محلهای کلنیزاسیون اپی فیت و اندوفیت Pseudomonas syringae در تمامی مراحل رشد گیاه گوجه فرنگی روی اندامهای ریشه، ساقه و برگ مورد بررسی قرار گرفت. در بررسی ضد عفونی کردن سطح گیاه بوسیله کلروفرم مشخص گردید که گاز کلروفرم قادر است تمام سلولهای باکتری را در سطح گیاه از بین ببرد ولی سلولهای باکتری در داخل بافتهای گیاهی صدمه نمی زند. بنابراین استفاده از کلروفرم به عنوان روشی مناسب برای ضدعفونی کردن سطح گیاه جهت مطالعه کلنیزاسیون آندوفیت گیاه مناسب تشخیص داده شد. در این تحقیق پلاسمید pLA-LacZ بوسیله جفت شدگی به داخل سلولهای جدایه های وحشی و موتان hrp باکتریهای p.s. pv.tomato, .p. s. pv. phaseolicola, p.s. pv.syringae , منتقل شد. سپس رقم حساس گوجه فرنگی (کانریرو) بوسیله جدایه های وحشی و موتان حاوی پلاسمید pLA-LacZ مایه زنی شدند. مطالعه ضدعفونی نمودن سطح گیاه بوسیله کلروفرم و مطالعات بافت شناسی روی کلنیزاسیون اپی فیت در گیاهانی که هیچگونه علایم بیماری مشخص یا عکس العمل دفاعی را نشان نمی دادند مشخص کرد که در واقع بخش اعظم کلنیزاسیون باکتری بشکل آندوفیت صورت می گیرد. سلولهای P.syringae در سلولهای پارانشیمی و قسمتهای آوندی بخشهای هوایی گیاه و ریشه شناسایی گردید که نسبت به سایر بافتهای گیاهی محلهای مناسبی جهت کلنیزاسیون باکتری مشخص شدند.