مایکوباکتریوم اوویوم تحت گونه پاراتوبرکلوزیس عامل بیماری یون گاوی است که به عنوان یک بیماری های عفونی مزمن محسوب می شود. نکته مهم از نظر بهداشت مواد غذایی، نقش احتمالی این باکتری در ایجاد بیماری کرون در انسان می باشد. شیوع بالای آلودگی با این باکتری در گاوهای شیری در سرتاسر جهان گزارش شده است. در این ارتباط تشخیص باکتری مذکور در شیر دام های سالم و مشکوک به آلودگی از مهم ترین اقدامات جهت جلوگیری از گسترش عفونت محسوب می شود. کشت در محیط اختصاصی به عنوان روش مرجع برای تشخیص این باکتری می باشد. اما در عین حال، روش PCR با شناسایی میکروارگانیسم های کند رشد نظیر مایکوباکتریوم اوویوم تحت گونه پاراتوبرکلوزیس، این امکان را فراهم می کند تا در زمان بسیار کوتاه بتوان از این روش به عنوان یک آزمایش تشخیصی با حساسیت بالا استفاده کرد. لذا در پژوهش حاضر، آزمایش های کشت و PCR بر روی نمونه های خامه و رسوب شیر 160 راس گاو شیری به ظاهر سالم، انجام گردید. با بررسی یافته های حاصله بر اساس آزمون آماری کاپا مشاهده گردید، توافق بین کشت و PCR با محصول 400 bp تقریبا کامل، توافق بین کشت و PCR با محصول228 bp اساسی و توافق بین دو آزمایش PCR با محصولات متفاوت ذکر شده هم اساسی برآورد گردید. در نهایت با مقایسه توافق بین دو آزمایش PCR استفاده شده در این پژوهش با روش کشت اختصاصی به عنوان آزمایش استاندارد طلایی تشخیص باکتری مذکور در نمونه ها، می توان اعلام کرد که آزمایش PCR می تواند به عنوان یک روش سریع و دقیق جایگزینی مناسب به جای روش های متداول در تشخیص مایکوباکتریوم اوویوم تحت گونه پاراتوبرکلوزیس علی الخصوص به عنوان یک آزمایش غربالگری در مورد نمونه شیر گاوها مطرح شود.