله اندازه ژنوم در انطباق های چندگانه مواجه می شویم, با مشکل کمبود حافظه و افزایش زمان روبه رو هستیم. بنابراین, روشی که بتواند سریع و بدون کاهش دقت, انطباق ژنوم ها را داشته باشد, تاثیر به سزایی در تحلیل توالی ها خصوصا توالی های بلند را همراه دارد. مواد و روش ها: ابتدا روشی را برای تقسیم هر توالی به زیر توالی های کوتاه معرفی می کنیم. سپس از الگوریتم های تکاملی برای انطباق زیر توالی ها استفاده می کنیم. نتایج: روش پیشنهادی در هفت مجموعه داده با تعداد نکلویتیدهای مختلف به ازای هر توالی دی ان ای و افزایش تدریجی از 18000 تا 14 میلیون نکلیوتید, ارزیابی شده و با پنج روش مشهور انطباق چندگانه مقایسه شده است. بالاترین میزان دقت برای باکتری variola با میزان 93/0 و بالاترین سرعت انطباق 6/0 بر حسب دقیقه برای این باکتری است. نتیجه گیری: اکثر روش های انطباق چندگانه در توالی های کوتاه یا تعداد کم, دقت مناسبی دارند اما برای دنباله های طولانی تر به قدرت محاسباتی بالایی نیاز دارند. الگوریتم پیشنهادی با انطباق توالی های بلند, در زمانی قابل قبول و حفظ دقت و همچنین استفاده بهینه از حافظه, بر این نقص غلبه می کند.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    اطمینان، نازنوش سادات، پروین نیا، الهام، و شریفی زارچی، علی. (1400). ارایه یک روش جدید انطباق چندگانه توالی های دی ان ای و پروتئین بر اساس الگوریتم های تکاملی. (دانش و تندرستی در علوم پایه پزشکی (مجله دانش و تندرستی، 16(1 )، 13-20. SID. https://sid.ir/paper/952650/fa

    Vancouver: کپی

    اطمینان نازنوش سادات، پروین نیا الهام، شریفی زارچی علی. ارایه یک روش جدید انطباق چندگانه توالی های دی ان ای و پروتئین بر اساس الگوریتم های تکاملی. (دانش و تندرستی در علوم پایه پزشکی (مجله دانش و تندرستی[Internet]. 1400؛16(1 ):13-20. Available from: https://sid.ir/paper/952650/fa

    IEEE: کپی

    نازنوش سادات اطمینان، الهام پروین نیا، و علی شریفی زارچی، “ارایه یک روش جدید انطباق چندگانه توالی های دی ان ای و پروتئین بر اساس الگوریتم های تکاملی،” (دانش و تندرستی در علوم پایه پزشکی (مجله دانش و تندرستی، vol. 16، no. 1 ، pp. 13–20، 1400، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/952650/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.
  • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button