با پیشرفت تکنیک های ژنتیک مولکولی، امروزه تعیین نسب در موجودات و بررسی روند تکاملی آن ها از طریق ژنتیک مولکولی امکان پذیر است. توالی های تکراری کوتاه (STR) توالی های کوتاهی هستند که از چند شکلی بالایی برخوردارند و به همین جهت به عنوان ابزار قدرتمندی در تشخیص هویت کاربرد دارند. این توالی ها در مجموع 20 درصد از توالی پستانداران را تشکیل می دهند. هدف از تحقیق حاضر بررسی چهارده مارکر ژنتیکی AHT5, AHT4 ASB23, ASB17, ASB2, VHL20, CA425, HMS7, HMS6, HMS3, HMS1, HTG4, HTG10, LEX3 در اسب نژاد عرب و کاربرد آن ها در تعیین نسب این حیوان در استان چهارمحال و بختیاری می باشد. به منظور انجام این تحقیق، نمونه خون از 13 خانواده اسب نژاد عرب در سطح استان چهارمحال و بختیاری اخذ گردید و پس از استخراج DNA واکنش زنجیره ای پلیمراز چندگانه (Multiplex PCR) با استفاده از پرایمرهای اختصاصی برای چهارده مارکر ژنتیکی، تنظیم و محصولات PCR بدست آمده ابتدا بر روی ژل آگارز 1 درصد الکتروفورز و مشاهده گردیده سپس باقی مانده محصولات PCR به دست آمده بوسیله کیت ABI PRISM 3100 طبق دستور العمل کیت فورفامید و الکتروفورز گردید. قطغات بدست آمده توسط نرم افزار Ver.3.7 مورد آنالیز ژنتیکی قرار گرفتند تعداد آلل های مورد بررسی در این مطالعه بین 3تا 9 آلل در هر اسب عرب (میانگین6.36 ) متفاوت است میانگین پلی مورفیسم مشاهده شده در کل جمعیت مورد بررسی در حدود 7.01 و میانگین هموزیگوتی مورد انتظار در این مطالعه 0.697می باشد. همچنین میانگین هموزیگوتی مشاهده شده در این مطالعه 0.656 می باشد. از آنجا که مارکرهای ژنتیکی مذکور دارای چند شکلی ژنی در نژاد اسب های مختلف هستند، لذا به نظر می رسد، از این چهارده مارکر می توان در راستای شناخت و تعیین نسب اسب های نژاد عرب بهره برد.