مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

video

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

sound

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

نسخه انگلیسی

مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

بازدید:

275
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

دانلود:

456
مرکز اطلاعات علمی Scientific Information Database (SID) - Trusted Source for Research and Academic Resources

استناد:

اطلاعات مقاله نشریه

عنوان

آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool تشنه داری (Scrophularia striata) بر پروتئین VacA هلیکوباکتر پیلوری

صفحات

 صفحه شروع 50 | صفحه پایان 64

چکیده

 مقدمه: برخی گیاهان ازجمله تشنه داری, به طور سنتی در میان مردم زاگرس نشین, به عنوان التیام بخش عفونت و زخم استفاده می شده است. در تحقیقات پیشین, اثر التیام بخشی عصاره آبی و هیدروالکلی آن بر استرس اکسیداتیو و درمان زخم معده ناشی از اتانول در موش صحرایی تایید شده است. بر اساس این, هدف از تحقیق حاضر, آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool (یکی از بیشترین اجزای تشنه داری) بر مهار پروتیین VacA هلیکوباکتر پیلوری است. مواد و روش ها: توالی های DNA و پروتیینی Linalool گیاه آرابیدوپسیس و توالی ژن VacA هلیکوباکتر پیلوری از سراچه NCBI تهیه شد. میزان هم ردیفی توالی های DNA و پروتیینی Linalool و VacA توسط نرم افزار Clustalw vol. 2 بررسی و موتیف های حفاظت شده با استفاده از برنامه MEME جستجو گردید. درخت فیلوژنی به وسیله نرم افزار MEGA vol. 5 ترسیم شد. برای تعیین ساختار سوم و همچنین داکینگ مولکولی بر اساس همولوژی, توسط نرم افزار Swiss-Model و ESYPred3D و همچنین Galaxy Web صورت گرفت. یافته های پژوهش: پروتیین های لینالول گزارش شده در سراچه NCBI, در بیشتر گیاهان, سه موتیف حفاظت شده (در محدوده 100 تا 300 اسید آمینه) دارد. پروتیین VacA هر سه نوع دومین سیتوپلاسمی, غشایی و کینازی را داراست. بهترین الگوی داکینگ مولکولی بر اساس بیشترین اثر متقابل میان پروتیین لینالول و پروتیین VacA (0/21) و بیشترین دقت (133/0) انتخاب شد. نتایج نشان داد که در ساختار هر دو پروتیین لینالول و VacA, گروه های گوناگونی ازجمله گروه های آلیفاتیک (چربی), قطبی و آب دوست داشت. حضور چربی و آب دوست بودن در پروتیین VacA, به آن این قابلیت را می دهد که بتواند در صورت تجزیه نشدن, توسط سلولی های لنفوسیت, به راحتی از غشای سلول ها عبور کند و سبب بیماری زایی شود. از سویی, حضور همین گروه ها در لینالول نیز عاملی است که توانسته است پروتیین VacA را مهار کند. بحث و نتیجه گیری: آنالیز بیوانفورماتیکی نشان داد که لینالول سبب از میان بردن آثار هلیکوباکتر پیلوری می شود؛ همچنین نتایج پژوهش حاضر می تواند به عنوان پایه ای برای تحقیقات آینده, برای ارزیابی تاثیر تک تک مواد موثر تشنه داری به ویژه لینالول, بر باکتری هلیکوباکتر پیلوری استفاده شوند.

استنادها

  • ثبت نشده است.

    • ارجاعات

  • ثبت نشده است.

    • استناددهی

    APA: کپی

    فاضلی نسب، بهمن. (1400). آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool تشنه داری (Scrophularia striata) بر پروتئین VacA هلیکوباکتر پیلوری. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام، 29(1 )، 50-64. SID. https://sid.ir/paper/950672/fa

    Vancouver: کپی

    فاضلی نسب بهمن. آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool تشنه داری (Scrophularia striata) بر پروتئین VacA هلیکوباکتر پیلوری. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام[Internet]. 1400؛29(1 ):50-64. Available from: https://sid.ir/paper/950672/fa

    IEEE: کپی

    بهمن فاضلی نسب، “آنالیز بیوانفورماتیکی تاثیر Linalool تشنه داری (Scrophularia striata) بر پروتئین VacA هلیکوباکتر پیلوری،” مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام، vol. 29، no. 1 ، pp. 50–64، 1400، [Online]. Available: https://sid.ir/paper/950672/fa

    مقالات مرتبط نشریه ای

  • ثبت نشده است.

    • مقالات مرتبط همایشی

  • ثبت نشده است.

    • طرح های مرتبط

  • ثبت نشده است.

    • کارگاه های پیشنهادی






    بازگشت به بالا
    telegram sharing button
    whatsapp sharing button
    linkedin sharing button
    twitter sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    email sharing button
    sharethis sharing button