مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

100
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

441
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

طراحی، مدل سازی و آنالیز محاسباتی crRNA برای تنظیم در سطح پسارونویسی metastamiR-10b و metastamiR-126 با استفاده از تکنیک (CRISPR-C2c2 (Cas13a

صفحات

 صفحه شروع 320 | صفحه پایان 332

کلیدواژه

C2C2(Cas13a)Q3
RTQ3

چکیده

 مقدمه: یکی از مهم ترین دلایل مرگ و میر در بین بیماران سرطانی متاستاز است. اخیرا نشان داده شده است که گروه خاصی از miRNAها(microRNA) که RT=1&ftyp=all&fgrp=all&fyrs=all" target="_blank">metastamiR نامیده می شوند دارای اثر متاستاتیکی هستند. miR-126 ارتباط مشخصی با متاستاز سرطان روده به کبد دارد. همچنین در متاستاز سرطان سینه miR-10b بیان بیش از حد پیدا می کند؛ بنابراین کاهش سطح بیان این miRNAها می تواند نقش مهمی در کاهش احتمال متاستاز داشته باشد. در این تحقیق تکنیک RT=1&ftyp=all&fgrp=all&fyrs=all" target="_blank">CRISPR-C2c2(Cas13a) به منظور هدف گیری پیش سازهای miRNA جهت کاهش اثر متاستاتیکی آن ها مورد بررسی قرار گرفت. روش: پژوهش با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک و بیوانفورماتیک ساختاری انجام شد. ساختار آنزیم C2c2 از پایگاه داده RCSB و توالی های miRNA و پیش سازهای آن ها از پایگاه های داده MirBase و Mirnamap تهیه شدند. با استفاده از سیستم برخط RT=1&ftyp=all&fgrp=all&fyrs=all" target="_blank">CRISPR-RT, crRNAهای هدف گیرنده توالی مورد نظر طراحی و از نظر اختصاصیت مورد بررسی و ارزیابی قرار گرفتند. ساختار سه بعدی crRNAهای طراحی شده با استفاده از نرم افزار RNAbuider2. 8. 2 شبیه سازی و به منظور بررسی نحوه اتصال و سطح انرژی اتصالی crRNA با آنزیم C2c2(Cas13a) از سرور Hdock استفاده شد. نتایج: crRNA طراحی شده با هدف mir-126 مشابهت ساختاری بالا با وضعیت مشاهده شده در طبیعت نشان داده و جهت گیری مناسب حاصل شد. در مورد crRNA طراحی شده به منظور هدف گیری mir-10b با وجود اختصاصیت بالا جهت گیری درستی ایجاد نشد. نتیجه گیری: بررسی توالی محور crRNAهای طراحی شده برای ویرایش در سطح RNA کافی نیست و توصیه می شود در کنار بررسی های برپایه اختصاصیت, شبیه سازی و داکینگ مولکولی به منظور دقت هر چه بیشتر انجام شود.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    ابراهیمی ترکی، فاطمه، بوربور، مهسا، و ضرابی، محبوبه. (1398). طراحی, مدل سازی و آنالیز محاسباتی crRNA برای تنظیم در سطح پسارونویسی metastamiR-10b و metastamiR-126 با استفاده از تکنیک (CRISPR-C2c2 (Cas13a. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی، 6(4 )، 320-332. SID. https://sid.ir/paper/959938/fa

    Vancouver: کپی

    ابراهیمی ترکی فاطمه، بوربور مهسا، ضرابی محبوبه. طراحی, مدل سازی و آنالیز محاسباتی crRNA برای تنظیم در سطح پسارونویسی metastamiR-10b و metastamiR-126 با استفاده از تکنیک (CRISPR-C2c2 (Cas13a. انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی[Internet]. 1398؛6(4 ):320-332. Available from: https://sid.ir/paper/959938/fa

    IEEE: کپی

    فاطمه ابراهیمی ترکی، مهسا بوربور، و محبوبه ضرابی، “طراحی, مدل سازی و آنالیز محاسباتی crRNA برای تنظیم در سطح پسارونویسی metastamiR-10b و metastamiR-126 با استفاده از تکنیک (CRISPR-C2c2 (Cas13a،” انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی، vol. 6، no. 4 ، pp. 320–332، 1398، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/959938/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.

    • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button