در این تحقیق تعداد 9 ویروس نیوکاسل (NDV) جدا شده از مرغ داری های صنعتی ایران مورد مطالعه قرار گرفت. قطعه ای به طول 1349 نوکلئوتید که در برگیرنده جایگاه شکست پروتئین F ویروس می باشد با روش RT-PCR تکثیر و تعیین توالی گردید و اسیدهای آمینه پروتئین F ویروس های جدا شده در مقایسه با ویروس های قبلی ایران و سایر نقاط جهان مورد مطالعه فیلوژنتیکی قرار گرفتند. در این تحقیق تشابه 96.5-100 درصد بین 9 ویروس جدا شده از استان های مختلف مشاهده گردید. توالی نوکلئوتیدی قطعه مورد نظر با توالی کد کننده پروتئین F ویروس های نیوکاسل موجود در بانک ژن توسط نرم افزار blast مورد بررسی قرار گرفت و بیشترین تشابه نوکلئوتیدی با سویه های Italy/3286/00 و Sterna/astr گزارش شد. اسیدهای آمینه جایگاه شکست پروتئین F این ویروس ها کاملا مشابه و RRQRRF بوده و نسبت به ویروس های جدا شده قبلی ایران تغییری نشان نداد. ولی در 3 ویروس از 9 ویروس مورد مطالعه اسید آمینه موقعیت 265 از گلیسین به سرین تغییر کرده بود. در بررسی فیلوژنتیک همگی دارای منشا مشترک از ویروس های جدا شده قبلی ایران بوده و در یک دودمان مجزا به همرا ویروس های روسیه، ایتالیا، عراق، ترکیه، عربستان صعودی، کویت، قزاقزستان، لبنان، کره جنوبی، ژاپن و آفریقای جنوبی قرار گرفتند.