سابقه و هدف: هموفیلی B یک بیماری وابسته به جنس مغلوب است که در اثر کاهش مقدار و یا نقص عملکرد فاکتور IX انعقادی رخ می دهد. ژن فاکتور IX انعقادی به طول 34 کیلو باز، دارای 8 اگزون است. جهش در نواحی مختلف ژن فاکتور IX انعقادی سبب نقص در پروتیین IX انعقادی و بیماری هموفیلی B می گردد. هدف از این مطالعه تعیین جهش در ژن فاکتور IX انعقادی بیماران مبتلا به هموفیلی B در استان اصفهان و یافتن ارتباط بین ژنوتیپ و فنوتیپ این بیماران بود. مواد و روش ها: مطالعه انجام شده از نوع توصیفی بود. نمونه ها به روش غیر تصادفی آسان انتخاب شدند. DNA ژنومیک 24 بیمار مبتلا به هموفیلی B مراجعه کننده به بیمارستان سیدالشهدا (امید) اصفهان، طبق روش استاندارد استخراج شد. PCR و SSCP بر روی ژل پلی اکریل آمید در شرایط غیر تقلیب کننده برای کلیه اگزون ها و نواحی مهم ژن فاکتور IX بیماران انجام گرفت. نمونه هایی که در SSCP، حرکت آن روی ژل در مقایسه با کنترل نرمال متفاوت بود، انتخاب و به روش ختم زنجیره تعیین توالی شدند. توالی های به دست آمده با نرم افزارهای بایوادیت و کروماس تجزیه شدند. یافته ها: 70.8%جهش ها از نوع missense، 8.3 % جهش ها از نوع nonsense، 16.7% جهش ها از نوع deletion و 4.2% جهش ها از نوع insertion بودند. پلی مرفیسم مالمو در یک بیمار مشاهده شد. جهش های به دست آمده ناهمگن بوده و حدود نیمی از آن ها در اگزون 8 رخ داده بود که با نتایج موجود در بانک اطلاعاتی بیماران هموفیلی B مطابقت داشت. در طی این تحقیق 4 جهش جدید (C6460G, A17690C, C30857G, C31088G) به دست آمد که تاکنون گزارش نشده بود. نتیجه گیری: از این یافته ها می توان در تشکیل یک بانک اطلاعاتی کشوری و نیز مشاوره ژنتیک در خانواده های این بیماران استفاده کرد.