مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

مقاله مقاله نشریه

مشخصات مقاله

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

1,699
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

732
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

1

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

مقایسه نتایج خوشه بندی سلسله مراتبی و غیرسلسله مراتبی پروتئین های مرتبط با سرطان های مری، معده و کلون بر اساس تشابهات تفسیر هستی شناسی ژنی

صفحات

 صفحه شروع 17 | صفحه پایان 30

کلیدواژه

تفسیر هستی شناسی ژنی (Gene Ontology)Q3

چکیده

 مقدمه و هدف: به کارگیری روش های پروتئومیک و پیشرفت پژوهش های با توان بالای پروتئین ها زمینه ساز نیاز به روش های تازه در تحلیل های بیوانفورماتیک نتایج آزمایشگاهی شده است. تحلیل خوشه ای, روش آماری مناسبی است که می تواند در تحلیل این گونه داده ها, استفاده شود. هدف از این پژوهش, ارزیابی کارایی روش خوشه بندی فازی در تحلیل پروتئین های مرتبط با سرطان های دستگاه گوارش بوده است.مواد و روش ها: در این پژوهش, پروتئین های شناسایی شده مرتبط با سرطان های مری, معده و کلون با استفاده از روش های خوشه بندی سلسله مراتبی و غیرسلسله مراتبی تحلیل و بررسی شدند. بر اساس هر یک از ابعاد هستی شناسی ژنی, پروتئین ها را خوشه بندی کرده, نتایج را با یکدیگر مقایسه کردیم.یافته ها: نتایج به دست آمده نشان داد, عملکرد دو روش خوشه بندی سلسله مراتبی و تقسیم بندی به یکدیگر نزدیک بوده است. با وجود چشمگیر نبودن عرض سایه نمای کل خوشه بندی ها, بیشتر پروتئین های در هر خوشه, دارای اشتراکات بیولوژیکی قابل توجهی هستند. نتایج به دست آمده نشان می دهد, روش های خوشه بندی توانسته اند الگوهای تفسیری جدیدی را که قبل از خوشه بندی پروتئین ها مشخص نشده بودند, آشکار سازند.نتیجه گیری: با بررسی نتایج حاصل از خوشه بندی PAM و خوشه بندی سلسله مراتبی, مشخص شد, نتایج این دو خوشه بندی بسیار مشابه یکدیگر هستند. شاید بتوان گفت, روش PAM به دلیل معرفی نماینده ای برای هر خوشه, موشکافانه تر عمل کرده, در حالی که روش سلسله مراتبی ساده تر بوده است. همچنین به نظر می رسد, پروتئین هایی که بر اساس تشابهات جایگاه سلولی در کنار یکدیگر قرار می گیرند, دارای تشابهات بیولوژیکی و عملکردی نیز هستند که باید این مساله بیشتر بررسی شود.

استنادها

ارجاعات

  • ثبت نشده است.
  • استناددهی

    APA: کپی

    علوی مجد، حمید، زرنگارنیا، یلدا، رضایی طاویرانی، مصطفی، خادم معبودی، علی اکبر، و خیر، نصیبه. (1389). مقایسه نتایج خوشه بندی سلسله مراتبی و غیرسلسله مراتبی پروتئین های مرتبط با سرطان های مری, معده و کلون بر اساس تشابهات تفسیر هستی شناسی ژنی. دانشور پزشکی، 17(88)، 17-30. SID. https://sid.ir/paper/31181/fa

    Vancouver: کپی

    علوی مجد حمید، زرنگارنیا یلدا، رضایی طاویرانی مصطفی، خادم معبودی علی اکبر، خیر نصیبه. مقایسه نتایج خوشه بندی سلسله مراتبی و غیرسلسله مراتبی پروتئین های مرتبط با سرطان های مری, معده و کلون بر اساس تشابهات تفسیر هستی شناسی ژنی. دانشور پزشکی[Internet]. 1389؛17(88):17-30. Available from: https://sid.ir/paper/31181/fa

    IEEE: کپی

    حمید علوی مجد، یلدا زرنگارنیا، مصطفی رضایی طاویرانی، علی اکبر خادم معبودی، و نصیبه خیر، “مقایسه نتایج خوشه بندی سلسله مراتبی و غیرسلسله مراتبی پروتئین های مرتبط با سرطان های مری, معده و کلون بر اساس تشابهات تفسیر هستی شناسی ژنی،” دانشور پزشکی، vol. 17، no. 88، pp. 17–30، 1389، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/31181/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

    مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.
  • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.
  • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button