مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

125
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

443
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

یک روش ترکیبی اندازه های مرکزیت و خواص زیستی برای بهبود تشخیص کمپلکس های پروتئینی در شبکه های PPI وزنی

صفحات

 صفحه شروع 46 | صفحه پایان 58

چکیده

 مقدمه: در شبکه های برهمکنش پروتئینی, یک کمپلکس گروهی از پروتئین ها است که موجب فرآیند زیستی می شوند. شناسایی درست کمپلکس ها می تواند به فهم بهتر عملکرد سلول ها کمک کند تا در اهداف درمانی مانند کشف دارو مورد استفاده قرار گیرد. یکی از روش های متداول برای شناسایی کمپلکس ها در شبکه های برهمکنش پروتئینی, خوشه بندی است؛ اما هدف این پژوهش یافتن روشی جدید برای شناسایی دقیق تر کمپلکس ها است. روش: در این مطالعه توسعه ای– کاربردی از شبکه های پروتئینی مخمر و انسان استفاده شد. مجموعه های داده ای مخمر به نام های DIP, MIPS و Krogan به ترتیب دارای 4930 گره و 17201 برهمکنش, 4564 گره و 15175 برهمکنش و 2675 گره و 7084 برهمکنش و مجموعه داده ای انسان دارای 37437 برهمکنش است. الگوریتم پیشنهادی و الگوریتم های مشهور در شناسایی کمپلکس های پروتئینی بر روی مجموعه های داده ای اجرا شده اند و کمپلکس های پیش بینی شده با مجموعه داده های معیار CYC2008 و CORUM مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج: در این تحقیق روش جدیدی از دسته روش های مبتنی بر هسته و پروتئین های الحاقی جهت تشخیص کمپلکس های پروتئینی استفاده شد که دارای کارایی بالایی در تشخیص بود. هرچه قدر تشخیص کمپلکس ها دقیق تر باشد, می توان پروتئین های دخیل در یک فرآیند زیستی را درست تر تشخیص داد. معیار های ارزیابی نشان داد که روش پیشنهادی, بهبود قابل توجهی نسبت به دیگر روش ها دارد. نتیجه گیری: با توجه به نتایج به دست آمده مشاهده شد که روش پیشنهادی تعداد مناسبی از کمپلکس های پروتئینی را شناسایی نمود و بیشترین نسبت معنی داری زیستی را در همکاری عملکردی پروتئین ها دارد.

استنادها

  • ثبت نشده است.
  • ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    الهی، عبدالکریم، و بابامیر، سیدمرتضی. (1398). یک روش ترکیبی اندازه های مرکزیت و خواص زیستی برای بهبود تشخیص کمپلکس های پروتئینی در شبکه های PPI وزنی. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی، 6(1 )، 46-58. SID. https://sid.ir/paper/959172/fa

    Vancouver: کپی

    الهی عبدالکریم، بابامیر سیدمرتضی. یک روش ترکیبی اندازه های مرکزیت و خواص زیستی برای بهبود تشخیص کمپلکس های پروتئینی در شبکه های PPI وزنی. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی[Internet]. 1398؛6(1 ):46-58. Available from: https://sid.ir/paper/959172/fa

    IEEE: کپی

    عبدالکریم الهی، و سیدمرتضی بابامیر، “یک روش ترکیبی اندازه های مرکزیت و خواص زیستی برای بهبود تشخیص کمپلکس های پروتئینی در شبکه های PPI وزنی،” انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی، vol. 6، no. 1 ، pp. 46–58، 1398، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/959172/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.
  • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button