زیست فناوری میکروبی
سال:1391 | دوره:4 | شماره:13 |تعداد مقالات:8

زمینه و هدف: عفونت سلول های T انسان با ویروس HTLV-1 (HumanT Lymphotropic Virus-1) باعث نامیرا شدن این سلول ها و بروز لوسمی سلول T بالغین(Adult T Cell Leukemia)  می شود. ترانسفورمیشن سلول های T، در مراحل اولیه توسط پروتئین Tax ویروسHTLV-1  صورت می گیرد. استان خراسان و بخصوص شهر مشهد یک منطقه اندمیک با شیوع حدود 5 در صد برای این ویروس می باشد. از پروتئین Tax در تهیه کیت های تشخیصی جهت غربالگری و نیز برای شناسایی آنتی بادی ضد Tax در سرم افراد آلوده می توان استفاده نمود. بنابراین هدف در این پروژه تهیه پروتئین Tax توسط تکنولوژی نوترکیب بوده است.روش بررسی: بعد از ترانسفورمیشن E.coli با پلاسمید حاوی ژن Tax برای اطمینان از ترانسفورمیشن واکنش PCR انجام شد. به منظور بیان پروتئین tax در باکتری باکتری های ترانسفرم شده بر روی محیط کشت LB کشت داده شد و سپس پروتئین تولیدشده با سولفات آمونیوم رسوب داده شد. جهت خالص سازی پروتئین از ایمونوافینیتی کروماتوگرافی و جهت بررسی خلوص از رنگ آمیزی نیترات نقره ودات بلات استفاده شد.یافته ها: نتیجه واکنش  PCRکه با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن tax صورت گرفته بود دلالت بر ترانسفرم شدن باکتری ها داشت. همچنین نتایج حاصل از رنگ آمیزی با نیترات نقره ودات بلات نشانگر بیان پروتئینTax  در باکتری و تخلیص آن توسط افینیتی کروماتوگرافی بودند.نتیجه گیری: نتایج نشان می دهند گرچه تولید پروتئین Tax بوسیله این روش صورت گرفته اما میزان پروتئین تولید شده کم بوده است.

زمینه و هدف: جلبک های سیمبیودینیوم یکی از جنس های جلبک های تک سلولی دو تاژکی هستند که قادر به همزیستی با اغلب بی مهرگان دریایی همچون مرجان ها می باشند و به صورت آزاد نیز در ستون آب دریا وجود دارند. تاکنون 11 گونه از این جنس بر مبنای خصوصیات مورفولوژیک شناسایی شده است. از آنجا که خصوصیات مورفولوژیک این گونه ها با عملکرد فیزیولوژیک آن ها انطباق ندارد، لذا از روش های مولکولی برای شناسایی این جلبک تک سلولی استفاده شده و بر این اساس 9 کلاد سیمبیودینیوم شناسایی و به ترتیب از A تا I نام گذاری شده است.روش بررسی: از دو گونه مرجان (3 کلنی، 3 تکرار) و آب دریا در جزیره لارک نمونه برداری شد و استخراج DNA جلبک های آن ها انجام و با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز، قطعه DNA هسته ای ریبوزومی Internal Transcribed Spacer 2 تکثیر و تعیین ترادف ژنی انجام پذیرفت.یافته ها: سیمبیودینیوم آزاد زی در ستون آب و همزیست با مرجان ها از نوع کلاد A می باشد.نتیجه گیری: کلاد A برای اولین بار از بخش شمالی خلیج فارس گزارش می شود. تاکنون تنها کلاد D از جزیره لارک گزارش شده بود. از آنجا که کلاد D مقاوم به شرایط نامساعد محیط است، به نظر می رسد که جزیره لارک بعلت قرار گرفتن در منطقه بین خلیج فارس و دریای عمان تحت تاثیر شرایط اقیانوسی یعنی شوری و درجه حرارت کمتر نسبت به خلیج فارس قرار گرفته و شرایط مساعدتری برای حضور این کلاد ایجاد شده است.

زمینه و هدف: آلاینده های هیدروکربنی نفتی و فرآورده های آن ها در طبیعت با روند بسیار کندی تجزیه می شود. با فراهم نمودن شرایط بهینه رشد میکروارگانیسم های دخیل در تجزیه آلاینده های نفتی می توان فرآیند پاکسازی محیط های آلوده را بطور موثری افزایش داد. هدف از این تحقیق جداسازی باکتری تجزیه کننده نفت خام به منظور استفاده در تجزیه زیستی این مواد در مناطق آلوده بود.روش بررسی: در راستای رسیدن به این هدف نمونه برداری از خاک های آلوده به نفت انجام شد و پس از جداسازی باکتری، شناسایی آن به روش های بیوشیمیایی و فیلوژنتیک Abt1 نامگذاری شد. سپس آزمایشات مربوط به توانایی نفت خواری سویه خالص شده در شرایط مختلف بررسی شد.یافته ها: نتایج تست های بیوشیمیایی و آنالیز فیلوژنی نشان داد که این باکتری 100 درصد به جنس پلانوکوکوس (Accession GU213131) شباهت دارد. این سویه قادر بود pH بین 5 تا 8 و نمک صفر تا 7 درصد را تحمل کند. شرایط بهینه برای تجزیه زیستی نفت خام توسط Abt1 شامل pH برابر 7.5 در دمای 30±2 °C در پایین ترین مقدار نمک بود. همچنین کمترین مقدار نیتروژن و فسفات مورد نیاز جهت تجزیه 1 گرم نفت خام برابر با 0.292 گرم آمونیوم کلراید و 0.036 گرم دی سدیم هیدروژن فسفات بود.نتیجه گیری: این سویه در شرایط بهینه تعیین شده قادر بود که در مدت 12 روز نفت خام موجود را بطور کامل مصرف کند. مقاوم به نمک بودن این سویه بومی بدلیل تفاوت غلظت نمک مناطق آلوده به یک مزیت محسوب می شود. بنابراین برای حذف آلودگی های ایجاد شده استفاده از این باکتری بومی کارایی روند تصفیه را به میزان مطلوبی بالا می رود.

لطفا برای مشاهده چکیده به متن کامل (pdf) مراجعه فرمایید.

زمینه و هدف: عفونت های دستگاه ادراری یکی از شایع ترین بیماری های عفونی است که اشریشیا کلی مهم ترین عامل ایجاد کننده این عفونت هاست. آنالیزهای فیلوژنتیکی نشان داده است که سویه های اشریشیا کلی در چهار گروه فیلوژنتیک (A، B1، B2 و D) تقسیم می شوند. هدف از این پژوهش تعیین گروه های فیلوژنتیک اشریشیا کلی های جداشده از عفونت های ادراری بود.روش بررسی: این مطالعه بر روی اشریشیا کلی های جداشده از کشت ادرار بیماران مشکوک به عفونت ادراری انجام شد. از آزمون های بیوشیمیایی و میکروبی جهت تعیین هویت باکتری های جداشده استفاده شد. طبقه بندی گروه های فیلوژنتیک سویه های اشریشیا کلی با استفاده از تکنیک Multiplex PCR دو ژن ( chuAوyjaA ) و یک قطعه از (TSPE4 .C2) DNA انجام شد. بعد از الکتروفورز، سویه ها بر اساس حضور یا عدم حضور ژن ها و قطعه DNA در گروه های فیلوژنتیک قرار گرفتند.یافته ها: از 100 سویه اشریشیا کلی شناسایی شده، شایع ترین گروه های فیلوژنتیک شناسایی شده (%65) B2، (%19) D و (%16) A بودند. اما در هیچ کدام از نمونه های مورد بررسی گروه B1 شناسایی نشد. بر طبق یافته های این تحقیق سویه های بیماری زای خارج روده ای اشریشیا کلی جداشده از عفونت های دستگاه ادراری بیشتر متعلق به گروه فیلوژنتیک B2 بودند.نتیجه گیری: نتایج نشان داد که روش مولکولی فیلوژنتیک تایپینگ بر پایه PCR ژن ها و قطعه DNA روشی ساده و سریع در تایپینگ سویه های اشریشیا کلی است. همچنین این تکنیک جهت کسب اطلاعات بیشتر راجع به پاتوژنز عفونت ها، کنترل عفونت های بیمارستانی و مطالعات اپیدمیولوژیکی کاربرد دارد.

زمینه و هدف: با توجه به رشد روزافزون تقاضا برای منابع روغنی قابل تبدیل به بیودیزل، تلاش های زیادی در زمینه یافتن منابع روغنی میکروبی انجام پذیرفته است. این روغن ها مشابه روغن های گیاهی بوده و در صورت استفاده از سوبسترای ارزان قیمت، از نظر اقتصادی نیز مقرون به صرفه هستند. امروزه توجه زیادی به استفاده از ضایعات کشاورزی به عنوان سوبسترای تولید روغن میکروبی شده است. در این بین ضایعات زیست محیطی نظیر چمن به دست آمده از فضاهای سبز، قابلیت تبدیل به مواد با ارزش از نظر اقتصادی را دارد.روش بررسی: در این پژوهش با استفاده از یکی از روش های طراحی آزمایش ها تحت عنوان روش تاگوچی به بهینه سازی پارامترهای مرتبط با استفاده از چمن به عنوان سوبسترا پرداخته شد تا بیشترین میزان تولید لیپید به دست آید. بررسی لیپید تولیدشده با کمک روش کروماتوگرافی گازی - اسپکترومتری توده ای (GC-MS) صورت گرفت.یافته ها: پس از بهینه سازی شرایط تخمیر و هیدرولیز اسیدی سوبسترا بیشترین میزان تولید لیپید و محتوای لیپیدی معادل 6.8 g/L، %55 (درصد لیپید به بیومس مخمری) به دست آمد و بازده تولید بیودیزل نسبت به سوبسترای مصرف شده معادل %79 بود. بیشترین اسیدهای چرب تولیدشده شامل پالمیتیک اسید و اولئیک اسید به میزان %18.51 و %67.29 بودند.نتیجه گیری: از یافته های حاصل از این پژوهش می توان دریافت که با استفاده از مخمرهای مولد چربی می توان ضایعات زیست محیطی را به مواد با ارزش تبدیل کرد. همچنین ترکیب به دست آمده از روغن استخراج شده قابلیت تبدیل آن به بیودیزل را نشان می دهد.

لطفا برای مشاهده چکیده به متن کامل (pdf) مراجعه فرمایید.

لطفا برای مشاهده چکیده به متن کامل (pdf) مراجعه فرمایید.